아토피 유무에 따른 유아에서 분리된 Bifidobacterium breve 균주의 비교 유전체 분석 Comparative genome analysis of Bifidobacterium breve strains isolated from infants with or without atopy원문보기
장내미생물은 식이, 지역, 생활환경 등 다양한 요인들에 영향을 받는다. 따라서 같은 가족이라 할지라도 장내미생물 구성에는 차이가 존재한다. 특히, 질병에 걸렸을 경우 장내미생물의 균형이 깨지면서 dysbiosis가 일어나 건강했을 때와는 다른 미생물 구성을 보여준다. 이러한 구성의 변화는 건강한 장내미생물과 dysbiosis가 일어난 장내미생물 간의 기능적 차이를 발생시킨다. 본 연구는 정상군과 아토피 환자의 분변에서 분리한 Bifidobact...
장내미생물은 식이, 지역, 생활환경 등 다양한 요인들에 영향을 받는다. 따라서 같은 가족이라 할지라도 장내미생물 구성에는 차이가 존재한다. 특히, 질병에 걸렸을 경우 장내미생물의 균형이 깨지면서 dysbiosis가 일어나 건강했을 때와는 다른 미생물 구성을 보여준다. 이러한 구성의 변화는 건강한 장내미생물과 dysbiosis가 일어난 장내미생물 간의 기능적 차이를 발생시킨다. 본 연구는 정상군과 아토피 환자의 분변에서 분리한 Bifidobacterium breve 균주의 유전적인 차이를 확인하기 위하여 실시되었다. 총 18명의 유아에게 채취한 분변샘플을 일곱 종류의 배지에 배양하여 34종 66균주를 분리하였다. 이 중 얻은 B. breve 5 균주를 대상으로 면역 분석을 진행한 결과, MHL_0062과 MHL_0043은 MHL_0001에 비해 상대적으로 강한 항염증 반응을 보였다. 전장 유전체 시퀀싱을 통해 얻은 데이터를 바탕으로 비교 유전체 분석을 한 결과, MHL_0062, MHL_0043, MHL_0001, MHL_0068의 단백질 시퀀스의 차이가 존재한다는 것을 확인하였고, 각 균주 내 차이가 나는 6개의 유전자를 파악할 수 있었다. 그 결과 MHL_0043, MHL_0001, MHL_0068은 정상군에서 분리한 MHL_0062에 비해 염증과 관련된 유전자의 발현이 더 많이 되었단 것을 확인할 수 있었다. 이 연구를 통해 확인된 정상군과 아토피 환자 내 장내미생물의 유전적 차이를 바탕으로 추후, 미생물과 아토피의 관계를 시퀀스 수준에서 이해하는 데 도움을 줄 수 있을 것이다.
장내미생물은 식이, 지역, 생활환경 등 다양한 요인들에 영향을 받는다. 따라서 같은 가족이라 할지라도 장내미생물 구성에는 차이가 존재한다. 특히, 질병에 걸렸을 경우 장내미생물의 균형이 깨지면서 dysbiosis가 일어나 건강했을 때와는 다른 미생물 구성을 보여준다. 이러한 구성의 변화는 건강한 장내미생물과 dysbiosis가 일어난 장내미생물 간의 기능적 차이를 발생시킨다. 본 연구는 정상군과 아토피 환자의 분변에서 분리한 Bifidobacterium breve 균주의 유전적인 차이를 확인하기 위하여 실시되었다. 총 18명의 유아에게 채취한 분변샘플을 일곱 종류의 배지에 배양하여 34종 66균주를 분리하였다. 이 중 얻은 B. breve 5 균주를 대상으로 면역 분석을 진행한 결과, MHL_0062과 MHL_0043은 MHL_0001에 비해 상대적으로 강한 항염증 반응을 보였다. 전장 유전체 시퀀싱을 통해 얻은 데이터를 바탕으로 비교 유전체 분석을 한 결과, MHL_0062, MHL_0043, MHL_0001, MHL_0068의 단백질 시퀀스의 차이가 존재한다는 것을 확인하였고, 각 균주 내 차이가 나는 6개의 유전자를 파악할 수 있었다. 그 결과 MHL_0043, MHL_0001, MHL_0068은 정상군에서 분리한 MHL_0062에 비해 염증과 관련된 유전자의 발현이 더 많이 되었단 것을 확인할 수 있었다. 이 연구를 통해 확인된 정상군과 아토피 환자 내 장내미생물의 유전적 차이를 바탕으로 추후, 미생물과 아토피의 관계를 시퀀스 수준에서 이해하는 데 도움을 줄 수 있을 것이다.
Gut microbiota is affected by various factors such as diet, region, and living environment. Consequently, gut microbiota, even belonging to the same family, have differences in terms of composition. In case of a disease, the balance of gut microbiota is disrupted, resulting in dysbiosis, showing...
Gut microbiota is affected by various factors such as diet, region, and living environment. Consequently, gut microbiota, even belonging to the same family, have differences in terms of composition. In case of a disease, the balance of gut microbiota is disrupted, resulting in dysbiosis, showing a different composition of microbes than when they were healthy. This change in composition leads to functional differences between healthy gut microbiota and dysbiosis gut microbiota. This study was conducted to confirm the genetic difference between Bifidobacterium breve strains isolated from feces of control and AD patients. Fecal samples collected from a total of 18 infants and were cultured in seven types of media to isolate 34 species and 66 strains. Among these, the result of performing an immunological analysis on the 5 strains of B. breve obtained, MHL_0062 and MHL_0043 showed relatively strong anti-inflammatory reactions compared to MHL_0001. As a result of comparative genome analysis based on the data obtained through whole genome sequencing, it was confirmed that there existed differences in protein sequences of MHL_0062, MHL_0043, MHL_0001, and MHL_0068, and 6 genes with differences within each strain were identified. As a result, it could be confirmed that MHL_0043, MHL_0001, and MHL_0068 expressed more genes related to inflammation compared to MHL_0062 isolated from the control group. Based on the genetic differences between the gut microbiota in the control group and the AD patients identified through this study, it will be able to help understand the relationship between microbes and atopic dermatitis at the sequence level in the future.
Gut microbiota is affected by various factors such as diet, region, and living environment. Consequently, gut microbiota, even belonging to the same family, have differences in terms of composition. In case of a disease, the balance of gut microbiota is disrupted, resulting in dysbiosis, showing a different composition of microbes than when they were healthy. This change in composition leads to functional differences between healthy gut microbiota and dysbiosis gut microbiota. This study was conducted to confirm the genetic difference between Bifidobacterium breve strains isolated from feces of control and AD patients. Fecal samples collected from a total of 18 infants and were cultured in seven types of media to isolate 34 species and 66 strains. Among these, the result of performing an immunological analysis on the 5 strains of B. breve obtained, MHL_0062 and MHL_0043 showed relatively strong anti-inflammatory reactions compared to MHL_0001. As a result of comparative genome analysis based on the data obtained through whole genome sequencing, it was confirmed that there existed differences in protein sequences of MHL_0062, MHL_0043, MHL_0001, and MHL_0068, and 6 genes with differences within each strain were identified. As a result, it could be confirmed that MHL_0043, MHL_0001, and MHL_0068 expressed more genes related to inflammation compared to MHL_0062 isolated from the control group. Based on the genetic differences between the gut microbiota in the control group and the AD patients identified through this study, it will be able to help understand the relationship between microbes and atopic dermatitis at the sequence level in the future.
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