초록 ▼

□ 연구개발 목표
최근 들어 tRNA의 발현 및 그 조절은 단백질 번역 과정 외에 다양한 분자생물학적 과정에 영향을 주는 것으로 알려지고 있으나, tRNA의 차등 발현 분석을 위한 데이터는 충분하지 않은 상황이다. 본 연구과제는 포스트게놈다부처유전체사업에서 생산된 유전체 정보 중 miRNA 분석을 위해 생성되고 저장되어 있는 NGS 기반 small RNA 시퀀싱 데이터를 활용하여, 해당 종류의 데이터로부터 tRNA 발현량 프로파일링을 하는 기법을 웹서비스 등으로 개발하고 공개하며, 해당 방법론을 활용하여 기존에 발굴하지 못하였

□ 연구개발 목표
최근 들어 tRNA의 발현 및 그 조절은 단백질 번역 과정 외에 다양한 분자생물학적 과정에 영향을 주는 것으로 알려지고 있으나, tRNA의 차등 발현 분석을 위한 데이터는 충분하지 않은 상황이다. 본 연구과제는 포스트게놈다부처유전체사업에서 생산된 유전체 정보 중 miRNA 분석을 위해 생성되고 저장되어 있는 NGS 기반 small RNA 시퀀싱 데이터를 활용하여, 해당 종류의 데이터로부터 tRNA 발현량 프로파일링을 하는 기법을 웹서비스 등으로 개발하고 공개하며, 해당 방법론을 활용하여 기존에 발굴하지 못하였던 차등발현 tRNA 등을 발굴하는 것을 목표로 한다.

□ 연구개발 내용
- 유전체 내 tRNA 유전자 구조 정보 수집 및 확립
- smRNA-seq 데이터로부터 tRNA read count 계산 및 효율적 알고리즘 개발
- 차등 발현 tRNA 발굴을 위한 파이프라인 개발
- smRNA-seq 데이터 기반 tRNA 발현 프로파일과 mRNA 발현의 통합 분석을 통해 tRNA-miRNA-mRNA 간 co-expression 관계 발굴 및 관련 파이프라인 개발
- 차등 발현 tRNA 및 mRNA 통합 분석을 통해 아미노산 운반 외의 tRNA의 분자생물학적 기능 예측 및 관련 파이프라인 개발

□ 활용계획 및 기대효과(응용분야 및 활용범위 포함)
- miRNA 분석을 위해 기존에 수행된 smRNA-seq 데이터를 원래 목적 외 tRNA 분석에 활용
- 구축될 파이프라인은 소스 코드 수준에서 공개하여 국내외 연구자들이 자유롭게 활용될 수 있도록 할 예정
- 아직은 국내에서 큰 관심을 받지 못하는 tRNA 발현 프로파일을 활용한 연구가 활성화 될 수 있는 기반 마련
- tRNA 외 기타 ncRNA 프로파일링 연구에 유사 파이프라인 적용 가능
- mRNA 기반 전사체와 단백체 사이의 상관관계를 이해하고 분석하는 데에 활용 가능

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요 약 문 ... 2
• 목차 ... 4
• 1. 연구개발 목표 및 평가항목별 성과 ... 5
• 1-1. 연구개발 목표 ... 5
• 1-2. 평가항목별 성과 ... 5
• 1-3. 목표 미달 시 원인 분석 ... 6
• 1-4. 연구개발 목표 및 주요내용 변경사항 ... 6
• 2. 추진내용 및 연구개발결과 ... 7
• 2-1. 추진내용 및 연구개발결과 ... 7
• 2-2. 추진 일정 실적 ... 18
• 2-3. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여정도 ... 19
• 2-4. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 19
• 3. 연구 개발 결과의 활용 방안 ... 20
• 끝페이지 ... 21