암은 세계적으로 사망률이 높은 질병 중 하나이다. 백년이 넘는 시간 동안 암에 관한 활발한 연구가 진행되고 있지만 명확한 작용기전은 여전히 밝혀지지 않았다. 암의 사망률이 높은 원인은 전이에 있다. 암의 전이에는 상피-간엽 이행(Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT)이 필수적이며 DDR1(Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1)과 ZEB1(Zinc finger E-box- binding homeobox 1)은 EMT를 확인할 수 있는 주요 마커이다. Reverse transcription(...
암은 세계적으로 사망률이 높은 질병 중 하나이다. 백년이 넘는 시간 동안 암에 관한 활발한 연구가 진행되고 있지만 명확한 작용기전은 여전히 밝혀지지 않았다. 암의 사망률이 높은 원인은 전이에 있다. 암의 전이에는 상피-간엽 이행(Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT)이 필수적이며 DDR1(Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1)과 ZEB1(Zinc finger E-box- binding homeobox 1)은 EMT를 확인할 수 있는 주요 마커이다. Reverse transcription(RT)-PCR로 DDR1과 ZEB1의 mRNA 발현을 관찰하고, CCLE database를 이용하여 남성, 여성 유래의 다양한 기관 암세포주에서 발현의 상관성을 분석하였다. 여성 고유 기관 암 혹은 간암 등 남녀간의 발병률, 사망률에 차이를 보이는 암 종의 여성 유래 암 세포주에서는 ZEB1과 DDR1의 발현이 역으로 나타나 음성 상관관계를 가졌으나, 남성 유래 암세포주는 이러한 상관관계를 보이지 않았다. CCLE database를 이용하여 DDR1과 ZEB1이 여성 유래 기관 암과 간암세포등에서 젠더에 따라 다른 상관관계를 보인다는 것을 최초로 밝혔다.최근 연구자들은 암 발병률과 성별의 상관 관계에 초점을 맞추고 있다. 많은 논문에서 발생률과 사망률 뿐 아니라, 약물 부작용, 약물 독성 반응, 감수성 및 항암제의 배출율이 남녀간에 차이가 있을 밝혔다. 성 편향 경향을 보이는 많은 암들 중에서도 간암은 여성보다 남성에서 유의하게 높은 발병률과 사망률을 보이는 가장 흔한 암이다. 우리는 이전 연구에서 2DE (2-dimensional gel electrophoresis), MALDI-TOF-MS(quantitative image analysis, Matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) 분석을 이용하여 간암 세포 용해물에서 성별 특이 적 또는 침윤성 바이오 마커 후보 물질로 17 가지 단백질을 발견했다. 그 중 암과의 연관성이 확인된 7개의 단백질을 후보 단백질로 삼아 웨스턴 블롯으로 검증 하였다. 7개의 단백질 중 침윤성 후보 물질로 선정한 AnnexinA2(ANXA2)와 28kDa heat shock protein(HSP28)가 프로테옴 분석결과대로 침윤성 세포에서 높은 발현을 보였다. 최근 에스트로겐을 포함한 성호르몬이 암에서 남녀간의 차이를 유발하는 주요한 요인 중 하나로 손꼽힌다. 보다 정확한 실험을 위해 Tet-O-SK-Hep-1 암세포를 사용하여 에스트로겐 수용체를 조절 하여 에스트로겐의 영향을 실험하였다. PubMed를 이용하여 발현량과 생존률(Overall Survival) 간에 성별 의존적 혹은 반대의 상관 관계를 보이는 GLIPR1, CTNNB1, IL-6 및 RHOA의 4가지 유전자를 후보 물질로 선정하였다. CTNNB1, IL6, RHOA의 발현이 높고 GLIPR1의 발현이 낮은 여성 간암 환자가 유의하게 낮은 생존률(OS)을 보임으로써, 이 세 유전자의 여성 간암 환자 특이적인 Gene Signature로서의 가능성을 제안한다.
암은 세계적으로 사망률이 높은 질병 중 하나이다. 백년이 넘는 시간 동안 암에 관한 활발한 연구가 진행되고 있지만 명확한 작용기전은 여전히 밝혀지지 않았다. 암의 사망률이 높은 원인은 전이에 있다. 암의 전이에는 상피-간엽 이행(Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT)이 필수적이며 DDR1(Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1)과 ZEB1(Zinc finger E-box- binding homeobox 1)은 EMT를 확인할 수 있는 주요 마커이다. Reverse transcription(RT)-PCR로 DDR1과 ZEB1의 mRNA 발현을 관찰하고, CCLE database를 이용하여 남성, 여성 유래의 다양한 기관 암세포주에서 발현의 상관성을 분석하였다. 여성 고유 기관 암 혹은 간암 등 남녀간의 발병률, 사망률에 차이를 보이는 암 종의 여성 유래 암 세포주에서는 ZEB1과 DDR1의 발현이 역으로 나타나 음성 상관관계를 가졌으나, 남성 유래 암세포주는 이러한 상관관계를 보이지 않았다. CCLE database를 이용하여 DDR1과 ZEB1이 여성 유래 기관 암과 간암세포등에서 젠더에 따라 다른 상관관계를 보인다는 것을 최초로 밝혔다.최근 연구자들은 암 발병률과 성별의 상관 관계에 초점을 맞추고 있다. 많은 논문에서 발생률과 사망률 뿐 아니라, 약물 부작용, 약물 독성 반응, 감수성 및 항암제의 배출율이 남녀간에 차이가 있을 밝혔다. 성 편향 경향을 보이는 많은 암들 중에서도 간암은 여성보다 남성에서 유의하게 높은 발병률과 사망률을 보이는 가장 흔한 암이다. 우리는 이전 연구에서 2DE (2-dimensional gel electrophoresis), MALDI-TOF-MS(quantitative image analysis, Matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) 분석을 이용하여 간암 세포 용해물에서 성별 특이 적 또는 침윤성 바이오 마커 후보 물질로 17 가지 단백질을 발견했다. 그 중 암과의 연관성이 확인된 7개의 단백질을 후보 단백질로 삼아 웨스턴 블롯으로 검증 하였다. 7개의 단백질 중 침윤성 후보 물질로 선정한 AnnexinA2(ANXA2)와 28kDa heat shock protein(HSP28)가 프로테옴 분석결과대로 침윤성 세포에서 높은 발현을 보였다. 최근 에스트로겐을 포함한 성호르몬이 암에서 남녀간의 차이를 유발하는 주요한 요인 중 하나로 손꼽힌다. 보다 정확한 실험을 위해 Tet-O-SK-Hep-1 암세포를 사용하여 에스트로겐 수용체를 조절 하여 에스트로겐의 영향을 실험하였다. PubMed를 이용하여 발현량과 생존률(Overall Survival) 간에 성별 의존적 혹은 반대의 상관 관계를 보이는 GLIPR1, CTNNB1, IL-6 및 RHOA의 4가지 유전자를 후보 물질로 선정하였다. CTNNB1, IL6, RHOA의 발현이 높고 GLIPR1의 발현이 낮은 여성 간암 환자가 유의하게 낮은 생존률(OS)을 보임으로써, 이 세 유전자의 여성 간암 환자 특이적인 Gene Signature로서의 가능성을 제안한다.
Recently researchers are focusing on the correlation of cancer incidence and gender. It is shown in many papers that incidence and mortality rates, even side effects, drug toxicity, response, susceptibility and clearance of anticancer drugs differ between men and women. From many cancers showing sex...
Recently researchers are focusing on the correlation of cancer incidence and gender. It is shown in many papers that incidence and mortality rates, even side effects, drug toxicity, response, susceptibility and clearance of anticancer drugs differ between men and women. From many cancers showing sex-biased tendency in various aspects, liver cancer is the most common cancer that shows significantly higher incidence and mortality in men than in women. We found 16 proteins as sex-specific or invasive phenotype biomarker candidates from liver cancer cell lysates using MALDI-TOF-MS analysis in previous studies. Candidate proteins were validated by immunoblot analysis. For more accurate experiment, we used Tet-O-SK-Hep-1 cancer cells to modulate estrogen receptor. Recent studies insist that sex hormones play a major role in the pathogenesis and progress of HBV-induced HCC. We validated 4 genes, GLIPR1, CTNNB1, IL-6 and RHOA, which indicate sex-dependent expression or opposite correlation between overall survival and its expression levels. In this paper, we tested sex-specific candidate genes in in vitro experiments by RT-PCR and immunoblot. Cancer is the most common disease that induces high death rate worldwide. Metastasis is the main reason why cancer is so fatal. Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) is essential for metastasis. EMT is a process of losing epithelial phenotype and gaining mesenchymal characteristic for metastasis. ZEB1(Zinc finger E-box- binding homeobox 1) and DDR1(Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) are well known biomarkers to identify EMT. We observed DDR1 and ZEB1 mRNA expression level of male/female originated cancer cell lines by Reverse Transcription (RT)-PCR. DDR1 and ZEB1 mRNA expression showed reverse correlation. Moreover, we used CCLE database to analyze correlation of ZEB1 with DDR1 in various male/female cancer cell lines. In female-derived cancer cell lines including breast cancer and ovary cancer, ZEB1 and DDR1 mRNA expression showed reverse correlation while male-derived cancer cell lines did not. This was the first discovery to analyze sex-specific correlation between DDR1 and ZEB1 mRNA expression.
Recently researchers are focusing on the correlation of cancer incidence and gender. It is shown in many papers that incidence and mortality rates, even side effects, drug toxicity, response, susceptibility and clearance of anticancer drugs differ between men and women. From many cancers showing sex-biased tendency in various aspects, liver cancer is the most common cancer that shows significantly higher incidence and mortality in men than in women. We found 16 proteins as sex-specific or invasive phenotype biomarker candidates from liver cancer cell lysates using MALDI-TOF-MS analysis in previous studies. Candidate proteins were validated by immunoblot analysis. For more accurate experiment, we used Tet-O-SK-Hep-1 cancer cells to modulate estrogen receptor. Recent studies insist that sex hormones play a major role in the pathogenesis and progress of HBV-induced HCC. We validated 4 genes, GLIPR1, CTNNB1, IL-6 and RHOA, which indicate sex-dependent expression or opposite correlation between overall survival and its expression levels. In this paper, we tested sex-specific candidate genes in in vitro experiments by RT-PCR and immunoblot. Cancer is the most common disease that induces high death rate worldwide. Metastasis is the main reason why cancer is so fatal. Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) is essential for metastasis. EMT is a process of losing epithelial phenotype and gaining mesenchymal characteristic for metastasis. ZEB1(Zinc finger E-box- binding homeobox 1) and DDR1(Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) are well known biomarkers to identify EMT. We observed DDR1 and ZEB1 mRNA expression level of male/female originated cancer cell lines by Reverse Transcription (RT)-PCR. DDR1 and ZEB1 mRNA expression showed reverse correlation. Moreover, we used CCLE database to analyze correlation of ZEB1 with DDR1 in various male/female cancer cell lines. In female-derived cancer cell lines including breast cancer and ovary cancer, ZEB1 and DDR1 mRNA expression showed reverse correlation while male-derived cancer cell lines did not. This was the first discovery to analyze sex-specific correlation between DDR1 and ZEB1 mRNA expression.
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