초록 ▼

□ 연구개요
- 치료법 개발이 제한적인 난소암 영역에서 암 환자의 생존율을 향상시키기 위해서는 조기진단과 함께, 표준치료 후 치료반응 및 예후를 예측하고 재발을 빠르고 정확하게 진단하는 것이 가장 중요함.
- 90% 이상의 난소암 환자에서 나타나는 TP53 유전자변이를 확인하는 것은 환자의 임상 경과를 예측하는 중요한 수단이 될 것이며, 특히 ctDNA를 통하여 TP53 mutation을 확인 · 감시할 수 있다면 기존의 종양표지자 검사에 버금가는 편리성과 조직검사에 상응하는 정확성이 확보된 “ 환자 개별 맞춤, 종양 특

□ 연구개요
- 치료법 개발이 제한적인 난소암 영역에서 암 환자의 생존율을 향상시키기 위해서는 조기진단과 함께, 표준치료 후 치료반응 및 예후를 예측하고 재발을 빠르고 정확하게 진단하는 것이 가장 중요함.
- 90% 이상의 난소암 환자에서 나타나는 TP53 유전자변이를 확인하는 것은 환자의 임상 경과를 예측하는 중요한 수단이 될 것이며, 특히 ctDNA를 통하여 TP53 mutation을 확인 · 감시할 수 있다면 기존의 종양표지자 검사에 버금가는 편리성과 조직검사에 상응하는 정확성이 확보된 “ 환자 개별 맞춤, 종양 특이적 모니터링 기법 ”으로 활용될 가능성이 존재함.
- 난소암에서 heterogenous하게 나타나는 TP53 유전자 변이를 임상에서 적용하기 위해서는 기존에 sensitive한 연구기법인 ddPCR이 적합하지 않을 것으로 판단됨. 정확도는 매우 높으나 labor-intense하며 경제성이 좋지 않음. 이러한 이유로 TP53 유전자 전체를 커버하면서도 임상적으로 사용 가능한 방법의 초고감도 TP53 추적 플랫폼의 개발이 요구됨.

□ 연구 목표대비 연구결과
연구 개시 목표했던 부분보다 더 많은 환자 샘플을 확보하여 양질의 전향적 코호트를 구축하고 연구의 가장 핵심목표인 초고감도 ctDNA 추적 플랫폼을 성공적으로 구축하여 우수한 연구 성과를 달성하였고 추후 후속연구 뿐 아니라 다른 분야의 연구 진행에도 활용도가 높을 것으로 생각됨
1) 초고감도 추적 플랫폼 (OncoUHS)의 accuracy, lead-time 및 genomic-driven clinical trial 적용 가능성 평가 (목표대비 100% 달성)
- amplicom sequencing 기법을 난소암 환자의 혈액에 적용하여 우수한 결과를 도출함으로써 ultra-high-sensitive(UHS)한 ctDNA 분석법을 정립
- 수술 전후 및 항암 전후 난소암 환자의 혈액 샘플에서 UHS ctDNA 분석을 실제 수행하고 임상경과에 따른 의미있는 변화를 관찰하였음
2) 전향적 고위험 난소암 코호트 구축 (목표대비 100% 달성)
- 임상연구심의위원회에 전향적 코호트 구축을 승인받음
- 난소암이 의심되는 54명의 환자를 등록함
- HGSC 환자 30명의 혈액샘플 획득
3) 난소암 재발 및 항암제반응성 관련 causative variant 발굴 (목표대비 50% 달성)
- 재발 여부와 연관된 ctDNA 변화 양상을 확인하였음
- 항암제 반응성과 연관된 ctDNA 변화 양상을 확인하였음
- 이에 대한 분석 및 validation은 계속 진행할 예정임

□ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성)
- 기존에 ctDNA 분석 echnology보다 더 정확하고 더 빠른 ultra-high-sensitive UHS)한 ctDNA 분석법을 정립함
- 종양조직과 혈액샘플에서 100%의 일치율로서 TP53 mutantation을 확인함으로써 기존의 ctDNA 분석에서 부족했던 정확도와 효율성을 모두 향상시켜 다른 암종, 다른 타겟의 ctDNA 분석에서도 매우 용이하게 사용될 수 있음
- 암의 발생기전에서 매우 중요하지만 임상적 활용에 제한이 있던 TP53 유전자를 혈액샘플에서 deep sequencing 많은 다양한 암종에서 TP53 mutant ctDNA 를 바이오마커로서 활용할 수 있는 가능성을 제시함
- 혈액 내 난소암 관련 ctDNA의 액체생검기술 적용 최적화 플랫폼 구축
ctDNA 정량분석 과정의 표준화, 간략화, TP53 이외의 다른 유전자 변이에 대한 ctDNA 검출 및 분석 방법의 확립, 차세대 시퀀싱 기술을 활용한 유전자 변이 확인 과정의 간략화, 높은 민감도로 병인성 유전자 변이 확인
- 초고감도 ctDNA 검출 플랫폼을 통한 신약개발의 동반진단마커로 활용 가능
- 액체생검 기술 활용을 통한 ctDNA 변화 양상에 따른 난소암 환자 임상 정보와의 연계 데이터베이스 구축
- 난소암 환자의 치료 후 재발 진단을 위한 검진의 근거 마련

(출처 : 연구결과 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구결과 요약문 ... 2
• 목차 ... 3
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 1) 연구과제의 필요성 ... 4
• 2) 연구과제의 목표 ... 5
• 3) 연구과제의 범위 ... 5
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 6
• 1) 기 확보된 난소암 환자 코호트에서 ctDNA 정량 분석 및 모니터링을 수행함 ... 6
• 2) NGS기반 난소암 관련 종양 mutation을 ctDNA 정량 분석 및 모니터링 수행함 ... 8
• 3) 특화된 NGS 기술을 활용한 난소암 환자 TP53 mutant ctDNA 정량 분석 수행 ... 9
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 ... 12
• 1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) ... 12
• 2) 세부 정량적 연구개발성과 ... 12
• 3) 목표 달성 수준 ... 13
• 4) 목표 미달 시 원인 분석 ... 13
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) ... 14
• 5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 14
• 6. 자체점검표 ... 15
• 7. 참고문헌 ... 15
• 끝페이지 ... 28