초록 ▼

연구개요
소세포폐암의 주요 전사인자인 NeuroD1에 의해 조절되는 유전자를 발굴하고 소세포폐암의 암화과정에서의 작용 기전 연구를 통해 신규 바이오마커 및 치료타겟을 발굴하고자 함.
· 소세포폐암 세포주에서 ChIP-seq과 RNA-seq의 integrated 분석을 통해 NeuroD1에 의해 조절되는 후보 유전자 발굴
· 발굴된 후보 유전자의 통합분석 (Gene ontology, KEGG, PIP network)을 통한 최종 타겟 유전자 선정
· 타겟 유전자의 소세포폐암의 암화과정에서의 기전을 규명하고 연관

연구개요
소세포폐암의 주요 전사인자인 NeuroD1에 의해 조절되는 유전자를 발굴하고 소세포폐암의 암화과정에서의 작용 기전 연구를 통해 신규 바이오마커 및 치료타겟을 발굴하고자 함.
· 소세포폐암 세포주에서 ChIP-seq과 RNA-seq의 integrated 분석을 통해 NeuroD1에 의해 조절되는 후보 유전자 발굴
· 발굴된 후보 유전자의 통합분석 (Gene ontology, KEGG, PIP network)을 통한 최종 타겟 유전자 선정
· 타겟 유전자의 소세포폐암의 암화과정에서의 기전을 규명하고 연관연구를 통한 진단용 바이오 마커로서의 임상유용성 평가

연구 목표대비 연구결과
· 임상 코호트 확보 및 IRB 승인 – 환자 증례수 확보 및 IRB 승인 완료
· NeuroD1에 의해 조절되는 유전자 탐색 및 발굴
- NeuroD1 High 소세포폐암 세포주에서 shRNA를 이용해 NeuroD1을 knock-down시켜 ChIP-seq을 수행하여 NeuroD1과 H3K4me3 결합 지역 발굴
- NeuroD1을 knock-down 시킨후 RNA-seq을 수행하여 DEG 분석
- ChIP-seq & RNA-seq 통합분석 결과 136개의 NeuroD1 타겟 후보 유전자 발굴
· 발굴된 후보 유전자의 통합 DB 분석을 통한 타겟 유전자 선정
- NeuroD1 타겟 후보 유전자의 GO enrichment, KEGG pathway 분석을 수행하여 NeuroD1에 조절되는 유전자들이 lipid metabolism pathway와 관련 있음
- 기전연구를 통해 NeuroD1이 LKB1/AMPK, mToR signaling pathway를 조절함을 확인
· 소세포폐암의 예후, 치료효과 연관성 분석
- NeuroD1 binding region에 위치하는 유전자 중 promoter 특이 지역에 존재하는 유전자의 다형성 230개 선정
- 소세포폐암 환자 261명에 대한 연관성 분석 수행 결과 약물반응과 술후 예후 예측 다형성 2개 발굴
· 진단마커로서의 유전체 변이 기능 분석 및 NeuroD1 타겟 유전자의 기전연구
- ChIP-qPCR, Luciferase reporter assay를 통한 다형성의 기능 확인
- 타겟유전자의 세포증식, 이동 or 침투능력 및 콜로니 형성에 미치는 영향 확인

연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
· 소세포폐암의 분자생물학적 기전 규명의 단서 마련
· 소세포폐암의 새로운 진단마커로 사용되어 소세포폐암의 치료효과 및 예후 예측 등에 적용할 수 있을 것임.
· 소세포폐암의 새로운 진단마커로 사용되어 소세포폐암의 조기 진단 등에 적용할 수 있을 것임.
· 소세포폐암 치료를 위한 신규 타겟 유전자를 제공하여 표적치료제가 없고 항암치료 후에 재발률이 높은 소세포폐암 환자들의 고통을 줄이고 생존율을 높일 수 있어 소세포폐암으로 인한 사회적 비용을 최소화하는 데 큰 역할을 할 것임.

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1) 연구개발의 목적 및 필요성 ... 4
• 2) 최종목표 ... 5
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 소세포폐암에서 NeuroD1에 의해 조절되는 유전자 발굴 ... 5
• 2) NeuroD1 타겟 유전자 선정 및 연관연구 ... 5
• 3) 소세포폐암 타겟 유전자의 기능/기전연구 및 임상 유용성 검증 ... 5
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 6
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 6
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 13
• 3) 목표 달성 수준 ... 13
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 13
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 13
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 자체점검표 ... 14
• 7. 참고문헌 ... 14
• 붙임1. 세부 정량적 연구개발성과 ... 15
• 붙임2. 연구책임자 대표적 연구실적 및 증빙(요약문 및 사본) ... 16
• 끝페이지 ... 19