초록 ▼

□ 연구개요
본 연구는 1) Hunner type의 간질성방광염/방광통증증후군 환자 및 정상군에서 방광 층(layer)별 RNA sequencing을 통해 layer별 특정 유전자의 발현 정도를 확인하고, 2)RNA 단일 세포 수준의 다중 오믹스 분석 및 단일세포 공간네트워크 분석 기술을 통해 Hunner lesion의 특성과 주변환경 세포간 상호작용을 분석함으로써 각 군간 차이를 비교 분석하며, 3) 새로운 바이오 마커를 발굴함에 있음.

□ 연구 목표대비 연구결과
■ 간질성 방광염 환자 내 Hunner le

□ 연구개요
본 연구는 1) Hunner type의 간질성방광염/방광통증증후군 환자 및 정상군에서 방광 층(layer)별 RNA sequencing을 통해 layer별 특정 유전자의 발현 정도를 확인하고, 2)RNA 단일 세포 수준의 다중 오믹스 분석 및 단일세포 공간네트워크 분석 기술을 통해 Hunner lesion의 특성과 주변환경 세포간 상호작용을 분석함으로써 각 군간 차이를 비교 분석하며, 3) 새로운 바이오 마커를 발굴함에 있음.

□ 연구 목표대비 연구결과
■ 간질성 방광염 환자 내 Hunner lesion과 non-Hunner lesion 및 정상인의 전사체 프로파일 비교
● Hunner lesion에서는 콜라겐 생성, 섬유아 세포(Fibroblast)의 활성 및 증식 관련된 Pathway가 활성화 되어있음을 확인하였고, Non-hunner lesion에서는 면역반응의 억제와 관련된 Pathway가 활성화되어 있음을 확인하였음
● Hunner lesion에서 면역반응 억제 시스템의 상대적인 비활성화를 확인했고, 유전자 단계에서는 CD68, MAFB, LILRB4 등 대식세포(Macrophage)에서 많이 발현하는 혹은 그 분화와 관련된 유전자들, 그리고 T 세포 탈진(T cell exhaustion)과 관련된 HAVCR2가 Hunner lesion에서 적게 발현하고 있었음
● 면역반응 억제와 관련된 M2 대식세포(M2 macrophage), 조절 T 세포(Regulatory T cell, Treg)가 Hunner lesion에서 적게 분포하였고, 반대로 전염증성(Pro-inflammatory) 세포인 M1 대식세포(M1 macrophage)가 많이 분포하였음.
● 근육층에서 정상인과 환자의 차이를 확인하고자, DEG 분석을 진행함. Hunner lesion과 Non-hunner lesion의 정상인의 조직에 대한 유전자 발현 양상은 거의 동일했음.

■ 단일세포 오믹스 데이터 생산 및 전사체 분석
● nFeauture 및 mitochondrial percentage를 이용해 quality가 좋지 않은 cell 제거함. doublet을 제거한 뒤 총 49,782 cell을 분석함.
● Canonical markger gene 및 각 cluster의 marker 유전자를 이용 및 비교하여 총 11개의 cell type이 확인. 전반적으로 fibroblast 및 T cell의 proportion이 높음을 확인할 수 있었음.
● Fibroblast에 대해 Hunner lesion과 non-Hunner lesion과의 차이를 확인하기 위해 GSEA 분석 및 GO 분석을 수행하였으며, non-Hunner lesion에서는 cell cycle, TNFA, TGFB가 활성화되어 있는 반면에 Hunner lesion에서는 interferon 관련 pathway가 활성화 되어 있었음
● T cell에 대해 Hunner lesion과 non-Hunner lesion과의 차이를 확인하기 위해 GSEA 및 GO 분석을 수행하였으며 fibroblast와 유사하게 Hunner lesion에서 interferon관련 pathway가 활성화되어 있으며 ROS관련 pathway도 활성화되어 있었음
● Hunner lesion과 non-Hunner lesion과의 차이를 확인하기 위해 GSEA 및 GO 분석을 수행하였으며 fibroblast와 유사하게 Hunner lesion에서 interferon관련 pathway가 활성화되어 있으며 ROS관련 pathway도 활성화되어 있었음

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
■ 방광층(bladder layer)별 유전자 발현 정도의 차이를 통해 타질환과의 연관성을 찾고 간질성방광/방광통증증후군의 subclassification을 확립
● 원인 유전자를 토대로 타 질환 (예. 자가면역질환, 염증성장질환 등)과의 연관성을 확인하는 후속 연구에 활용
● 타겟 유전자를 토대로 유전자 치료제 개발 연구로 활용
■ 단일세포 전사체 기반 간질성방광/방광통증증후군 바이오마커 발굴
● 간질성방광/방광통증증후군 환자 조직 단일세포 전사체 분석을 통해 Hunner lesion이 있는 부위의 특정 세포와 주변 환경세포의 특징을 파악하고 세포 타입별 특이적 유전자 발현을 확인하여 진단 및 치료 예측 바이오마커로 활용함.
● 바이오마커를 활용하여 환자 증상의 정도별, 증상의 진행별, 치료 전후 예후 및 치료를 예측하는 연구에 활용

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• (1) 1차년도 수행 내용 ... 4
• (2) 2차년도 수행 내용 ... 4
• (3) 3차년도 수행 내용 ... 8
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 11
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 11
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 11
• 3) 목표 달성 수준 ... 11
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 11
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 12
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 12
• 6. 자체점검표 ... 13
• 7. 참고문헌 ... 13
• 끝페이지 ... 20