선택한 단어 수는 입니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
선택한 단어 수는 30입니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
문제 정의
- 본 연구는 Microsatellite DNA 유전표식을 이용하여 독도지역에 서식하고 있는 자연산 전복집단의 유전적 다양성 및 집단 구조를 파악하여 이 지역의 자원관리 및 조성을 위한 기초 자료를 제공하고자 한다. 또한 독도지역에 서식하고 있는 전복의 유전학적 특성을 규명하는 첫 연구 결과라는 점에서 큰 의의가 있다.
제안 방법
- PCR 의해 증폭된 Microsatellite DNA 단편은 size standard로 GeneScan 400HD ROX (ABI, USA), HiDi formamide와 혼합한 후 유전자형 분석기 (3100 genetic analyzer; ABI, USA) 를 통하여 분석을 하였으며 분석 후에 나타난 피크 정보를 GeneMapper v3.7 software를 이용하여 유전자형을 분석하였다.
- PCR 증폭반응은 얻어진 DNA 시료, 10× 반응완충용액, 10 mM dNTP, f-Taq DNA polymerase (Solgent), 그리고 Table 1에 나타낸 6개의 Microsatellite 유전표식을 이용하여 수행하였다.
- 독도 집단의 유전적 다양성 분석을 위하여 대립유전자 빈도 (allele frequencies), 유전자좌당 대립유전자수 (allele number per locus), 관찰치 이형접합률 (observed heterozygosities, Ho), 기대치 이형접합률 (expected heterozygosities. He).
- 독도집단의 유전적 다양성의 정도는 동일한 방법으로 분석되어진 우리나라의 동·서·남해 6개 지역집단 (Jeong et al,. 2008) 과 비교분석을 통하여 파악하였다.
- 본 연구에서는 높은 변이를 나타내는 6개의 Microsatellite DNA 유전표식을 이용하여 독도지역에 서식하고 있는 자연산 전복집단의 유전적 다양성 및 집단구조를 파악하여 동·서·남해이 6개 지역집단과 비교 분석하였다.
- 이러한 독도집단의 유전적 다양성의 정도를 파악하기위하여 Jeong et al. (2008) 의 동·서·남해 6개 지역집단에서 얻어진 유전적 다양성 결과와 비교하여 보았다.
대상 데이터
- 본 실험에 사용한 전복 시료는 2006년 6월 울릉도 어촌계 해녀들이 채취한 평균 각장 118.53mm의 자연산 전복 60마 이다.
데이터처리
- 그리고 FSTAT version 2.9.3.2 software (Goudet. 1995) 를 이용하여 집단내의 근친도를 나타내는 FIS (inbreeding coefficient) 값을 구한 후 유의성 검정을 하였다.
- 다형성정보지수 (Polymorphism Information Content, PIC) 는 Cervus 2.0 (Marshall et al., 1999) 프로그램 이용하여 구하였으며, GENEPOP version 3.4 software (Raymond and Rousset 1995) 를 사용하여 Markov-chain method에 의한 Fisher's exact test를 하여 Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) 에 일치하는지의 유의성 검정을 하였다.
이론/모형
- 또한 각 지역의 전복집단과의 유전적 유연관계를 조사하기 위하여 MSA (Microsatellite Analyser; Dieringer and Schlötterer, 2002)을 이용하여 Nei's chord distance (1983) 값을 구하였으며 이를 근거로 하여 UPGMA (unweighted pair-group method with arithmetic averages) 방법으로 계통수를 만들어 집단간의 유연관계를 나타내었다.
- 53mm의 자연산 전복 60마 이다. gDNA는 전복 외투막의 조직 일부를 절제하여 킬레이팅 수지법 (chelating resin method; Walsh et al., 1991; Suenaga and Nakamura, 2005) 을 이용하여 추출하였다. PCR 증폭반응은 얻어진 DNA 시료, 10× 반응완충용액, 10 mM dNTP, f-Taq DNA polymerase (Solgent), 그리고 Table 1에 나타낸 6개의 Microsatellite 유전표식을 이용하여 수행하였다.
- 이러한 값을 토대로 UPGMA법을 이용하여 유전적 유연도로 나타내어보았다 (Fig. 1).
성능/효과
- (2008) 의 동·서·남해 6개 지역집단에서 얻어진 유전적 다양성 결과와 비교하여 보았다. 그 결과 6개 지역집단의 대립유전자수는 평균 13.8-15.8개로 독도집단의 14.8개와 큰 차이는 나타나지 않았다. 그러나 평균 관찰치 이형접합체 (Ho) 의 경우 6개 지역집단에서는 0.
- 본 연구에서는 높은 변이를 나타내는 6개의 Microsatellite DNA 유전표식을 이용하여 독도지역에 서식하고 있는 자연산 전복집단의 유전적 다양성 및 집단구조를 파악하여 동·서·남해이 6개 지역집단과 비교 분석하였다. 그 결과 독도지역의 유전적 다양성은 6개 지역집단보다 높게 나타났으며 유전적 거리에 의한 유연관계 분석 결과에 있어서도 이들 집단과는 독립된 집단으로 나타났다. 이러한 결과는 6개 지역집단에 있어 방류 전복의 높은 혼획비율에 의한 자연산 집단의 유전적 다양성이 축소되어진 결과라고 생각되어진다.
- 그 결과 독도집단은 6개 지역집단 모두에 있어 유의한 차이를 나타내었다 (P < 0.05).
- 그 결과 독도집단은 동·서·남해 6개 지역집단과는 독립되어진 형태로 나타났다.
- 그리고 집단내의 근친도를 파악하기 위하여 근교계수 (FIS) 를 분석한 결과 Hdh145 및 Hdh512의 2개의 유전자좌에 있어 유의적으로 높은 근친도를 나타내었으며 독도집단의 평균 근교계수 (FIS)에 있어서도 0.195로 유의적으로 높게 나타났다(P < 0.05).
- 798) 과 비슷한 값을 나타내었다. 또한 집단 내의 근친도를 나타내는 근교계수 (FIS) 를 계산하여 비교해 본 결과, 6개 지역집단에서는 0.195-9.265로 평균 0.233의 높은 값을 나타낸 반면 독도집단은 이중 가장 낮게 나타난 완도집단의 0.195와 같은 값을 나타내었다.
- 이러한 값을 토대로 Markov-chain method에 의한 Fisher's exact test를 하여 Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) 에 일치하는지의 유의성 검성을 한 결과 Hdh145 및 Hdh512의 2개의 유전자좌에 있어 유의적으로 벗어난 결과를 나타내었다 (P < 0.05).
- 이와 같이 독도집단과 우리나라의 동·서·남해의 6개의 지역집단의 유전적 다양성을 비교한 결과 독도집단은 6개의 지역집단 보다 높은 관찰치 (Ho) 및 기대치 (He) 이형접합률, 다양성정보지수 (PIC) 를 나타내었으며 근교계수 (FIS) 의 비교에 있어서도 다른 지역집단보다 낮은 값을 나타내었다.
후속연구
- 따라서 6개 지역집단의 유전적 다양성보다 높게 나타난 독도집단의 유전적 다양성을 유지하고 보존하기 위해서는 이 지역의 유전적 다양성 및 특성을 고려하여 인공종묘의 방류가 이루어져야 하며 방류를 한 이후에도 지속적인 유전학적 모니터링이 필요하다고 생각되어진다.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.