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NTIS 바로가기생명과학회지 = Journal of life science, v.22 no.11 = no.151, 2012년, pp.1587 - 1594
3C (chromatin conformation capture) is a technique to analyze chromatin organization in nuclei of eukaryotic cells. The procedure of 3C includes the formaldehyde treatment of cells to fix interactions between proteins and between proteins and DNA in chromatin, the digestion of fixed chromatin with r...
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핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
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염색체에서 특정 DNA의 부분들이 갖는 공간적 거리가 염기서열 상 2차원 거리와 다를 수 있는 이유는 무엇인가? | 진핵세포의 DNA는 핵 내에서 히스톤(histone)을 포함한 단백질과 결합하여 크로마틴(chromatin)의 형태로 존재한다. 핵은 3차원적 입체 공간이고 크로마틴은 유연성을 가지고 있음으로, 하나의 염색체에서 특정 DNA 부분들 사이의 공간적 거리는 염기서열 상의 2차원적 거리와 다를 수 있다. 즉 염기서열 상에서 수십 또는 수백 Kb 떨어져 있는 두 DNA 부분이 핵 내에서는 아주 가까운 위치에 놓일 수 있다는 것이다. | |
진핵세포의 DNA는 핵 내에서 어떤 형태로 존재하는가? | 진핵세포의 DNA는 핵 내에서 히스톤(histone)을 포함한 단백질과 결합하여 크로마틴(chromatin)의 형태로 존재한다. 핵은 3차원적 입체 공간이고 크로마틴은 유연성을 가지고 있음으로, 하나의 염색체에서 특정 DNA 부분들 사이의 공간적 거리는 염기서열 상의 2차원적 거리와 다를 수 있다. | |
3C 기법은 어떻게 수행하는가? | 3C는 진핵세포의 핵에서 크로마틴의 입체 구조/구성을 알아보는 연구 기법이다. 이 기법은 살아있는 세포를 포름알데히드로 처리하여 단백질들 사이의 결합 및 단백질과 DNA 사이의 결합을 고정시킨 후, 제한효소로 DNA를 절단하고, 그 절편들의 연결 빈도를 측정함으로써 DNA 절편 사이의 물리적 근접성을 보여준다. 이 기법을 이용하여 복합 유전자 좌위인 ${\beta}$-글로빈 좌위에서 locus control region이 전사가 활발한 유전자와 가까이 위치하고 있음이 밝혀졌으며, 이러한 결과는 크로마틴 입체 구조가 유전자 전사 조절에 관여함을 나타낸다. |
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