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문제 정의
- 따라서, 본 연구는 독도에서 지금까지 기록되지 않은 목본 1분류군에 대하여 보고하고자 한다.
제안 방법
- 1997)로 정렬하였으며, 수작업을 거쳐 최종 정렬하였다. ITS와 trnL-trnF에 대한 염기서열은 Genbank의 자료 (Simmons et al. 2008; Mu et al. 2012; Simmons et al. 2012)와 비교하여 각각 염기서열구간을 결정하였다. 정렬결과 gap은 결여형질 (missing data)로 처리하였고, 염기서열 분석은 PAUP Ver.
- PCR 반응액은 SolGentTM Gel & PCR purification system (Solent Co., Korea)으로 정제하였고, 염기서열분석은 automatic sequencer (ABI 3730xl)을 이용하였다.
- Polymerase chain reaction (PCR) 반응용액의 조성은 주형 DNA 20~50 ng, 10X DiaStarTM Tag DNA buffer 0.25 μL, 10 mM의 dNTPs mix 0.5 μL, 10 pmol의 primer (ITS4, ITS5, White et al. 1990, Möller and Cronk 1997;“c”, “f”, Taberlet et al.1991) 각각 1 μL, 1.25 unit의 DiaStarTM Taq DNA Polymerase (SolGent Co., Korea)에 총 25 μL가 되도록 증류수를 조절하여 첨가하였다.
- 염기서열들은 Geneious (R6, Biomatters)로 조합하여 Clustal X (Thompson et al. 1997)로 정렬하였으며, 수작업을 거쳐 최종 정렬하였다. ITS와 trnL-trnF에 대한 염기서열은 Genbank의 자료 (Simmons et al.
대상 데이터
- 본 연구에 사용된 재료는 2013년 5월 31일 서도 정상부에서 채집하였으며, 채집된 표본은 건조표본 (DW 1305060)으로 제작하여 영남대학교 식물표본관 (YNUH)에 보관하였고, 식물의 동정은 문헌 또는 도감을 참고하였다 (Lee 1980, 2003; Kim and Kim 1994a; Lee 1996). 또한, 분자분석을 위한 속내 분류군의 염기서열은 Genbank 데이터베이스의 자료를 이용하였다 (Table 1).
- 본 연구에 사용된 재료는 2013년 5월 31일 서도 정상부에서 채집하였으며, 채집된 표본은 건조표본 (DW 1305060)으로 제작하여 영남대학교 식물표본관 (YNUH)에 보관하였고, 식물의 동정은 문헌 또는 도감을 참고하였다 (Lee 1980, 2003; Kim and Kim 1994a; Lee 1996). 또한, 분자분석을 위한 속내 분류군의 염기서열은 Genbank 데이터베이스의 자료를 이용하였다 (Table 1).
- 재료는 현장에서 채집후 실리카겔을 이용하여 실험실로 운반하여 이용하였다. DNA추출은 20~30 mg의 잎을 Homogenizer (Precellys®24, Bertin Technologies, France)와 CTAB 방법을 이용하여 추출하였다 (Doyle and Doyle 1987).
이론/모형
- DNA추출은 20~30 mg의 잎을 Homogenizer (Precellys®24, Bertin Technologies, France)와 CTAB 방법을 이용하여 추출하였다 (Doyle and Doyle 1987).
- 0b10 (Swofford 2003)로 Two-parameter methods (Kimura 1980)로 계산된 염기변이 값을 기초로 하여 Neighbor-joining (NJ) tree를 산출하였다. 분계도의 지지도 확인을 위한 Bootstrap support (BS, Felsenstein 1985)는 PAUP을 이용하여 Heurestic search (TBR branch swapping, 100 replicates)방법으로 산출하였다. 외군은 선행 문헌(Simmons et al.
- 분계도의 지지도 확인을 위한 Bootstrap support (BS, Felsenstein 1985)는 PAUP을 이용하여 Heurestic search (TBR branch swapping, 100 replicates)방법으로 산출하였다. 외군은 선행 문헌(Simmons et al. 2012)을 기준으로 Celastrus속을 이용하였다.
- 2012)와 비교하여 각각 염기서열구간을 결정하였다. 정렬결과 gap은 결여형질 (missing data)로 처리하였고, 염기서열 분석은 PAUP Ver. 4.0b10 (Swofford 2003)로 Two-parameter methods (Kimura 1980)로 계산된 염기변이 값을 기초로 하여 Neighbor-joining (NJ) tree를 산출하였다. 분계도의 지지도 확인을 위한 Bootstrap support (BS, Felsenstein 1985)는 PAUP을 이용하여 Heurestic search (TBR branch swapping, 100 replicates)방법으로 산출하였다.
성능/효과
- 종의 장거리 산포는 집단의 확산과 집단간 개체의 흐름에 중요한 역할을 한다. 본 연구는 독도에서 발견된 식물을 형태학적 특징과 핵 및 엽록체 DNA의 분자마커를 이용하여 종을 식별한 결과, 참빗살나무 (노박덩굴과)로 확인되었다. 얕은 토양층과 험준한 지형 등 입지적으로 열악한 대양섬인 독도에서 목본의 분포는 의미있는 결과이며, 향후 외부유입종의 지속적인 모니터링이 요구된다.
- 유연관계 분석결과 단성유전을 하는 cpDNA에서는 우리나라에 분포하고 있는 화살나무속의 참빗살나무 (E. hamiltonianus)와 회나무 (E. sachalinensis) 분계조의 BS 가 64%로 분계조내에서 해상력을 나타내고 있지 않는 반면 (Fig. 1B), 양친유전을 하며 비교적 빠른 진화속도를 나타내는 nrDNA에서 회나무와 자매군 (BS 83%)을 이루고 있으나 참빗살나무와 가까운 유연관계 (BS 65~75%)를 나타내고 있고 (Fig. 1A), 좁은잎참빗살나무 (E. maackii)의 경우 두 분류군과 자매군 (BS 66%)을 나타내고 있다 (Fig. 2). ITS 1지역이 포함된 Fig.
후속연구
- )로 판단된다 (Lee 1980, 2003; Kim and Kim 1994a; Lee 1996). 그러나, 발견된 분류군은 생식기관이 없는 어린 개체이고, 기상 등 독도의 접근성이 어려움에 따라 생식기관을 확인하는 것이 용이하지 않으므로 분자자료를 이용한 객관적인 확인이 요구된다.
- 2000; Shin and Kim 2002). 또한, 주로 비둘기과, 지빠귀과, 직박구리과, 되새과 등 조류의 식이식물로 이용될 가능성이 있고, 이동하는 조류의 경우 독도는 중간기착지로서 이용되고 있으므로 지속적으로 독도에 분포하고 있는 식물과 더불어 종의 이입에 대한 산포벡터를 확인하고 시간의 경과에 따른 종의 유입에 대하여 모니터링 및 유입된 분류군의 집단분석을 통하여 유전적 특성과 종분화 등에 관한 연구를 하는 것이 대양섬인 독도의 식물이입과 분포에 대한 실마리를 제공해 줄 것으로 사료된다.
- 본 연구는 독도에서 발견된 식물을 형태학적 특징과 핵 및 엽록체 DNA의 분자마커를 이용하여 종을 식별한 결과, 참빗살나무 (노박덩굴과)로 확인되었다. 얕은 토양층과 험준한 지형 등 입지적으로 열악한 대양섬인 독도에서 목본의 분포는 의미있는 결과이며, 향후 외부유입종의 지속적인 모니터링이 요구된다.
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