심한 모자이크와 모틀 병징을 보이는 파프리카로부터 한 종류의 포티 바이러스를 분리하였고, Pepper mottle virus(PepMoV)로 동정되었다. 분리된 PepMoV isolates는 크게 두 가지, 즉, 심한 모자이크를 나타내는 계통(Vb)과 약한 모자이크를 나타내는 계통(Vc)으로 구분되었다. 본 연구에서 이 두가지 isolates의 생물학적 및 혈청학적 특성과 게놈의 분자 생물학적 특성을 규명하였으며, 다른 고추 감염 포티바이러스와 비교조사 하였다. 포티바이러스에 대하여 범용적인 한 set의 ...
심한 모자이크와 모틀 병징을 보이는 파프리카로부터 한 종류의 포티 바이러스를 분리하였고, Pepper mottle virus(PepMoV)로 동정되었다. 분리된 PepMoV isolates는 크게 두 가지, 즉, 심한 모자이크를 나타내는 계통(Vb)과 약한 모자이크를 나타내는 계통(Vc)으로 구분되었다. 본 연구에서 이 두가지 isolates의 생물학적 및 혈청학적 특성과 게놈의 분자 생물학적 특성을 규명하였으며, 다른 고추 감염 포티바이러스와 비교조사 하였다. 포티바이러스에 대하여 범용적인 한 set의 프라이머를 PepMoV, Chilli veinal mottle virus (ChiVMV), Pepper veinal mottle virus (PVMV), Pepper severe mosaic virus (PSMV) 와 Tobacco each virus (TEV)에 적용하어 RT-PCR을 수행하였다. 부분적인 nuclear inclusion b(NIb)와 coat protein (CP) N-terminal 부분 유전자를 포함하는 RT-PCR 산물은 클로닝 되었다. 또한, 각각의 바이러스의 CP의 C-terminal 부분과 3' non-coding 부분을 클로닝하기 위해 oligo dT 프라이머와 바이러스 특이적인 프라이머를 제작하였다. 고추 감염 바이러스들의 염기서열을 결정하여 분석한 결과, 바이러스들 사이의 혈청학적 관계의 유사성이 인정되었다. PepMoV와 다른 4개 종류의 바이러스들 사이의 염기서열 유사도에서는 PepMoV가 PSMV와 가장 밀접한 것으로 밝혀졌다. PepMoV와 다른 고추감염 포티 바이러스가 분자학적으로 구분되는 것을 본 연구를 통하여 확인하였다. 그리고, 비록 이들이 고추에서 유사한 병징을 보이지만, 단백질 수준에서의 아미노산 서열의 유사성은 약 53% 이상이었다. PepMoV, PVMV, PSMV, ChiVMV와 TEV의 혈청학적 비교 실험(western blot)에서, 바이러스들은 동일 또는 유연관계가 높은 항원과는 강하게 반응하였으며, 다른 항원과는 약하거나 혹은 전혀 반응이 일어나지 않았다. 이러한 결과들은 이들 바이러스들 사이에서 혈청학적 차이가 인정됨을 의미하며, PepMoV는 혈청학적으로 PSMV와 유사성이 높으며, PVMV와는 낮음을 보여주었다. 혈청학적인 관계는 염기서열의 유사성과도 서로 관련되어 있었다. 본 연구에서는 필드에서 채집된 병에 걸린 파프리카로부터 PepMoV 한국 계통인 PepMoV-Vb의 전체 염기서열을 결정하였다. 전체염기서열 분석 결과, PepMoV-Vb RNA 는 poly (A)을 제외하고 9,640 뉴클레오타이드로 구성되어 있었다. 하나의 open reading frame 으로 뉴클레오타이드 위치 169에서 시작하며, 전형적인 포티바이러스 구조로써, 3,024개의 아미노산으로 구성되며 하나의 polyprotein을 암호화 한다. PepMoV-Vb의 전체 염기서열과 번역 영역들은 포티바이러스 속내 15가지의 포티바이러스들과 비교되었다. 전반적인 전체 염기서열의 동일성은 PepMoV-C와 94.7%, PepMoV-FL와 94.1%로 비슷하게 나타났다. PepMoV-Vb의 전체 게놈 RNA를 포함하는 cDNAs는 long-template RT-PCR을 통하여 정제된 viral RNAs로부터 합성되었고, RFLP 분석을 통하여 확인되었다. 본 연구는 국내에서 파프리카로부터 분리된 PepMoV의 전체 염기서열의 결정 및 분석과 게놈구조에 관한 최초의 보고이다.
심한 모자이크와 모틀 병징을 보이는 파프리카로부터 한 종류의 포티 바이러스를 분리하였고, Pepper mottle virus(PepMoV)로 동정되었다. 분리된 PepMoV isolates는 크게 두 가지, 즉, 심한 모자이크를 나타내는 계통(Vb)과 약한 모자이크를 나타내는 계통(Vc)으로 구분되었다. 본 연구에서 이 두가지 isolates의 생물학적 및 혈청학적 특성과 게놈의 분자 생물학적 특성을 규명하였으며, 다른 고추 감염 포티바이러스와 비교조사 하였다. 포티바이러스에 대하여 범용적인 한 set의 프라이머를 PepMoV, Chilli veinal mottle virus (ChiVMV), Pepper veinal mottle virus (PVMV), Pepper severe mosaic virus (PSMV) 와 Tobacco each virus (TEV)에 적용하어 RT-PCR을 수행하였다. 부분적인 nuclear inclusion b(NIb)와 coat protein (CP) N-terminal 부분 유전자를 포함하는 RT-PCR 산물은 클로닝 되었다. 또한, 각각의 바이러스의 CP의 C-terminal 부분과 3' non-coding 부분을 클로닝하기 위해 oligo dT 프라이머와 바이러스 특이적인 프라이머를 제작하였다. 고추 감염 바이러스들의 염기서열을 결정하여 분석한 결과, 바이러스들 사이의 혈청학적 관계의 유사성이 인정되었다. PepMoV와 다른 4개 종류의 바이러스들 사이의 염기서열 유사도에서는 PepMoV가 PSMV와 가장 밀접한 것으로 밝혀졌다. PepMoV와 다른 고추감염 포티 바이러스가 분자학적으로 구분되는 것을 본 연구를 통하여 확인하였다. 그리고, 비록 이들이 고추에서 유사한 병징을 보이지만, 단백질 수준에서의 아미노산 서열의 유사성은 약 53% 이상이었다. PepMoV, PVMV, PSMV, ChiVMV와 TEV의 혈청학적 비교 실험(western blot)에서, 바이러스들은 동일 또는 유연관계가 높은 항원과는 강하게 반응하였으며, 다른 항원과는 약하거나 혹은 전혀 반응이 일어나지 않았다. 이러한 결과들은 이들 바이러스들 사이에서 혈청학적 차이가 인정됨을 의미하며, PepMoV는 혈청학적으로 PSMV와 유사성이 높으며, PVMV와는 낮음을 보여주었다. 혈청학적인 관계는 염기서열의 유사성과도 서로 관련되어 있었다. 본 연구에서는 필드에서 채집된 병에 걸린 파프리카로부터 PepMoV 한국 계통인 PepMoV-Vb의 전체 염기서열을 결정하였다. 전체염기서열 분석 결과, PepMoV-Vb RNA 는 poly (A)을 제외하고 9,640 뉴클레오타이드로 구성되어 있었다. 하나의 open reading frame 으로 뉴클레오타이드 위치 169에서 시작하며, 전형적인 포티바이러스 구조로써, 3,024개의 아미노산으로 구성되며 하나의 polyprotein을 암호화 한다. PepMoV-Vb의 전체 염기서열과 번역 영역들은 포티바이러스 속내 15가지의 포티바이러스들과 비교되었다. 전반적인 전체 염기서열의 동일성은 PepMoV-C와 94.7%, PepMoV-FL와 94.1%로 비슷하게 나타났다. PepMoV-Vb의 전체 게놈 RNA를 포함하는 cDNAs는 long-template RT-PCR을 통하여 정제된 viral RNAs로부터 합성되었고, RFLP 분석을 통하여 확인되었다. 본 연구는 국내에서 파프리카로부터 분리된 PepMoV의 전체 염기서열의 결정 및 분석과 게놈구조에 관한 최초의 보고이다.
A potyvirus was isolated from diseased paprika (Capsicum annuum var. grossum) showing severe mosaic and mottle symptoms, and it was identified as Pepper mottle virus (PepMoV). Symptoms of isolates of PepMoV were divided largely into two groups, severe mosaic (Vb) and mild mosaic (Vc) patterns. In th...
A potyvirus was isolated from diseased paprika (Capsicum annuum var. grossum) showing severe mosaic and mottle symptoms, and it was identified as Pepper mottle virus (PepMoV). Symptoms of isolates of PepMoV were divided largely into two groups, severe mosaic (Vb) and mild mosaic (Vc) patterns. In this study, biological, serological, and molecular properties of these two isolates were characterized and compared to other pepper-infecting potyviruses. A set of degenerate primers for potyviruses were applied to PepMoV, Chilli veinal mottle virus (ChiVMV), Pepper veinal mottle virus (PVMV), Pepper severe mosaic virus (PSMV) and Tobacco each virus (TEV), and RT-PCR was performed. RT-PCR products containing partial nuclear inclusion b and coat protein (CP) genes for the N-terminal regions were cloned. Then, oligo dT primer and species-specific primers were designed to clone the C-terminal region of CP and 3' non-coding regions of each viruses. Sequences of the viruses were analyzed and compared to serological relationships among the viruses. Sequence homology between PepMoV and the four potyviruses revealed that PepMoV was the most related to PSMV. It was confirmed that PepMoV and other pepper-infecting potyviruses was different molecularly, and similarity of amino acids sequence was over 53.4% although they induced similar symptoms on pepper plants. In comparative serological experiments (western blot) of PepMoV, PVMV, PSMV, ChiVMV and TEV, the viruses reacted strongly with their homologous antisera, and weakly or not at all with heterologous antisera depending on analyzed methods as shown in this study. These results confirmed the lack of serological cross-reaction among the viruses, and suggest that PepMoV appears distantly related serologically to PSMV, but not with PVMV. The serological relationships were corresponded to as the similarities of sequences. Complete nucleotide sequence of genome RNA of a Korean isolate of PepMoV, PepMoV-Vb, from field-collected diseased paprika was determined in this study. As a result of complete nucleotide sequence analysis, PepMoV-Vb RNA consists of 9,640 nucleotides excluding the poly (A) tail. A single open reading frame was identified beginning at nucleotide position 169 encoding a polyprotein of 3,024 amino acids which is typical of the Potyvirus genus. The complete nucleotide sequence and coding regions of PepMoV-Vb were compared to that of 15 potyviruses within the genus Potyvirus. The overall nucleotide sequence identity was 94.7 and 94.1% identical to PepMoV-C and PepMoV-FL, respectively. Full-length cDNAs of PepMoV-Vb were synthesized from purified viral RNAs by long-template RT-PCR and was confirmed by RFLP analysis. This is the first report on complete nucleotide sequence of PepMoV isolated from paprika in Korea.
A potyvirus was isolated from diseased paprika (Capsicum annuum var. grossum) showing severe mosaic and mottle symptoms, and it was identified as Pepper mottle virus (PepMoV). Symptoms of isolates of PepMoV were divided largely into two groups, severe mosaic (Vb) and mild mosaic (Vc) patterns. In this study, biological, serological, and molecular properties of these two isolates were characterized and compared to other pepper-infecting potyviruses. A set of degenerate primers for potyviruses were applied to PepMoV, Chilli veinal mottle virus (ChiVMV), Pepper veinal mottle virus (PVMV), Pepper severe mosaic virus (PSMV) and Tobacco each virus (TEV), and RT-PCR was performed. RT-PCR products containing partial nuclear inclusion b and coat protein (CP) genes for the N-terminal regions were cloned. Then, oligo dT primer and species-specific primers were designed to clone the C-terminal region of CP and 3' non-coding regions of each viruses. Sequences of the viruses were analyzed and compared to serological relationships among the viruses. Sequence homology between PepMoV and the four potyviruses revealed that PepMoV was the most related to PSMV. It was confirmed that PepMoV and other pepper-infecting potyviruses was different molecularly, and similarity of amino acids sequence was over 53.4% although they induced similar symptoms on pepper plants. In comparative serological experiments (western blot) of PepMoV, PVMV, PSMV, ChiVMV and TEV, the viruses reacted strongly with their homologous antisera, and weakly or not at all with heterologous antisera depending on analyzed methods as shown in this study. These results confirmed the lack of serological cross-reaction among the viruses, and suggest that PepMoV appears distantly related serologically to PSMV, but not with PVMV. The serological relationships were corresponded to as the similarities of sequences. Complete nucleotide sequence of genome RNA of a Korean isolate of PepMoV, PepMoV-Vb, from field-collected diseased paprika was determined in this study. As a result of complete nucleotide sequence analysis, PepMoV-Vb RNA consists of 9,640 nucleotides excluding the poly (A) tail. A single open reading frame was identified beginning at nucleotide position 169 encoding a polyprotein of 3,024 amino acids which is typical of the Potyvirus genus. The complete nucleotide sequence and coding regions of PepMoV-Vb were compared to that of 15 potyviruses within the genus Potyvirus. The overall nucleotide sequence identity was 94.7 and 94.1% identical to PepMoV-C and PepMoV-FL, respectively. Full-length cDNAs of PepMoV-Vb were synthesized from purified viral RNAs by long-template RT-PCR and was confirmed by RFLP analysis. This is the first report on complete nucleotide sequence of PepMoV isolated from paprika in Korea.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.