초록 ▼

□ 연구개요
위 질환 환자의 다양한 검체 내 세균과 세균 유래 EV 분석을 통해 위암화 과정에 따른 마이크로바이옴의 변화를 확인하고, 검체 간 마이크로바이옴 변화의 연관성을 분석하여 위암 진단의 바이오마커를 발굴함.
● 위암화 진행 과정의 각 단계 환자 검체를 이용해 16S rRNA 유전자 염기서열 분석, 마이크로바이옴의 다양성 및 조성에 어떠한 차이가 있는지를 비교 분석
● 위암화 단계별 환자군 마이크로바이옴 분석을 통해 위암화 과정과 연관이 있는 후보 바이오마커 균주를 발굴함
● 기존 모집 및 신규 모집 검

□ 연구개요
위 질환 환자의 다양한 검체 내 세균과 세균 유래 EV 분석을 통해 위암화 과정에 따른 마이크로바이옴의 변화를 확인하고, 검체 간 마이크로바이옴 변화의 연관성을 분석하여 위암 진단의 바이오마커를 발굴함.
● 위암화 진행 과정의 각 단계 환자 검체를 이용해 16S rRNA 유전자 염기서열 분석, 마이크로바이옴의 다양성 및 조성에 어떠한 차이가 있는지를 비교 분석
● 위암화 단계별 환자군 마이크로바이옴 분석을 통해 위암화 과정과 연관이 있는 후보 바이오마커 균주를 발굴함
● 기존 모집 및 신규 모집 검체를 대상으로 후보 바이오마커의 재현성을 검증함
● 구체적 마이크로로바이옴 변화가 위암화 과정에 어떠한 기능적 영향을 갖는지를 규명하기 위해, 위액 내 마이크로바이옴 분석을 통해 발굴한 미생물의 기능적 분석 시행함

□ 연구 목표대비 연구결과
1. 위암화 단계별 위 질환 환자 검체의 메타게놈 분석 및 바이오마커 발굴
● 위 질환 환자 (저/고도 위선종, 위암)의 검체(위액, 혈액, 소변, 타액)로부터 EV 분리 방법 구축
● 위 질환 환자 검체 (위액, 혈액,소변, 타액, 위 조직)로부터 세균 및 분리 된 EV DNA 추출 후 마이크로바이옴의 메타게놈 분석 결과 도출
● 대조군 및 위선종, 위암 환자군 각각에서 검체별로 마이크로바이옴의 구성에 차이가 있는지 alpha, beta diversity 분석 결과 도출
● 정상 대조군 대비 위암 단계별 질환군에서 relative abundance에 유의한 차이를 보이는 세균 도출을 통한 후보 바이오마커 도출

2. 위암화 단계별 발굴한 바이오마커의 기능적 분석 및 위암화 기전 연구
● 마이크로바이옴의 기능 예측 프로그램 (Tax4Fun2) 분석을 이용하여 선정된 바이오마커의 기능적 평가를 추가로 시행 결과 도출
● 후보 바이오마커의 모체 균주를 이용한 위암 발생에 관여하는 기전 확인 분석 중

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
● 위암과 인체 여러 신체 기관 내 미생물군집의 연관성에 대한 이해를 도모하여 위암의 병태생리를 밝히는 기초 연구 발전에 기여
● 위암 발생 병태생리와 연관된 미생물군집의 새로운 이해와 다양한 데이터베이스 확보로 위암 관련 새로운 분석방법 제시
● 비침습적 진단 마커의 발굴을 통한 위암 스크리닝 방식 변화 기여
● 비침습적 진단 마커의 발굴로 위암 스크리닝 비용과 사회 경제적 부담 감소

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1) 연구개발과제의 목적 및 필요성 ... 4
• 2) 연구 개발의 범위 ... 5
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 5
• 1) 위암화 단계별 위 질환 환자 검체 확보 ... 5
• 2) 위질환 환자 검체의 메타게놈 조성 분석 및 후보 바이오마커 발굴 ... 5
• 3) 후보 바이오마커의 기능적 분석 및 대사체 예측분석 ... 6
• 4) 후보 바이오마커의 모체 균주를 이용한 위암 발생 기전 확인 ... 6
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 7
• 1) 정성적 연구성과(연구개발결과) ... 7
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 11
• 3) 목표 달성 수준 ... 11
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 11
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 12
• 1) 사회적 측면 ... 12
• 2) 학술 응용 측면 ... 12
• 3) 경제 산업적 측면 ... 12
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 13
• 6. 자체점검표 ... 13
• 7. 참고문헌 ... 14
• 끝페이지 ... 18