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겔스캐너를 이용한 변성아크릴아마이드 겔의 형광 DNA 검출
Rapid Detection of Fluorescent DNA on Denaturing Polyacrylamide Gel by Using Gel Scanner 원문보기

Korean journal of crop science = 韓國作物學會誌, v.50 spec.1, 2005년, pp.228 - 230  

구자환 (작물과학원) ,  정지웅 (국제미작연구소 한국지소) ,  조영찬 (작물과학원)

초록
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형광 염료와 레이저 겔스캐너 장비를 이용하여 변성아크릴 아마이드 겔에서 전기 영동된 DNA를 신속하고 간편한 방법으로 기존의 은염색법과 비슷한 감도로 검출하고자 하였다. 변성아크릴아마이드 겔을 형광 염료인 SYBR Green (Molecular Probes)이나 Vistra Green (Amersham Bioscience) 0.01 X 희석액 (pH 8)으로 염색한 후 480nm 레이져, 520nm filer 옵션으로 스캔하여 DNA를 검출하였으며, 검출감도는 기존의 은염색법과 비슷하면서 염색 단계를 한 단계로 줄일 수 있었다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

The denature polyacrylamide gel stain silver nitrate is used for routine nucleic acid detection. More sensitive stains, such as Vistra Green, SYBR Green are available to address a broad range of DNA applications requiring lower detection limits in polyacrylamide gel formats. Gel Scanners, laser-scan...

주제어

#polyacrylamide gel   #DNA   #fluorescent   #silver staining   #detection  

AI 본문요약
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* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

문제 정의

  • 그러나 Bassam 등 (1991년)에 의해 개량되어 지금까지 보편적으로 이용되는 박막 겔 은염색법은 고정 (Fix), 세척 (Rime), 염색 (Impregnate), 세척 (Rinse), 발색 (Develop), 종결 (Stop), 세척 (Rinse)의 복잡한 단계와 90분 이상의 시간이 소요되는 단점이있다. 형광염료 (Vistra Green, SYBR Green)와 Gel Scanner (Typhoon Trio, Amersham Biosciences)를 이용하여 DNA 검출 민감도는 은염색법과 거의 동등하며 염색단계와 시간, 비용을 크게 절감할 수 있는 방법을 확립하였기에 소개하고자 한다.

가설 설정

  •  A : polyacrylamide stained with Vistra Green. B : Polyacrylamide stained with silver.
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참고문헌 (3)

  1. Bassam B. J., Caetano-Anolles, and P. M. Gresshoff 1991. Fast andsensitive silver staining ofDNA in polyacrylamidegels. AnalyticalBiochemistry 196 : 80-83. 

  2. Molecular Probes. 2003. SYBR Nucleic Acid Gel Stains. Useful TipsRevised: 26-June-2003.(www.probes.com) 

  3. Amersham Biosciences. 2002. Fluorescence Imaging. principles andmethods.Handbook pp.47-55. 

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