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국화는 다양하고 아름다운 화형과 화색을 가지고 있어 세계적으로 사랑받는 절화 및 분화 식물이다. 높은 관상가치와 유전적 다양성을 갖는 국화의 육종 방법의 첫 단계는 기존 품종에 존재하는 목표 형질을 식별하거나, 존재하지 않는 새로운 형질을 갖게 하는 것이다. 그러나 국화 유전자원은 복잡한 유전적 다양성 때문에 첫 단계에 접근하는 것이 어려운 실정이다.

차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing, NGS)는 유전자형 분석에 있어 높은 처리량을 보이기 때문에 식물 및 동물유전학 연구에 주로 사용되는 혁명적인 방법이다. Genotyping-by-sequencing(...

국화는 다양하고 아름다운 화형과 화색을 가지고 있어 세계적으로 사랑받는 절화 및 분화 식물이다. 높은 관상가치와 유전적 다양성을 갖는 국화의 육종 방법의 첫 단계는 기존 품종에 존재하는 목표 형질을 식별하거나, 존재하지 않는 새로운 형질을 갖게 하는 것이다. 그러나 국화 유전자원은 복잡한 유전적 다양성 때문에 첫 단계에 접근하는 것이 어려운 실정이다.

차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing, NGS)는 유전자형 분석에 있어 높은 처리량을 보이기 때문에 식물 및 동물유전학 연구에 주로 사용되는 혁명적인 방법이다. Genotyping-by-sequencing(GBS)은 단일 뉴클레오타이드 다형성(Single nucleotide polymorphism, SNP) 마커 발달 시스템을 기반으로 새로 확립되어 광범위하게 사용되는 NGS 방법이다.

본 연구에서는 국화 GBS 라이브러리 구축을 위하여 한국 자생국화 8종을 이용, 세 가지 제한 효소 (Restriction enzyme, RE) 조합의 효율을 비교하였다. 본 결과는 국화 GBS연구에 한 발 더 다가서는데 기여하였다.
키워드 : GBS, NGS, RE, SNP, Stacks, 한국 자생 국화.

Abstract ▼ AI-Helper

All chrysanthemums have beautiful flowers in abundance of diversity in flower type and color. They are also the most important global cut flower and pot plants. With the high ornamental value and rich genetic diversity, the first step in Chrysanthemum breeding is identifying suitable genotypes conta...

All chrysanthemums have beautiful flowers in abundance of diversity in flower type and color. They are also the most important global cut flower and pot plants. With the high ornamental value and rich genetic diversity, the first step in Chrysanthemum breeding is identifying suitable genotypes containing the desired genes among existing varieties, or the creation of one provided that it is not naturally found. However, chrysanthemum genomic resources are not an intensively available accomplishment. Next generation sequencing (NGS) is well-known, as the revolutionized genetic study in plants and animals stand on the advanced method of high throughput genotyping. Genotyping-by-sequencing (GBS) is a newly established and broadly used NGS method based on the developmental system of single nucleotide polymorphism (SNP) markers. This study provided the first step to understanding the effects of three restriction enzyme (RE) combinations (ApeKI, ApeKI/MseI, and ApeKI/MspI) for GBS library construction using eight Korean native Chrysanthemum spp. accessions. These data findings qualify research and highlight the importance of achievement in GBS Chrysanthemum.

Keywords: GBS, NGS, RE, SNP, Stacks, wild native Chrysanthemum. 

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