초록 ▼

□ 연구개요
돼지의 근육성장과 지방축적과 관련된 핵심기전을 이해하고 주요인자를 발굴하는 것은 산업적 측면에서 생산성 증대기술을 개발하는데 중요하고, 근육성장과 지방 축적은 각 생애 단계에 따라서 별도의 대사과정에 따라서 구성되어지고 관련 유전인자 또한 구분되어 분류됨.
이 두 생리대사적 특성에 따라서 전체 성장특성이 결정되어지고 생산성과 이후 육질특성 등이 형성되므로 동시에 이 둘을 고려한 종합대사기전을 체계적으로 이해하기 위한 연구가 필요함.

□ 연구 목표대비 연구결과
⦁ 1차년도: 돼지 교배조합에 따

□ 연구개요
돼지의 근육성장과 지방축적과 관련된 핵심기전을 이해하고 주요인자를 발굴하는 것은 산업적 측면에서 생산성 증대기술을 개발하는데 중요하고, 근육성장과 지방 축적은 각 생애 단계에 따라서 별도의 대사과정에 따라서 구성되어지고 관련 유전인자 또한 구분되어 분류됨.
이 두 생리대사적 특성에 따라서 전체 성장특성이 결정되어지고 생산성과 이후 육질특성 등이 형성되므로 동시에 이 둘을 고려한 종합대사기전을 체계적으로 이해하기 위한 연구가 필요함.

□ 연구 목표대비 연구결과
⦁ 1차년도: 돼지 교배조합에 따른 자돈생산 및 근육·지방관련 생체조직시료 확보
- 육질이 우수한 한국재래돼지(KNP)와 높은 성장속도를 가진 상업종 요크셔(Yorkshire)를 이용하여 교차교배돼지를 생성
- 생애 단계별에 대한 성별의 비율과 교차교배 돼지종의 비율을 동일하게 무작위로 두 그룹(이유기-10주령/출하기-26주령)으로 설정
- 조직을 채취할 시에 동물을 희생시켜 RNA-seq과 MBD-seq 분석을 위한 조직 시료(심장근, 등심근, 등지방, 복강지방, 간)을 채취
⦁ 2차년도: NGS 기능유전체 데이터 양산 및 통합 오믹스 분석에 용이한 Integrate-PCIT 개발
- 차세대염기서열분석기법(NGS)을 이용 후성유전학 변화 관찰을 위한 전사체(Transcriptome)와 메틸화체(Methylome) 데이터 양산
- Gene co-expression network(GCN)을 기반하여 직간접적 연관성의 오류를 보정해주는 PCIT 알고리즘 적합성 검토
- 통합 오믹스데이터 분석에 적합한 PCIT 알고리즘 코드의 경량화 및 서브 패키지 매트릭스 적용을 통한 I-PCIT 개발
⦁ 3차년도: 전사체·후성유전체 통합분석 및 유의적 후성발현유전자간 상호발현네트워크 구축과 후성발현유전자를 중심으로 한 in silico 바이오시스템 구현을 통한 조직별 핵심기작 구명
- RNA-seq 전사체 데이터를 이용한 차등발현유전자(DEG) 프로파일링 및 DEG 기능 분석
- MBD-seq 메틸화체 데이터를 이용한 binning size별 DMR 프로파일 및 메틸화 비율 비교 및 유전자 주석화
- 각 조건(2 factor: R², FC)에 따른 serial 네트워크 구축 및 상호작용 확인
- 조직별 최적 네트워크 선발 및 근육발달 및 지방대사관련 조직별 핵심기전 구명을 통한 후성발현핵심유전자 발굴

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
기존 연구들에서 돼지집단을 이용한 일반적인 유전현상 연구 및 DNA 마커 발굴 등의 기초연구 및 유전자 발현패턴에 따른 기능연구 등은 단편적이고 지엽적인 연구에 국한되어 왔으나, NGS 분석기술을 이용한 대용량 유전체 데이터를 이용한 생물정보학 및 시스템 생물학 연구를 통해 돼지의 근육성장과 지방축적을 아우르는 종합대사기전을 체계적으로 이해할 수 있다. 이를 통해 주요인자 발굴을 통해 산업적 측면에서 생산성 증대기술을 개발 할 수 있을 뿐만 아니라, 각종 성인병으로 연결되어 질 수 있는 비만관련 연구와 연계하여 동물 모델 및 산업적 응용면에서 의미있는 학술 정보를 제공할 수 있다.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 11
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 11
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 11
• 3) 목표 달성 수준 ... 11
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 11
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 12
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 12
• 6. 참고문헌 ... 13
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 14
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 16
• 끝페이지 ... 22