한국의 딸기세균모무늬병 발생분포 및 딸기세균모무늬병균 특성조사 Distribution of Bacterial Angular Leaf Spot of Strawberry and Characterization of Xanthomonas fragariae Strains from Korea원문보기
2012년 11월 국가관리세균병인 딸기세균모무늬병 발생 분포를 조사하였다. 충청남도와 제주도를 제외한 전국 1,482농가포장을 조사한 결과, 경남 진주시 수곡면, 하동군 옥종면 88농가포장과 전북 남원 1농가포장에서 병이 발생되었다. 남원에서 발생된 포장은 병 진단 후 폐원되었다. 2012년 2월에서 2015년 1월까지 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면의 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 2012년 12월 조사에서 수곡면은 45% 발생 후 감소하여 2015년 1월까지 약 5% 발생되었고, 옥종면은 2013년 11월 38% 발생후 감소하여 2015년 1월 약 5% 발생하였다. 분리된 세균의 특성을 조사하였다. 생리생확학적 특성은 X. fragariae 대표 균주와 일치하였다. 딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp), fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD (873 bp) 유전자들을 대상으로 3374 bp 염기의 MLSA 분석 결과를 딸기세균모무늬병 대표 균주와 비교한 결과 모든 유전자는 100% 일치하였다. X. fragariae BC3191과 BC3195에 대한 딸기 품종의 저항성을 조사하였다. 조사된 모든 품종은 딸기세균모무늬병에 감수성이었다. 모든 품종들은 접종 2주 후 접종 부위가 괴저되고 확장되어 저항성 등급 4로 평가되었다.
2012년 11월 국가관리세균병인 딸기세균모무늬병 발생 분포를 조사하였다. 충청남도와 제주도를 제외한 전국 1,482농가포장을 조사한 결과, 경남 진주시 수곡면, 하동군 옥종면 88농가포장과 전북 남원 1농가포장에서 병이 발생되었다. 남원에서 발생된 포장은 병 진단 후 폐원되었다. 2012년 2월에서 2015년 1월까지 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면의 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 2012년 12월 조사에서 수곡면은 45% 발생 후 감소하여 2015년 1월까지 약 5% 발생되었고, 옥종면은 2013년 11월 38% 발생후 감소하여 2015년 1월 약 5% 발생하였다. 분리된 세균의 특성을 조사하였다. 생리생확학적 특성은 X. fragariae 대표 균주와 일치하였다. 딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp), fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD (873 bp) 유전자들을 대상으로 3374 bp 염기의 MLSA 분석 결과를 딸기세균모무늬병 대표 균주와 비교한 결과 모든 유전자는 100% 일치하였다. X. fragariae BC3191과 BC3195에 대한 딸기 품종의 저항성을 조사하였다. 조사된 모든 품종은 딸기세균모무늬병에 감수성이었다. 모든 품종들은 접종 2주 후 접종 부위가 괴저되고 확장되어 저항성 등급 4로 평가되었다.
Nationwide survey for angular leaf spot (ALS) of strawberry caused by Xanthomonas fragariae, a quarantine disease in Korea, was performed in November 2012. In the survey, ALS was observed in eighty eight farmers' fields of Sukok, Jinju and Okjong, Hadong in Gyeongnam Province, and one field in Namwo...
Nationwide survey for angular leaf spot (ALS) of strawberry caused by Xanthomonas fragariae, a quarantine disease in Korea, was performed in November 2012. In the survey, ALS was observed in eighty eight farmers' fields of Sukok, Jinju and Okjong, Hadong in Gyeongnam Province, and one field in Namwon of Jeollabuk Province. The infected field of Namwon closed immediately after the disease diagnosed ALS. In detailed survey of Sukok and Okjong areas during February 2012 to January 2015, ALS occurrence decreased from 45% farmer's fields on December 2012 to 5% on January 2015, and from 38% on November 2013 to 5% on January 2015, respectively. Phenotypic characteristics of the Korean strains were similar to those of the type strain of X. fragariae. A multilocus sequence analysis of Korean strains of X. fragariae was conducted using four genes; dnaK, fyuA, gyrB, and rpoD. All the Korean strains had the same sequences of the four genes. The concatenated sequences of the Korean strains shared 100% with that of the type strain of X. fragariae. All strawberry cultivars tested were susceptible to the strains of X. fragariae two weeks after inoculation. The inoculated sites were necrosis and expanded, which were rated 4 based on evaluation of inoculation site.
Nationwide survey for angular leaf spot (ALS) of strawberry caused by Xanthomonas fragariae, a quarantine disease in Korea, was performed in November 2012. In the survey, ALS was observed in eighty eight farmers' fields of Sukok, Jinju and Okjong, Hadong in Gyeongnam Province, and one field in Namwon of Jeollabuk Province. The infected field of Namwon closed immediately after the disease diagnosed ALS. In detailed survey of Sukok and Okjong areas during February 2012 to January 2015, ALS occurrence decreased from 45% farmer's fields on December 2012 to 5% on January 2015, and from 38% on November 2013 to 5% on January 2015, respectively. Phenotypic characteristics of the Korean strains were similar to those of the type strain of X. fragariae. A multilocus sequence analysis of Korean strains of X. fragariae was conducted using four genes; dnaK, fyuA, gyrB, and rpoD. All the Korean strains had the same sequences of the four genes. The concatenated sequences of the Korean strains shared 100% with that of the type strain of X. fragariae. All strawberry cultivars tested were susceptible to the strains of X. fragariae two weeks after inoculation. The inoculated sites were necrosis and expanded, which were rated 4 based on evaluation of inoculation site.
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문제 정의
딸기 토경재배의 경우, 병원세균은 토양 속 병든 조직에서 생존하여 다음 작기에 전염원으로 작용하여 병을 전파시킬 수 있기 때문에 딸기세균모무늬병이 발생된 포장에서 병든 식물체를 수거하여 태우는 방법으로 병 전염을 억제시킬 수 있을 것으로 생각된다. 국내에 발생된 딸기세균모무늬병 원인세균의 특성을 조사하였다. 분리된 병원세균들의 생리적, 유전학적 특성이 매우 유사한 것으로 나타났다.
본 연구에서 국내 식물검역병인 딸기세균모무늬병 공적방제 지역을 설정하기 위하여 국내 병 발생 지역을 조사하였다. 또한, 국내에 발생하는 딸기세균모무늬병의 원인균인 X.
본 연구에서는 딸기세균모무늬병 공적 방제를 위한 병 발생 지역을 확인하고, 병 발생 지역에서 경시적 병 발생을 조사하였다. 그리고 국내에서 분리된 딸기세균모무늬병균의 생리생화학적, 유전학적 특성과 국내 재배되고 있는 딸기품종들의 저항성 특성 등을 조사하였다.
제안 방법
이것은 현재 국내에 발생하고 있는 딸기세균모무늬병은 같은 지역에서 유입된 병으로 판단할 수 있었다. 2011년과 2012년 경남 하동군 옥종면과 진주시 수곡면에서 수집된 딸기세균모무늬병 시료에서 분리된 세균을 사용하여 생리생화학적 특성과(Schaad 등, 2001) 항존유전자(housekeeping gene) 염기서열을 이용하여 계통수(Young과 Park, 2007)의 특성을 조사하였다. 국내에서 분리된 딸기세균모무늬병 원인 세균들의 생리생화학특성(Table 3)과 유전적 특성(Fig.
35℃에서 생장은 변형된 yeast salts agar (YS; 증류수 1 l당 NH4H2PO4 0.5g, K2HPO4 0.5 g, MgSO4·7H2O 0.2 g, NaCl 5.0 g, yeast extract 1.0g, cresol red 16.0 mg, urea 20.0 g) 배양기에 접종 12일 후 병원세균생장을 조사하였다.
Arabinose를 이용한 산생성과 세균생장에 glycerol과 melibiose 이용은 Dye (1968)의 배양기 C (증류수 1l당 NH4H2PO4 0.5 g, K2HPO4 0.5 g, MgSO4·7H2O 0.2g, NaCl 5g, yeast extract 1 g, agar 12 g, bromocresol purple 0.7 ml of 1.5% alcohol solution; pH 6.8)에 arabinose, gycerol, melibiose를 0.5% 첨가한 배양기에서 14일까지 조사하였다.
5 mg)를 사용하여 Randhawa와 Schaad (1984)의 방법으로 조사하였다. Esculin 가수분해는 YS 배양기에 ferric ammonium citrate 0.05%와 esculin 0.1%를 첨가하여 pH 6.8로 조정된 배양기에서 접종 후 28일 동안 조사하였다. 단백질 가수분해와 litmus milk 조사는 살균된 skim milk에 0.
염기서열분석. Multlocus sequence analysis (MLSA)를 수행하였다. 국내에서 분리된 X.
PCR 증폭 및 유전자 염기서열분석을 위하여 danK 유전자에 대하여 XdanK1F (5’-GGTGGAAGACCTGGTCAAGA-3’)/XdnaK1R (5’-TCCTTGACYTCGGTGAACTC-3’), fyuA 유전자에 대하여 XfyuA1F (5’-AGCTACGAYGTGCGYTACGA-3’)/XfyuA1R (5’-GTTCACGCCRAACTGGTAG-3’), gyrB 유전자에 대하여 XgyrB1F (5’-ACGAGTACAACCCGGACAA-3’)/XgurB1R (5’-CCCATCARGGTGCTGAAGAT-3’), rpoD 유전자에 대하여 XrpoD1F (5’-TGGAACAGGGCTATCTGACC-3’)/XrpoD1R (5’-CATTCYAGGTTGGTCTGRTT-3’) 프라이머 조합을 사용하였다.
딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp),fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD (873 bp) 유전자들을 대상으로 3374 bp 염기의 MLSA 분석 결과를 딸기세균모무늬병 대표 균주와 비교한 결과 모든 유전자는 100% 일치하였다. X.fragariae BC3191과 BC3195에 대한 딸기 품종의 저항성을 조사하였다. 조사된 모든 품종은 딸기세균모무늬병에 감수성이었다.
분리된 세균은 매향을 대상으로 병원성을 검정하였다. YDC 배양기에서 수거된 세균을 OD600=0.1 (~108colony forming unit/ml) 농도로 조정하였다. 세균현탁액을 살균된 1 ml 주사기에 넣고 주사바늘을 제거한 후 잎 뒷면에 수침상이 보일 때까지 주입하였다.
분리된 딸기세균모무늬병균의 생리·생화학반응조사는 Schaad 등(2001)의 추천에 따라 수행하였다. YDC 배양기에서 점질생장은 접종 72시간 후 조사하였다. Gram 반응은 KOH 조사(Suslow 등, 1982)로 대신하였다.
9% 일치하였다. dnaK, fyuA, gyrB, rpoD 유전자들을 순서대로 배열한 3,374 bp염기의 MLSA 염기서열을 사용한 계통수를 분석하였다. 비록 사용된 병원세균의 수가 제한적이지만 계통수 분석에서 Young 등(2007)의 결과와 같이 사용된 X.
순수 분리된 핵산은 위의 프라이머 조합으로 염기서열을 분석하였다. 각 유전자의 염기서열은 BigDye Terminator Ready Reaction Mix ver. 3.1 (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)을 이용하여 각 유전자를 증폭하였으며, 회로순환결정방법으로 염기서열을 결정하였다. ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer로 양방향 염기서열이 결정되었다.
Multlocus sequence analysis (MLSA)를 수행하였다. 국내에서 분리된 X. fragariae의 fyuA, dnaK, gyrB, rpoD 유전자와 GenBank에서 얻은 Xanthomonas속 15종의 대표균주와 X. fragariae 3균주의 유전자 염기서열을 BioEdit ver. 7.2.5 (Hall, 1999)를 사용하여 정렬(alignment)하였다. 정렬된 3,376 points의 염기들은 MEGA 소프트웨어 ver.
본 연구에서는 딸기세균모무늬병 공적 방제를 위한 병 발생 지역을 확인하고, 병 발생 지역에서 경시적 병 발생을 조사하였다. 그리고 국내에서 분리된 딸기세균모무늬병균의 생리생화학적, 유전학적 특성과 국내 재배되고 있는 딸기품종들의 저항성 특성 등을 조사하였다.
8로 조정된 배양기에서 접종 후 28일 동안 조사하였다. 단백질 가수분해와 litmus milk 조사는 살균된 skim milk에 0.004% bromocresol purple이 첨가된 배양기에서 조사하였다. 빙핵생성(ice nucleation)은 Handelsman 등(1996)의 방법으로 조사하였다.
딸기세균모무늬병균의 chaperone protein (dnaK), TonB dependent receptor (fyuA), DNA gyrase subunit B (gyrB), RNA polymerase sigma factor (rpoD) 유전자를 분석하였다(Young과 Park, 2007). PCR 증폭은 상기 PCR 반응액 조성으로 94℃에서 3분 동안 핵산을 변성시킨 후 94℃에서 30초, 57℃에서 30초, 72oC에서 1분 과정을 30회 반복하고 72oC에서 10분 동안 최종 증폭하였다.
2011년 10월 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면에서 딸기세균모무늬병 증상이 있는 병든 조직을 수거하여 실험실에서 병원세균을 분리하였다. 딸기세균모무늬병징이 있는 조직을 70% 알코올에 30초 동안 표면살균하였다. 표면살균된 병든 부위를 작은 조각으로 자르고 50μl 살균수에 담근 후 살균된 루프로 마쇄하였다.
2012년 11월 충청남도와 제주도를 제외한 전국 1,482개 딸기재배농가에서 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 또한 2012년 1월부터 2015년 1월까지 딸기세균모무늬병이 처음 발견된 진주시 수곡면과 하동군 옥동면 딸기재배포장에서 딸기세균모무늬병 발생변화를 관찰하였다. 수곡면과 하동군의 딸기재배포장을 임의로 각 40포장을 선정하여 각 재배포장에서 병 발생을 조사하였다.
본 연구에서 국내 식물검역병인 딸기세균모무늬병 공적방제 지역을 설정하기 위하여 국내 병 발생 지역을 조사하였다. 또한, 국내에 발생하는 딸기세균모무늬병의 원인균인 X. fragariae의 생리생화학적, 유전적 특성과 딸기세균모무늬병균에 대한 국내에서 재배되고 있는 딸기품종의 저항성을 조사하였다.
분리된 세균을 YDC 배양기에 접종 후 5일 동안 26℃에서 배양하였다. 배양된 세균을 수거하여 QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN, Hilden, Germany)를 사용하여 제조자 추천방법으로 핵산을 분리하였다.
병원균이 주입된 잎은 투명 플라스틱 상자에 넣고 7일 후 관찰하였다. 병든 부위에서 위에서 설명한 것과 같이 병원세균을 YDC 배양기에서 재분리하였다. 재분리된 세균의 균총 형태와 색을 접종된 균과 비교하여 확인하였다.
세균현탁액을 살균된 1 ml 주사기에 넣고 주사바늘을 제거한 후 잎 뒷면에 수침상이 보일 때까지 주입하였다. 병원균이 주입된 잎은 투명 플라스틱 상자에 넣고 7일 후 관찰하였다. 병든 부위에서 위에서 설명한 것과 같이 병원세균을 YDC 배양기에서 재분리하였다.
Young 등(2007)은 Xanthomonas속 계통분류에서 사용된fyuA, dnaK, gyrB, rpoD유전자들은 동일종의 스트레인들을 구별할 수 있었다. 본 연구에서 fyuA, dnaK, gyrB, rpoD 유전자를 사용하여, 국내에서 분리된 딸기세균모무늬병균의 항존유전자 염기서열의 다양성을 분석하였다. 조사된 딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp), fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD(873 bp) 유전자들은 X.
병원성 검정. 분리된 세균은 매향을 대상으로 병원성을 검정하였다. YDC 배양기에서 수거된 세균을 OD600=0.
2012년 12월 조사에서 수곡면은 45% 발생 후 감소하여 2015년 1월까지 약 5% 발생되었고, 옥종면은 2013년 11월 38% 발생 후 감소하여 2015년 1월 약 5% 발생하였다. 분리된 세균의 특성을 조사하였다. 생리생확학적 특성은 X.
또한 2012년 1월부터 2015년 1월까지 딸기세균모무늬병이 처음 발견된 진주시 수곡면과 하동군 옥동면 딸기재배포장에서 딸기세균모무늬병 발생변화를 관찰하였다. 수곡면과 하동군의 딸기재배포장을 임의로 각 40포장을 선정하여 각 재배포장에서 병 발생을 조사하였다.
증폭된 핵산은 NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Kit (Macherey-Nagel, Düren, Germany)를 사용하여 제조사 추천방식으로 순수 분리하였다. 순수 분리된 핵산은 위의 프라이머 조합으로 염기서열을 분석하였다. 각 유전자의 염기서열은 BigDye Terminator Ready Reaction Mix ver.
병든 부위에서 위에서 설명한 것과 같이 병원세균을 YDC 배양기에서 재분리하였다. 재분리된 세균의 균총 형태와 색을 접종된 균과 비교하여 확인하였다.
증폭된 핵산은 NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Kit (Macherey-Nagel, Düren, Germany)를 사용하여 제조사 추천방식으로 순수 분리하였다.
현탁액을 –10℃에서 10분 후 빙핵형성을 조사하였다.
대상 데이터
병원균분리. 2011년 10월 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면에서 딸기세균모무늬병 증상이 있는 병든 조직을 수거하여 실험실에서 병원세균을 분리하였다. 딸기세균모무늬병징이 있는 조직을 70% 알코올에 30초 동안 표면살균하였다.
2012년 11월 국가관리세균병인 딸기세균모무늬병 발생 분포를 조사하였다. 충청남도와 제주도를 제외한 전국 1,482농가포장을 조사한 결과, 경남 진주시 수곡면, 하동군 옥종면 88농가포장과 전북 남원 1농가포장에서 병이 발생되었다.
딸기세균모무늬병은 국가에서 관리하는 검역세균병으로(National Plant Quarantine Service,2008), 국내에서 처음 보고(Kwon 등, 2010) 후 다른 지역으로 확산을 확인할 필요가 있었다. 2012년 11월 제주도와 충청남도를 제외한 전국 딸기세균모무늬병 발생조사에서 딸기세균모무늬병은 경상남도 진주시 수곡면과 하동군 옥종면 88개 딸기재배 포장에서 제한적으로 발생하였다(Table 2). 그리고 전라북도 남원시의 1개 재배포장에서 딸기 이상 증상이 발견되었다.
딸기세균모무늬병 발생조사. 2012년 11월 충청남도와 제주도를 제외한 전국 1,482개 딸기재배농가에서 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 또한 2012년 1월부터 2015년 1월까지 딸기세균모무늬병이 처음 발견된 진주시 수곡면과 하동군 옥동면 딸기재배포장에서 딸기세균모무늬병 발생변화를 관찰하였다.
남원에서 발생된 포장은 병 진단 후 폐원되었다. 2012년 2월에서 2015년 1월까지 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면의 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 2012년 12월 조사에서 수곡면은 45% 발생 후 감소하여 2015년 1월까지 약 5% 발생되었고, 옥종면은 2013년 11월 38% 발생 후 감소하여 2015년 1월 약 5% 발생하였다.
딸기세균모무늬병 저항성 조사. 국내에서 분리된 병원세균 BC3191과 BC3195를 사용하였다. 저항성 평가에 사용된 세균 BC3191과 BC3195는 국내에서 분리된 세균의 생리생화학적 특성과 유전적 특성에서 차이를 보이지 않아 임의로 선발하여 사용하였다.
국립원예특작과학원 채소과에서 보존하고 있는 18종류의 딸기품종(금향’, ‘도치노미네’, ‘도치오도메’, ‘대왕’, ‘레트펄’, ‘매향’, ‘보교조생’, ‘베니홋베’, ‘사찌노카’ ,‘설향’, ‘수홍’, ‘숙향’, ‘스위트찰리’, ‘죽향’, ‘아키히메’, ‘옥매’, ‘싼타’, ‘페스티발’)을 분양받아 저항성 조사를 수행하였다.
병 발생 역학조사 결과, 수곡면과 옥종면의 딸기재배는 인근 지역에서 생산된 딸기모종, 또는 자체 생산된 모종을 사용하고 있었다. 그리고 남원시 병 발생농가는 경상남도 진주시에서 딸기모종을 구입하여 재배하였다.
2012년 11월 제주도와 충청남도를 제외한 전국 딸기세균모무늬병 발생조사에서 딸기세균모무늬병은 경상남도 진주시 수곡면과 하동군 옥종면 88개 딸기재배 포장에서 제한적으로 발생하였다(Table 2). 그리고 전라북도 남원시의 1개 재배포장에서 딸기 이상 증상이 발견되었다. 이상 증상이 딸기세균모무늬병으로 진단 후 곧 폐원하였다.
딸기는 25℃–28℃, 상대습도 75%로 유지되는 국립농업과학원 유리온실에서 재배하였다.
국내에서 분리된 병원세균 BC3191과 BC3195를 사용하였다. 저항성 평가에 사용된 세균 BC3191과 BC3195는 국내에서 분리된 세균의 생리생화학적 특성과 유전적 특성에서 차이를 보이지 않아 임의로 선발하여 사용하였다. 국립원예특작과학원 채소과에서 보존하고 있는 18종류의 딸기품종(금향’, ‘도치노미네’, ‘도치오도메’, ‘대왕’, ‘레트펄’, ‘매향’, ‘보교조생’, ‘베니홋베’, ‘사찌노카’ ,‘설향’, ‘수홍’, ‘숙향’, ‘스위트찰리’, ‘죽향’, ‘아키히메’, ‘옥매’, ‘싼타’, ‘페스티발’)을 분양받아 저항성 조사를 수행하였다.
이론/모형
YDC 배양기에서 점질생장은 접종 72시간 후 조사하였다. Gram 반응은 KOH 조사(Suslow 등, 1982)로 대신하였다. 35℃에서 생장은 변형된 yeast salts agar (YS; 증류수 1 l당 NH4H2PO4 0.
0 g) 배양기에 접종 12일 후 병원세균생장을 조사하였다. SX 배양기(증류수 1 l당 starch[soluble-potato] 10.0 g, beef extract 1.0 g, ammonium chloride 5.0 g, K2HPO4 2.0 g, methy violet 2B 10 mg, methy green 20 mg, cycloheximide 50 mg)에서 성장은 Schaad와 White (1974)의 방법으로 조사하였다. 전분 가수분해 조사는 NSCAA 배양기(증류수 1 l당 nutreient agar 23.
분리된 딸기세균모무늬병균의 생리·생화학반응조사는 Schaad 등(2001)의 추천에 따라 수행하였다.
004% bromocresol purple이 첨가된 배양기에서 조사하였다. 빙핵생성(ice nucleation)은 Handelsman 등(1996)의 방법으로 조사하였다. King’s B 배양기에서 3일 배양된 세균을 살균된 ultra-pure water에 현탁시켰다.
0 g, methy violet 2B 10 mg, methy green 20 mg, cycloheximide 50 mg)에서 성장은 Schaad와 White (1974)의 방법으로 조사하였다. 전분 가수분해 조사는 NSCAA 배양기(증류수 1 l당 nutreient agar 23.0 g, starch [soluble-potato] 15.0 g, cycloheximide 50 mg, nitrofurantoin 10 mg, vancomycin 0.5 mg)를 사용하여 Randhawa와 Schaad (1984)의 방법으로 조사하였다. Esculin 가수분해는 YS 배양기에 ferric ammonium citrate 0.
5 (Hall, 1999)를 사용하여 정렬(alignment)하였다. 정렬된 3,376 points의 염기들은 MEGA 소프트웨어 ver. 6.06 (Tamura 등, 2013)의 Jukes-Cantor 모델을 이용하여 neighbor-joining 방법으로 계통수(phylogenetic tree)를 작성하였다.
성능/효과
2012년 2월에서 2015년 1월까지 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면의 딸기세균모무늬병 발생을 조사하였다. 2012년 12월 조사에서 수곡면은 45% 발생 후 감소하여 2015년 1월까지 약 5% 발생되었고, 옥종면은 2013년 11월 38% 발생 후 감소하여 2015년 1월 약 5% 발생하였다. 분리된 세균의 특성을 조사하였다.
fragariae 대표 균주의 각 유전자의 염기서열과 동일하였다. 국내에서 분리된 X. fragariae의 gyrB, fyuA 유전자는 GenBank에 등록된 X. fragariae ICMP 5797과 ICMP 6646 세균과 100% 일치하였으나, dnaK, rpoD 유전자는 각 유전자에 대하여 1염기차이를 보이며 99.9% 일치하였다. dnaK, fyuA, gyrB, rpoD 유전자들을 순서대로 배열한 3,374 bp염기의 MLSA 염기서열을 사용한 계통수를 분석하였다.
그리고 감염된 식물체부위에서 생존하는 병원세균이 토양속에서 생존하여 다음 작기에 건전한 식물체를 침해하는 것으로 알려져 있다(Kennedy와 King, 1962b).그러므로 현재 병 발생 지역에서 딸기모종 및 토양관리를 통하여 병확산 억제 및 박멸이 가능할 것으로 판단되었다. 병 발생 지역인 경남 진주시 수곡면과 하동군 옥종면에서 2012년 2월부터 2015년 1월까지 경시적 병 발생 변화는 딸기세균모무늬병 발생과 확산을 억제시키기 위하여 딸기모종 관리의 중요성을 시사하고 있다.
fragariae 대표 균주와 일치하였다. 딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp),fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD (873 bp) 유전자들을 대상으로 3374 bp 염기의 MLSA 분석 결과를 딸기세균모무늬병 대표 균주와 비교한 결과 모든 유전자는 100% 일치하였다. X.
조사된 모든 품종은 딸기세균모무늬병에 감수성이었다. 모든 품종들은 접종 2주 후 접종 부위가 괴저되고 확장되어 저항성 등급 4로 평가되었다.
이상 증상이 딸기세균모무늬병으로 진단 후 곧 폐원하였다. 병 발생 역학조사 결과, 수곡면과 옥종면의 딸기재배는 인근 지역에서 생산된 딸기모종, 또는 자체 생산된 모종을 사용하고 있었다. 그리고 남원시 병 발생농가는 경상남도 진주시에서 딸기모종을 구입하여 재배하였다.
fragariae CFBP 6771PT)과 뚜렷한 차이를 보였다(Table 3). 분리된 세균들은 Gram 음성이었고, YDC 배양기에서 점액질성장, 전분가수분해, 빙핵형성 등은 양성반응을 보였고, 35℃에서 성장, SX 배양기에서성장, esculin 가수분해, 단백질분해 arabinose를 이용한 산생성, 성장에 글리세롤과 melibiose 이용 등은 음성반응을 보였다. 그리고 litmus milk에서 알카리를 생성하였다(Table 3).
1주일 후부터 병환부는 괴저증상으로 변하고 확대되었다. 이상의 결과는 Maas 등(2000)의 저항성 등급을 근거로 국내에서 재배되는 딸기품종들의 저항성 등급4와 일치하였다.
본 연구에서 fyuA, dnaK, gyrB, rpoD 유전자를 사용하여, 국내에서 분리된 딸기세균모무늬병균의 항존유전자 염기서열의 다양성을 분석하였다. 조사된 딸기세균모무늬병균의 dnaK (940 bp), fyuA (698 bp), gyrB (865 bp), rpoD(873 bp) 유전자들은 X. fragariae 대표 균주의 각 유전자의 염기서열과 동일하였다. 국내에서 분리된 X.
fragariae BC3191과 BC3195에 대한 딸기 품종의 저항성을 조사하였다. 조사된 모든 품종은 딸기세균모무늬병에 감수성이었다. 모든 품종들은 접종 2주 후 접종 부위가 괴저되고 확장되어 저항성 등급 4로 평가되었다.
fragariae의 종 내 변이를 생리생화학반응(Van den Mooter와 Swings, 1990), 지방산(Janse등, 2001; Roberts 등, 1998), 단백질(Janse 등, 2001), restrictionfragment length polymorphism (Roberts 등, 1998), repetitivesequence PCR (Opgenorth 등, 1996; Stöger 등, 2008), randomamplfied polymorphic DNA PCR (Pooler 등, 1996), MLSA (Young과 Park, 2007) 등으로 분석하였으나 종 내에 뚜렷한 차이를 보이지 않았다. 한국에서 분리된 X. fragariae의 조사된 생리생화학반응 특성은 Van den Mooter와 Swings (1990)의 결과와 X. fragariae의 대표 균주(LMG 708T)의 특성과 일치하였고, 딸기세균잎마름병균(X. arboricola pv. fragariae CFBP 6771PT)과 뚜렷한 차이를 보였다(Table 3). 분리된 세균들은 Gram 음성이었고, YDC 배양기에서 점액질성장, 전분가수분해, 빙핵형성 등은 양성반응을 보였고, 35℃에서 성장, SX 배양기에서성장, esculin 가수분해, 단백질분해 arabinose를 이용한 산생성, 성장에 글리세롤과 melibiose 이용 등은 음성반응을 보였다.
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
딸기세균모무늬병의 피해는?
딸기세균모무늬병은 딸기생산에 중요한 병이다. 본 병에 의한 경제적 손실은 정확히 기록되어 있지 않으나 미국 플로리다에서 연간 8% (Roberts 등, 1997), 위스콘신에서75% (Epstein, 1996), 유럽에서 10%–20% (Elphinston, 2005) 생산량을 감소시키는 것으로 알려져 있다. 또한, 꽃받침 감염에 의하여 상품성을 저하시킨다(Maas 등, 1995). 그리고 엽병과 지제부에 병이 발생하면 전신 감염되어 묘가 죽게된다(Hildebrand 등, 1967). X.
한국에 보고된 딸기세균모무늬병 발생은 언제 어디에서 일어났나?
fragariae에 의한 딸기세균잎마름병(bacterial leaf blight of strawberry) (Janse 등,2001)이 보고되었다. 한국에서는 2010년 7월 경상남도 진주시 수곡면과 하동군 옥동면에서 X. fragariae에 의한 딸기세균모무늬병 발생이 보고되었다(Kwon 등, 2010).
딸기세균모무늬병을 예방하는 방법은?
스트렙토마이신과 옥시테트라사이클린 같은 항생제는 병원세균 자체에 대해 효과적(Alippi 등,1989)이나 포장에서 사용할 때 약제 저항성균이 출현될 수있고(Stall과 Thayer, 1962), 현재까지 딸기세균모무늬병균 방제용 등록된 항생제가 없다(Roberts 등, 1997). 딸기세균모무늬병은 건전한 모종 사용, 재배지 습도와 양분관리, 보호살균제 살포 등의 방법으로 예방하고 있다. 병이 발생되면 동제 화합물과 만코제브 혼합물 살포로 병을 억제시킬 수 있으나 이들 화합물의 잦은 살포는 식물에 독성을 끼칠 수 있다(Conover와 Gerhold, 1981; Marco와 Stall, 1983; Roberts 등,1997).
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