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DNA 모양에 따른 Eco RI 제한 효소의 절단 반응
Effect of Shape Differences of DNA on the Cleavage Reaction by Eco RI endonuclease

한국생화학회지, v.21 no.3, 1988년, pp.280 - 284  

박해준 (한국과학기술원 생물공학과) ,  이한영 (한국과학기술원 생물공학과) ,  김훈 (한국과학기술원 생물공학과) ,  이현재 (한국과학기술원 생물공학과) ,  박무영 (한국과학기술원 생물공학과)

초록
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초나선형 DNA(Form I)에 대한 Eco RI 제한 효소의 절단 반응은 한가닥만 잘린 open-circular 형태(Form II)의 중간 생성물을 거쳐 직선형 DNA(Form III)를 생성하며, 이 중간 생성물의 축적량은 최적 조건에서 벗어날수록 증가되었다. 이 효소의 Form I, II 그리고 III에 대한 절단 반응은 EtBr의 농도를 높이고, 온도를 낮출수록 저해되었으며, Form II와 Form III의 절단 반응이 Form I에 비하여 EtBr에 의한 저해가 심한 것으로 나타났다. 이 반응들은 낮은 농도의 NaCl, spermine 그리고 spermidine에 의하여 촉진되었고, 높은 농도에서는 현저히 감소되었다. 초나선형과 직선형 DNA의 Km값은 각각 5.8, 8.1nM을 보여 초나선형이 직선형보다 효소에 대한 친화력이 더 크다는 결과를 나타내었다. 효소의 활성은 diisopropylfluoro-phosphate, iodoacetamide 그리고 diethylpyrocarbonate에 민감한 저해를 보였고, trinitrobenzenesulfonate에 의해 저해 현상을 보임으로 효소의 lysine 잔기의 양전하가 DNA의 음전하와 상호작용하고, serine과 histidine 잔기가 촉매작용에 직접 관여한다는 사실을 제시할 수 있었다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

The closed circular form DNA (Form I) was changed into linear form DNA (form III) by Eco RI endonuclease through the intermediate open-circular form (form II), which could be introduced to the second turn-over, and the intermediate form was more accumulated when the condition was more deviated from ...

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