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문제 정의
- 세 번째로 개선하고자 하는 부분은 노드의 개수증가에 따라 FDP 레이아웃 속도가 급격히 떨어질 수 있기 때문에⑸ 이를 완화하기 위하여 현재 사용중인 동적인 레이아웃에 적절한 고속화 알고리즘을 개발 적용하고자 한다. 마지막으로는 그래프의 편집과 노드, 에지의 다양한 선택 방법, 필터링 방법 등 사용자 편의 기능들을 보완하고자 한다.
- Network and Gene Ontok增y)를 개발하였다. 본 논문에서는 GO와 PPI를 동시에 효율적으로 시각화 하고 연계하여 분석하기 위하여 효율적인 m 네트워크, go의 시각화에 관한 연구와 이둘을 연계하여 분석 가능하게 해주는 시스템 구현에 대한 내용을 다룬다.
- 본 논문에서는 유전자 온톨로지와 단백질 상호 작용네트워日를 각각 좌 우측에 나란히 배치하고 서로 연계하여 효율적으로 단백질 상호 작용 네트워크를 분석 가능하게 하는 시스템을 제안하였다 이를 위해 GO측의시각화는 LCA분석 및 그래프형. 리스트형 시각화를 제굫하며 PPI 측에서는 동적 확장 축소 가능 그래프와 노드고정과 결합한 컨텍스트 기반 탐색기능을 제공 한다, GO의 LCA 분석 기능은 선택된 용어들의 공동 분모를보여 줌으로써 좀 더 효율적인 분석을 가능하게 한다.
- BINGO는 Cytoscape에 Plug-in 형태로 추가 되며 선택된 단백질들과 관련된 GO 노드들을 시각화해서 보여주지만 GO를 탐색하고 GO와 PPL을 연동하는 기능 부분은 미약하다. 이에 대해 본 논문에서는 GO와 PPI 모두를 서로 상호참조 가능한 그래프 형태로 시각화 해주며 효과적으로 탐색가능하고 연동 가능하게 하고자 하였다. 이에 관한 부분은 다음 단락인 구현 항목에서 다룬다.
가설 설정
- A. 선택된 GO 용어 혹은 단백질의 체크 박스에 체크 표시가 된다.
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