Tepidimicrobium ferriphilum은 pH 9의 알칼리 환경에서 생존 할 수 있고, Fe(III) 최종 전자 수용체를 사용하며, 5.4kGray 감마선 노출에서도 견딜 수 있는 극한미생물이다. 혐기성 환경에서 철환원 과정은 인산염과 금속 및 유기물 분해에 중요한 의미를 가지고 있으며, 이러한 물질 순환기능은 다양한 산업 분야에 활용될 수 있을 것으로 예상된다. 본 연구는 Tepidimicrobium ferriphilum의 토양 환경 중 분포를 파악하고, 생태적 기능을 조사하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하는데 소모되는 시간과 노력을 절감하기 위해Tepidimicrobium ferriphilum 16S rRNA 유전자의 특정 부분을 증폭시키는 종 특이적 primer를 개발하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하기 위해 기원이 다른 14개 토양시료를 대상으로 조사한 결과, 14개 토양 모두에서 유전자가 증폭 되는 것을 확인할 수 있었다. 혐기성 농화 배양을 통해 새로운 규주를 확보할 수 있었다. MG-RAST의 metagenome을 분석한 결과, Tepidimicrobium ferriphilum은 전 세계에 분포하는 다양한 7.6%의 토양환경에서 검출되었다. 결론적으로, 극한미생물의 생리를 가진 Tepidimicrobium ferriphilum은 일반적인 토양환경의 구성원으로서 토양환경에서 ...
Tepidimicrobium ferriphilum은 pH 9의 알칼리 환경에서 생존 할 수 있고, Fe(III) 최종 전자 수용체를 사용하며, 5.4kGray 감마선 노출에서도 견딜 수 있는 극한미생물이다. 혐기성 환경에서 철환원 과정은 인산염과 금속 및 유기물 분해에 중요한 의미를 가지고 있으며, 이러한 물질 순환기능은 다양한 산업 분야에 활용될 수 있을 것으로 예상된다. 본 연구는 Tepidimicrobium ferriphilum의 토양 환경 중 분포를 파악하고, 생태적 기능을 조사하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하는데 소모되는 시간과 노력을 절감하기 위해Tepidimicrobium ferriphilum 16S rRNA 유전자의 특정 부분을 증폭시키는 종 특이적 primer를 개발하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하기 위해 기원이 다른 14개 토양시료를 대상으로 조사한 결과, 14개 토양 모두에서 유전자가 증폭 되는 것을 확인할 수 있었다. 혐기성 농화 배양을 통해 새로운 규주를 확보할 수 있었다. MG-RAST의 metagenome을 분석한 결과, Tepidimicrobium ferriphilum은 전 세계에 분포하는 다양한 7.6%의 토양환경에서 검출되었다. 결론적으로, 극한미생물의 생리를 가진 Tepidimicrobium ferriphilum은 일반적인 토양환경의 구성원으로서 토양환경에서 생태적 지위를 갖는 것으로 파악된다.
Tepidimicrobium ferriphilum은 pH 9의 알칼리 환경에서 생존 할 수 있고, Fe(III) 최종 전자 수용체를 사용하며, 5.4kGray 감마선 노출에서도 견딜 수 있는 극한미생물이다. 혐기성 환경에서 철환원 과정은 인산염과 금속 및 유기물 분해에 중요한 의미를 가지고 있으며, 이러한 물질 순환기능은 다양한 산업 분야에 활용될 수 있을 것으로 예상된다. 본 연구는 Tepidimicrobium ferriphilum의 토양 환경 중 분포를 파악하고, 생태적 기능을 조사하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하는데 소모되는 시간과 노력을 절감하기 위해Tepidimicrobium ferriphilum 16S rRNA 유전자의 특정 부분을 증폭시키는 종 특이적 primer를 개발하였다. Tepidimicrobium ferriphilum의 분포를 파악하기 위해 기원이 다른 14개 토양시료를 대상으로 조사한 결과, 14개 토양 모두에서 유전자가 증폭 되는 것을 확인할 수 있었다. 혐기성 농화 배양을 통해 새로운 규주를 확보할 수 있었다. MG-RAST의 metagenome을 분석한 결과, Tepidimicrobium ferriphilum은 전 세계에 분포하는 다양한 7.6%의 토양환경에서 검출되었다. 결론적으로, 극한미생물의 생리를 가진 Tepidimicrobium ferriphilum은 일반적인 토양환경의 구성원으로서 토양환경에서 생태적 지위를 갖는 것으로 파악된다.
Tepidimicrobium ferriphilum can survive in an alkaline environment of pH 9 while using Fe (III) as a final electron acceptor. It is known as an extremophile because it can also withstand 5.4 kGay gamma ray exposure. In an anaerobic environment, iron-reduction process processes have important implica...
Tepidimicrobium ferriphilum can survive in an alkaline environment of pH 9 while using Fe (III) as a final electron acceptor. It is known as an extremophile because it can also withstand 5.4 kGay gamma ray exposure. In an anaerobic environment, iron-reduction process processes have important implications for metal phosphate transformation and organics decomposition. Therefore, the extremophile Tepidimicrobium ferriphilum might have various applications to diverse fields of industry. For the purpose of understanding ecological functions of the extremophile in soil environments, occurrence of the species in various soils were investigated. Because its cultivation is time consuming and the procedures are elaborated, species-specific primer targeting 16S rRNA gene of Tepidimicrobium ferriphilum was developed. By applying the PCR method, 14 soils from diverse sources in Korea were subjected for occurrence of the species. Surprisingly, all 14 soils were positive for the PCR. Anaerobic cultivation using the samples resulted novel strains of the species. By searching MG-RAST database, 7.6% of soil metagenomes were revealed to contain the species. The metagenomes were from highly diverse environments. In conclusion, Tepidimicrobium ferriphilum seems have an ecological niche in soil environment as a member of normal flora although its physiology is that of an extremophile.
Tepidimicrobium ferriphilum can survive in an alkaline environment of pH 9 while using Fe (III) as a final electron acceptor. It is known as an extremophile because it can also withstand 5.4 kGay gamma ray exposure. In an anaerobic environment, iron-reduction process processes have important implications for metal phosphate transformation and organics decomposition. Therefore, the extremophile Tepidimicrobium ferriphilum might have various applications to diverse fields of industry. For the purpose of understanding ecological functions of the extremophile in soil environments, occurrence of the species in various soils were investigated. Because its cultivation is time consuming and the procedures are elaborated, species-specific primer targeting 16S rRNA gene of Tepidimicrobium ferriphilum was developed. By applying the PCR method, 14 soils from diverse sources in Korea were subjected for occurrence of the species. Surprisingly, all 14 soils were positive for the PCR. Anaerobic cultivation using the samples resulted novel strains of the species. By searching MG-RAST database, 7.6% of soil metagenomes were revealed to contain the species. The metagenomes were from highly diverse environments. In conclusion, Tepidimicrobium ferriphilum seems have an ecological niche in soil environment as a member of normal flora although its physiology is that of an extremophile.
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