초록 ▼

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
본 연구에서는 단일세포 데이터의 개인 간 이질성을 제거한 범종양 시그니처를 클러스터링 분석으로 정의하여 종양 악성화와 관련된 암세포 특이적인 시그니처를 발굴함.
○ 전체 내용
본 연구를 통하여 1) 단일 세포 수준에서 범 종양적 유사도에 기반을 둔 클러스터링 파이프라인을 구축하며, 이를 바탕으로 만들어진 종양 클러스터 중 2) 임상적 연관성이 있는 프로그램을 발굴함. 또한 3) 다수의 암 종에서 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램을 정의함.

□ 연구개

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
본 연구에서는 단일세포 데이터의 개인 간 이질성을 제거한 범종양 시그니처를 클러스터링 분석으로 정의하여 종양 악성화와 관련된 암세포 특이적인 시그니처를 발굴함.
○ 전체 내용
본 연구를 통하여 1) 단일 세포 수준에서 범 종양적 유사도에 기반을 둔 클러스터링 파이프라인을 구축하며, 이를 바탕으로 만들어진 종양 클러스터 중 2) 임상적 연관성이 있는 프로그램을 발굴함. 또한 3) 다수의 암 종에서 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램을 정의함.

□ 연구개발성과
1) 종양 단일세포 클러스터링 파이프라인 구축
▷ 단일세포 분석의 특징 선별 (feature selection) 과정 중 측정하는 유전자 발현 분산(variance)의 정규화 (normalization)로 개인 간 이질성이 보정된 특징적인 유전자(highly variable genes, HVGs)를 선별함.
▷ 새롭게 정의된 HVGs를 사용하여 환자 특이적인 클러스터 형성을 억제하고 전사체 수준의 유사도에 따른 종양 클러스터를 생성함.
2) 임상적 연관성을 보이는 프로그램 발굴
▷ 대규모 종양 데이터베이스 TCGA의 동일 종양 데이터 분석으로 환자의 생존에 영향을 주는 종양 세포 특이적인 시그니처 프로그램을 정의함.
▷ 대장암에서 환자의 생존률과 높은 상관관계를 보이는 유사간충직세포(mesenchymal-like)를 발굴함.
3) 공통/특이적인 종양 시그니처 프로그램 정의
▷ 여러 종양 데이터의 벤치마크 분석으로 환자 특이적 클러스터 형성이 억제되는 것을 확인함.
▷ 대장암과 폐암에서 발굴한 시그니처를 비교하여 두 종양에서 공유되는 세포 증식과 유사간충직 프로그램, 그리고 각 종양에서 특이적인 프로그램을 확인함.

□ 연구개발성과 활용계획 및 기대 효과
종양 세포 특이적 악성 마커를 발굴
▷ 기존 벌크 시퀀싱 데이터에서 확보할 수 없었던 높은 특이성을 바탕으로 새로운 약물 타겟 후보를 제안할 수 있음.
▷ 종양세포 특이적인 악성화 신호를 바탕으로 위험 환자군을 정확하게 구분할 수 있을 것으로 기대함.

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요 약 문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1. 단일세포 종양 클러스터링 파이프라인 구축 ... 4
• 2. 단일세포 수준에서 종양 시그니처 프로그램 발굴 및 임상적 연관성 파악 ... 4
• 3. 벤치마크 분석 및 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램 정의 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 1. 단일세포 종양 클러스터링 파이프라인 구축 (1차년도) ... 4
• 2. 단일세포 수준에서 종양 시그니처 프로그램 발굴 및 임상적 연관성 파악 (1-2차년도) ... 5
• 3. 벤치마크 분석 및 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램 정의 (2차년도) ... 6
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 정도 ... 6
• 1) 연구수행 결과 ... 6
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도 ... 9
• 1. 단일세포 종양 클러스터링 파이프라인 구축 ... 9
• 2. 단일세포 수준에서 종양 시그니처 프로그램 발굴 및 임상적 연관성 파악 ... 9
• 3. 벤치마크 분석 및 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램 정의 ... 10
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 10
• 1. 단일세포 종양 클러스터링 파이프라인 구축 ... 10
• 2. 단일세포 수준에서 종양 시그니처 프로그램 발굴 및 임상적 연관성 파악 ... 10
• 3. 벤치마크 분석 및 공통/특이적으로 나타나는 시그니처 프로그램 정의 ... 10
• 6. 참고문헌 ... 10
• 끝페이지 ... 11