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담배가루이(Bemisia tabaci, Aleyrodidae, Hemiptera)에서 Virus-induced Gene Silencing (VIGS) Vector를 이용하기 위한 cDNA Library 제작
Construction of cDNA Library for Using Virus-induced Gene Silencing (VIGS) Vector with the Sweetpotato Whitefly, Bemisia tabaci(Hemiptera: Aleyrodidae) 원문보기

한국응용곤충학회지 = Korean journal of applied entomology, v.54 no.2, 2015년, pp.91 - 97  

고나연 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) ,  임현섭 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) ,  유용만 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) ,  윤영남 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과)

초록
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담배가루이(Bemisia tabaci)는 외래해충으로 바이러스벡터로 작용하여, 토마토의 토마토황하잎말림병바이러스(TYLCV)를 비롯한 약 100여종의 바이러스를 매개하는 중요한 해충이다. 본 연구에서는 VIGS vector를 이용하여 담배가루이 방제를 위한 target 유전자들을 선발하기 위해 gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library 제작을 시도하였다. 첫 번째 방법으로 oligo d(T) primer를 사용하였을 때, 평균 약 1 kb의 insert와 $1.4{\times}10^4cfu$의 titer를 확인하였다. 그러나 insert size가 너무 커서 적절하지 않았다. 두 번째 방법으로 attB-N25 random primer를 이용하고, sonication을 6초 실시하여 다시 진행하였다. 그러나 확인되는 insert size는 다소 컸고, 몇몇은 insert가 너무 작아서 밴드가 확인 되지않았으며, $1.04{\times}10^54cfu$의 titer를 확인할 수 있었다. 세 번째 방법으로는 oligo d(T) primer를 이용하였고, sonication을 2초 실시하였다. 그 결과 300 bp~600 bp size의 insert가 확인되었으나, electro transformation을 사용한 첫번째, 두번째 방법에 비해 heat shock transformation을 사용하여 titer가 $5.2{\times}10^24cfu$로 매우 낮은 것을 확인 할 수 있었다. 결과적으로 cDNA library를 만들 때 먼저 random primer를 사용하여 First strand를 합성하여 poly A를 제거하고, 다음으로 sonication을 1초 실시하여 300~700 bp정도의 적절한 size의 insert를 생성하고, 마지막으로 electro-transformation을 실시하여 transformation 효율을 높인다면 VIGS vector에 적합한 cDNA library를 만들 수 있을 것으로 사료 된다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

The sweetpotato whitefly, Bemisia tabaci, is the major insect pest that transmitted over 100 plant viruses including tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) of tomato plant as virus vector in the world. In this study, cDNA library of whitefly was constructed using Gateway system for selecting target g...

주제어

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문제 정의

  • 본 연구에서는 VIGS 벡터를 사용하여 담배가루이 RNAi 방제를 위한 target유전자를 선발하기 위해 방법을 조금씩 수정해가며 VIGS vector에 적절한 담배가루이 cDNA library를 제작을 시도하였다.
  • 본 연구에서는 VIGS 벡터를 사용하여 담배가루이 RNAi 방제를 위한 target유전자를 선발하기 위해 방법을 조금씩 수정해가며 VIGS vector에 적절한 담배가루이 cDNA library를 제작을 시도하였다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
담배가루이는 무엇인가? 담배가루이(Bemisia tabaci)는 노린재목(Hemiptera) 가루 이과(Aleyrodidae)에 속하며, 세계자연보전연맹에서 지정한 세계 100대 침입해충 중 하나이다(Boykin et al., 2007).
박테리오파지 λ의 site-specific homologous DNA 재조합 방식을 응용한 gateway cloning방법을 통하여 cDNA library를 제작하는 방법의 장점은 무엇인가? , 2006), 박테리오파지 λ의 site-specific homologous DNA 재조합 방식을 응용한 gateway cloning방법을 이용하여 cDNA library를 제작하였다. 이러한 방법은 담배가루이의 다양한 cDNA를 한번에 간단하게 cloning할 수 있어 cDNA library를 제작하기에 적절하다. 뿐만 아니라 att site를 가지는 entry clone에 있는 이 담배가루이 유전자는 att site를 가지는 Destination 벡터라면 어떤 종류의 벡터든 간단하게 cloning이 가능하여 유용하게 사용될 수 있다.
담배가루이는 어떤 해충으로 알려져 있는가? , 2007). 담배가루이는 직접적인 흡즙 피해와 감로배설로 인해 그을음병을 유발하여 시설재배 작물의 수량과 상품성에 큰 영향을 미치는 주요한 해충으로 알려져 있다(Byrne, 1999; Bedford et al., 1994).
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참고문헌 (24)

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