하늘다람쥐(Pteromys volans)는 유라시아 날다람쥐로도 불리며 우리나라에 서식하는 멸종위기종이다. 하늘다람쥐는 전나무가 우점종인 아한대 숲에 주로 서식하였는데, 최근 숲의 무분별한 개발과 댐 건설, 살충제의 사용으로 하늘다람쥐의 다양성이 급격히 줄어들고 있다. 본 연구를 통해 하늘다람쥐의 종 보존을 위한 기초자료를 확보하고 유전적 특성을 파악하고자 전체 ...
하늘다람쥐(Pteromys volans)는 유라시아 날다람쥐로도 불리며 우리나라에 서식하는 멸종위기종이다. 하늘다람쥐는 전나무가 우점종인 아한대 숲에 주로 서식하였는데, 최근 숲의 무분별한 개발과 댐 건설, 살충제의 사용으로 하늘다람쥐의 다양성이 급격히 줄어들고 있다. 본 연구를 통해 하늘다람쥐의 종 보존을 위한 기초자료를 확보하고 유전적 특성을 파악하고자 전체 미토콘드리아유전체 서열을 밝히고 그 특성을 규명하였다. 하늘다람쥐의 미토콘드리아 유전체는 쥐목(Rodentia)의 종들에게서 나타나는 전형적인 특성을 가지고 있었다. 하늘다람쥐의 전체 미토콘드리아 유전체를 쥐목에 속하는 14종의 미토콘드리아 전체서열과 쥐목을 제외한 다른 포유강 8개의 목에서 14종의 미토콘드리아 전체서열을 비교하여 쥐목과 다른 포유강 사이의 유전적 거리와 계통학적 관계를 규명할 수 있었다. 하늘다람쥐의 전체 미토콘드리아 유전체 염기서열은 16,513bp였으며, 13개의 단백질 암호화 유전자와 22개의 tRNA유전자, 2개의 rRNA 유전자, 1개의 조절부위로 구성되어 있음을 밝혔다. 하늘다람쥐가 속해 있는 아목인 Sciuromorpha와 생쥐, 들쥐가 속해 있는 Myomorpha는 선호하는 단백질암호화유전자에서 차이를 보였다. 쥐목이 단계통과 측계통 중 어느 쪽을 지지하는지는 아직 확립되지 않은 논란거리다. ML과 BI방법을 이용한 계통 분석 결과, 아목인 Sciuromorpha, Myomorpha, Mystrimorpha는 각각 단계통을 형성하였으나 쥐목전체는 단계통이 아닌 측계통인 것으로 나타났다.
하늘다람쥐(Pteromys volans)는 유라시아 날다람쥐로도 불리며 우리나라에 서식하는 멸종위기종이다. 하늘다람쥐는 전나무가 우점종인 아한대 숲에 주로 서식하였는데, 최근 숲의 무분별한 개발과 댐 건설, 살충제의 사용으로 하늘다람쥐의 다양성이 급격히 줄어들고 있다. 본 연구를 통해 하늘다람쥐의 종 보존을 위한 기초자료를 확보하고 유전적 특성을 파악하고자 전체 미토콘드리아 유전체 서열을 밝히고 그 특성을 규명하였다. 하늘다람쥐의 미토콘드리아 유전체는 쥐목(Rodentia)의 종들에게서 나타나는 전형적인 특성을 가지고 있었다. 하늘다람쥐의 전체 미토콘드리아 유전체를 쥐목에 속하는 14종의 미토콘드리아 전체서열과 쥐목을 제외한 다른 포유강 8개의 목에서 14종의 미토콘드리아 전체서열을 비교하여 쥐목과 다른 포유강 사이의 유전적 거리와 계통학적 관계를 규명할 수 있었다. 하늘다람쥐의 전체 미토콘드리아 유전체 염기서열은 16,513bp였으며, 13개의 단백질 암호화 유전자와 22개의 tRNA유전자, 2개의 rRNA 유전자, 1개의 조절부위로 구성되어 있음을 밝혔다. 하늘다람쥐가 속해 있는 아목인 Sciuromorpha와 생쥐, 들쥐가 속해 있는 Myomorpha는 선호하는 단백질암호화유전자에서 차이를 보였다. 쥐목이 단계통과 측계통 중 어느 쪽을 지지하는지는 아직 확립되지 않은 논란거리다. ML과 BI방법을 이용한 계통 분석 결과, 아목인 Sciuromorpha, Myomorpha, Mystrimorpha는 각각 단계통을 형성하였으나 쥐목전체는 단계통이 아닌 측계통인 것으로 나타났다.
Pteromys volans (Mammalia, Rodentia, Sciuridae) called Eurasian flying squirrel is an endangered species in Korea. They lived predominantly in spruce-dominated boreal forest habitats. Reckless forest development, dam construction and use of pesticide have raised rapid decrease of biodiversity of P. ...
Pteromys volans (Mammalia, Rodentia, Sciuridae) called Eurasian flying squirrel is an endangered species in Korea. They lived predominantly in spruce-dominated boreal forest habitats. Reckless forest development, dam construction and use of pesticide have raised rapid decrease of biodiversity of P. volans. Here, the complete mitochondrial genome (16,513bp) of P. volans was sequenced and characterized in detail. It has the gene order identical to the traditional one shown in Rodentia. The result was compared with 14 species in the order Rodentia and 14 species in the other 8 mammalian orders. With the mitochondrial genome of P. volans, genetic distances and phylogenetic relationships among the order Rodentia and the other mammalian orders were examined in this study. There were found some interesting features, which were discussed in detail. Comparison of the codon usage pattern of the 13 mitochondrial protein-coding genes in P. volans showed a preference for the use of 'A'or'U' in the third codon. In the suborder Sciuromorpha including P. volans, an 'UUU' codon is more preferred, while 'UUC' in the two phenylalanine (Phe) codon was more preferred in the suborder Myomorpha. The suborder Sciuromorpha tended to use 3 codons 'CCU', 'CCC' and 'CCA' equally of the four proline (Pro) codons. On the contrary, the suborder Myomorpha preferred to 'CCA'. Bayesian inference and maximum likelihood analyses based on nucleotide sequences of 13 protein coding genes except for 2 ribosomal RNA genes (16S rRNA and 12S rRNA) revealed that the suborders Sciuromorpa, Mystrimorpha and Myomorpha are monophyletic groups, but the order Rodentia is not a monophyletic group.
Pteromys volans (Mammalia, Rodentia, Sciuridae) called Eurasian flying squirrel is an endangered species in Korea. They lived predominantly in spruce-dominated boreal forest habitats. Reckless forest development, dam construction and use of pesticide have raised rapid decrease of biodiversity of P. volans. Here, the complete mitochondrial genome (16,513bp) of P. volans was sequenced and characterized in detail. It has the gene order identical to the traditional one shown in Rodentia. The result was compared with 14 species in the order Rodentia and 14 species in the other 8 mammalian orders. With the mitochondrial genome of P. volans, genetic distances and phylogenetic relationships among the order Rodentia and the other mammalian orders were examined in this study. There were found some interesting features, which were discussed in detail. Comparison of the codon usage pattern of the 13 mitochondrial protein-coding genes in P. volans showed a preference for the use of 'A'or'U' in the third codon. In the suborder Sciuromorpha including P. volans, an 'UUU' codon is more preferred, while 'UUC' in the two phenylalanine (Phe) codon was more preferred in the suborder Myomorpha. The suborder Sciuromorpha tended to use 3 codons 'CCU', 'CCC' and 'CCA' equally of the four proline (Pro) codons. On the contrary, the suborder Myomorpha preferred to 'CCA'. Bayesian inference and maximum likelihood analyses based on nucleotide sequences of 13 protein coding genes except for 2 ribosomal RNA genes (16S rRNA and 12S rRNA) revealed that the suborders Sciuromorpa, Mystrimorpha and Myomorpha are monophyletic groups, but the order Rodentia is not a monophyletic group.
AI-Helper
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.