초록 ▼

□ 연구개요
최근 국내 멧돼지 개체군에 확산 중인 아프리카돼지열병(ASF)의 효율적인 관리를 위해 우리나라 멧돼지 개체군의 유전적 구조 및 개체군간 유전자 흐름을 ddRADseq 기법과 GIS를 융합한 경관유전체학 기법을 이용하여 분석

□ 연구 목표대비 연구결과
지역별 멧돼지 시료확보는 전국 134개 시군구에서 1,986개체의 멧돼지에서 DNA 추출을 위한 조직확보를 통해 목표 달성
확보된 DNA를 유전체 분석기법인 ddRADseq으로 분석하여 library prep을 완성 후 NGS (illumina

□ 연구개요
최근 국내 멧돼지 개체군에 확산 중인 아프리카돼지열병(ASF)의 효율적인 관리를 위해 우리나라 멧돼지 개체군의 유전적 구조 및 개체군간 유전자 흐름을 ddRADseq 기법과 GIS를 융합한 경관유전체학 기법을 이용하여 분석

□ 연구 목표대비 연구결과
지역별 멧돼지 시료확보는 전국 134개 시군구에서 1,986개체의 멧돼지에서 DNA 추출을 위한 조직확보를 통해 목표 달성
확보된 DNA를 유전체 분석기법인 ddRADseq으로 분석하여 library prep을 완성 후 NGS (illumina Hiseq)를 활용하여 최대 21,822,133 reads가 생성되어 최대3,295,142,083bp확인으로 목표 달성
ddRADseq결과로부터 총 30,775개의 SNPs분리 후 HWE와 LD에서 벗어나는 SNPs을 제거하여 최종 613 SNPs선별로 분자마커 스크리닝 목표 달성
선별된 SNP marker를 이용하여 유전적 다양도 지수 확인을 통해 개체군 단위의 유전 다양성 분석 목표 달성
선별된 SNP marker를 활용하여 ABC분석을 통해 개체군의 진화적 역사를 추정하여 분포 패턴에 적용 분석 목표 달성
GIS를 활용하여 추출한 경관요소와 Fst를 간의 상관관계를 MLPE분석을 통해 모형 생산 후 AIC에 따라 최적모형을 선별하여 경관유전체학 모델링 목표 달성

□ 연구개발성과의 활용 계획 및기대효과(연구개발결과의중요성)
우리나라 멧돼지 개체군은 뚜렷한 유전적 장벽이 없어 현재 확산중인 ASF외에 CSF나 구제역 등의 질병이 유입시 지리적 경계없이 크게 확산될 수 있음을 시사
현재 ASF의 확산 방지를 위해 펜스 등의 차단시설이 설치되고 있으나 기존의 도로 등의 경관적 barrier를 이용하여 차단시설을 대신할 수 있음.
본 연구를 통해 파악된 경관요인을 이용하여 자연적 확산을 방지하는 한편, 일부 ASF의 확산의 원인은 자연스러운 멧돼지의 이동이 아닌 인위적인 요인이 관여했음의 증거
본 연구결과를 바탕으로 ASF등의 질병매개체로의 멧돼지의 확산 방지를 위한 기초 자료로 활용하는 동시에 유해조수 구제 사업에의 효율적인 이용이 가능

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1) 연구 개발의 목적 ... 4
• 2) 연구 개발의 필요성 ... 4
• 3) 연구 가설 ... 4
• 4) 최종목표 ... 5
• 5) 연구범위 ... 5
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 멧돼지 genomic DNA추출 및 개체군 선별 ... 5
• 2) ddRAD 라이브러리 제작 ... 5
• 3) SNP 마커 분리 및 개체군 유전체 분석 ... 6
• 4) Source-Sink 파악을 위한 ABC 모델 분석 ... 7
• 5) 경관유전학적 분석 ... 8
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 8
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 8
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 3) 목표 달성 수준 ... 12
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 13
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 참고문헌 ... 14
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 15
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 17
• 끝페이지 ... 27