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Microsatellite 의 대립유전자 빈도를 이용한 한우의 경제형질과의 연관성 규명
Potential Allelic Association of Microsatellite Markers on Bovine Chromosome 5 with Carcass Traits in Hanwoo (Korean cattle) 원문보기

생명과학회지 = Journal of life science, v.18 no.9 = no.101, 2008년, pp.1225 - 1229  

오재돈 (한경대학교 유전정보연구소) ,  공홍식 (한경대학교 유전정보연구소) ,  조병욱 (부산대학교 생명자원과학대학 생명자원과학 동물생명전공) ,  이미랑 (부산대학교 생명자원과학대학 생명자원과학 동물생명전공) ,  전광주 (한경대학교 유전정보연구소) ,  이학교 (한경대학교 유전정보연구소)

초록
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본 연구는 한우의 5번 염색체 내에 존재하고 있는 10개의 microsatellite marker의 대립유전자 빈도를 이용하여 한우의 경제형질과의 연관성을 지닌 좌위를 탐색하기 위하여 실시하였다. 한우 326두를 대상으로 10개의 유전좌위를 분석한 결과 총 169개의 대립유전자가 검출되었다. 모든 유전좌위에서 다형성이 검출되었으며 각 유전좌위 별 대립유전자의 수는 9에서 28개로 나타났으며 평균 16.9로 나타났다. 가장 높은 PIC 값을 가진 유전좌위는 DIK2400(0.908)이었으며 가장 낮은 유전좌위는 DIK2718 (0.603)으로 검출되었다. 관측된 이형접합도에서는 DIK1048 (0.655)가 가장 높게 나타났으며, DIK2400 (0.906)은 가장 낮은 것으로 검출되었다. 분석된 MS marker들의 대립유전자의 빈도를 이용하여 경제형질과의 연관성을 탐색하기 위하여 각 경제형질별 육종가를 대상으로 상위그룹과 하위그룹으로 나누어 Chi-square검정을 실시하였다. 분석결과 DIK2828의 239 대립유전자는 근내지방도에서 상위그룹과 하위그룹의 빈도차가 유의적인 차이를 보이는 것으로 나타났다. BMC1009의 279 대립유전자는 도체중과 등지방두께에서 유의적인 차이를 확인하였으며 285대립유전자는 도체중, 등지방두께 그리고 근내지방도에서 유의적인 차이가 확인되었다. DIK4329의 200대립유전자는 등심단면적과 등지방두께에서 유의적인 차이가 확인되었다. 본 연구에서 유의적인 차이가 확인된 유전자좌위는 5번 염색체 내 20 (DIK2828), 41 (BMC1009) 그리고 95 (DIK4329) cM로 나타났다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

A total of 10 polymorphic microsatellite markers on bovine chromosome 5 were used for allelic association tests with phenotypic characteristics in Hanwoo. The data analyzed in this study were collected from 326 steers. Chi-square tests were performed to compare the frequencies of individual alleles ...

주제어

#QTL   #microsatellite   #allelic association   #chromosome 5   #carcass traits   #Hanwoo  

AI 본문요약
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  • In this study, we hypothesized that substantial differ­ences in microsatellite allelic frequencies will exist between the low and high BV groups of Hanwoo. Therefore, allelic associations of microsatellite markers with important eco­ nomic traits could be detected by comparing the allelic fre­quencies between the high and low BV groups of Hanwoo.
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