본 실험은 국내 소면적 작물인 매실과 맥문동을 평가하고자 분자마커를 활용하여 해당 유전자원을 평가하였고, 향후 국내 농산물의 품종판별 및 유연관계의 분석을 통한 국내에서 자생하는 재래종 농산물에 대한 정확한 유전적 정보의 확보에 기초정보로 활용될 수 있는 자료를 제공하고자 한다. 이에 그 결과는 다음과 같다. 1. SSR 마커를 이용한 매실의 유연관계 분석 및 판별 매실 69종의 다양성을 16개의 SSR ...
본 실험은 국내 소면적 작물인 매실과 맥문동을 평가하고자 분자마커를 활용하여 해당 유전자원을 평가하였고, 향후 국내 농산물의 품종판별 및 유연관계의 분석을 통한 국내에서 자생하는 재래종 농산물에 대한 정확한 유전적 정보의 확보에 기초정보로 활용될 수 있는 자료를 제공하고자 한다. 이에 그 결과는 다음과 같다. 1. SSR 마커를 이용한 매실의 유연관계 분석 및 판별 매실 69종의 다양성을 16개의 SSR 마커로 분석한 결과 총 107개의 allele이 관찰되었고, PIC 값은 최소 0.183에서 최대 0.852이었으며, GD값은 최소 0.189에서 최대 0.866으로 나타났다. 이 중 allele의 수 GD 와 PIC 값에 따라 7개 마커를 선발(KUMP-170, KUMP-161, KUMP-63, KUMP-143, KUMP-104, KUMP-47, KUMP-34), 총 7번의 step에 걸쳐 순차적으로 적용한 결과 7개 마커 set을 통하여 69종의 매실을 모두 판별할 수 있었다. 2. rpoC1 유전자 단일염기다양성을 이용한 맥문동 기원식물 판별 수집된 28개의 시장자원 및 재배, 분양자원에 대하여 rpoC1 유전자를 이용한 PCR 증폭 후 염기서열 분석을 통하여 나온 결과를 염기서열 alignment 한 결과 총 47개의 SNPs 부분을 확인 할 수 있었다. 이 중 총 3개의 SNPs 부분이 KULP013, KULP014 만이 가지고 있는 특징적인 SNPs 부분을 보였고, 이들 중 2개의 SNPs가 중국산 품종에서 보이는 염기서열과 같은 SNPs를 갖는 특징을 보였며, 1개의 SNPs 부분은 KULP013, KULP014 품종만이 가지는 고유의 SNPs 부분이었다.
본 실험은 국내 소면적 작물인 매실과 맥문동을 평가하고자 분자마커를 활용하여 해당 유전자원을 평가하였고, 향후 국내 농산물의 품종판별 및 유연관계의 분석을 통한 국내에서 자생하는 재래종 농산물에 대한 정확한 유전적 정보의 확보에 기초정보로 활용될 수 있는 자료를 제공하고자 한다. 이에 그 결과는 다음과 같다. 1. SSR 마커를 이용한 매실의 유연관계 분석 및 판별 매실 69종의 다양성을 16개의 SSR 마커로 분석한 결과 총 107개의 allele이 관찰되었고, PIC 값은 최소 0.183에서 최대 0.852이었으며, GD값은 최소 0.189에서 최대 0.866으로 나타났다. 이 중 allele의 수 GD 와 PIC 값에 따라 7개 마커를 선발(KUMP-170, KUMP-161, KUMP-63, KUMP-143, KUMP-104, KUMP-47, KUMP-34), 총 7번의 step에 걸쳐 순차적으로 적용한 결과 7개 마커 set을 통하여 69종의 매실을 모두 판별할 수 있었다. 2. rpoC1 유전자 단일염기다양성을 이용한 맥문동 기원식물 판별 수집된 28개의 시장자원 및 재배, 분양자원에 대하여 rpoC1 유전자를 이용한 PCR 증폭 후 염기서열 분석을 통하여 나온 결과를 염기서열 alignment 한 결과 총 47개의 SNPs 부분을 확인 할 수 있었다. 이 중 총 3개의 SNPs 부분이 KULP013, KULP014 만이 가지고 있는 특징적인 SNPs 부분을 보였고, 이들 중 2개의 SNPs가 중국산 품종에서 보이는 염기서열과 같은 SNPs를 갖는 특징을 보였며, 1개의 SNPs 부분은 KULP013, KULP014 품종만이 가지는 고유의 SNPs 부분이었다.
This study was aimed to develop a technique of original species identification in minor crops: Prunus mume and Liriope & Ophiopogon genus. In addition, this study would provide genetic information about Korea native plants and would be useful for genetic diversity, identification and conservation of...
This study was aimed to develop a technique of original species identification in minor crops: Prunus mume and Liriope & Ophiopogon genus. In addition, this study would provide genetic information about Korea native plants and would be useful for genetic diversity, identification and conservation of germplasm resources in these crops in future. The results were summarized as follows: 1. In total 68 samples were discriminated by 16 SSR markers. Genetic analysis revealed values of diversity with a total of 107 alleles(average 6.08 alleles/locus) among the accessions used in this study. Among these markers, seven markers were selected by GD(gene diversity) and PIC(polymorphic information content) to construct the cultivar discrimination. The selected seven markers could clearly discriminate the 68 samples-used in this study. 2. A total of 46 SNPs, we developed, could clearly discriminate the two cultivars (Korea and China). In UPGMA dendrogram, the genetic relationship of 28 Liriope and Ophiopogon could be seen clearly as two groups.
This study was aimed to develop a technique of original species identification in minor crops: Prunus mume and Liriope & Ophiopogon genus. In addition, this study would provide genetic information about Korea native plants and would be useful for genetic diversity, identification and conservation of germplasm resources in these crops in future. The results were summarized as follows: 1. In total 68 samples were discriminated by 16 SSR markers. Genetic analysis revealed values of diversity with a total of 107 alleles(average 6.08 alleles/locus) among the accessions used in this study. Among these markers, seven markers were selected by GD(gene diversity) and PIC(polymorphic information content) to construct the cultivar discrimination. The selected seven markers could clearly discriminate the 68 samples-used in this study. 2. A total of 46 SNPs, we developed, could clearly discriminate the two cultivars (Korea and China). In UPGMA dendrogram, the genetic relationship of 28 Liriope and Ophiopogon could be seen clearly as two groups.
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