[논문]토마토 뿌리에서 분리한 식물생육촉진 세균 Bacillus velezensis T20E-257균주의 유전체 염기서열

이신애; 김상윤; 상미경; 송재경; 원항연

doi:10.7845/kjm.2017.7079

토마토 뿌리에서 분리한 식물생육촉진 세균 Bacillus velezensis T20E-257균주의 유전체 염기서열
Complete genome sequence of Bacillus velezensis T20E-257, a plant growth-promoting bacterium, isolated from tomato (Solanum lycopersicum L.) root 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.53 no.4, 2017년, pp.342 - 343

이신애 (국립농업과학원 농업미생물과) , 김상윤 (국립농업과학원 농업미생물과) , 상미경 (국립농업과학원 농업미생물과) , 송재경 (국립농업과학원 농업미생물과) , 원항연 (국립농업과학원 농업미생물과)

초록
AI-Helper

토마토 뿌리에서 분리한 Bacillus velezensis T20E-257 균주는 식물촉진효과가 있었고, 본 연구에서 T20E-257 균주의 유전체 서열을 해독하였다. 유전체 초안에서 포함된 2개 contig는 총 염기서열이 3,900,066 bp고, G + C content가 46.7%이었다. 유전체에서 단백질 유전자 3,708개, rRNA 유전자 27개, tRNA 유전자 86개를 확인하였다. 항균활성을 가지는 2차 대사산물 생합성 관련 유전자군과 식물생육촉진에 관여하는 IAA와 2,3-butadiol 생합성 관련 유전자를 T20E- 257 균주 유전체에서 확인하였다.

Abstract ▼ AI-Helper

Bacillus velezensis T20E-257 was isolated from the root tissue of a tomato plant and exhibited plant growth-promoting activity. Here we present the complete genome of strain T20E-257. The genome contains 3,900,066 base pairs with a G + C content of 46.7% in 2 contigs. The genome includes 3,708 coding sequences, 27 rRNAs, and 86 tRNAs. We found gene clusters encoding secondary metabolites with an antimicrobial activity and genes related to the production of indole-3-acetic acid and 2,3-butanediol, which play a role in plant growth and health.

주제어

AI 본문요약
AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

제안 방법

유전체에서 단백질 유전자 3,708개, rRNA 유전자 27개, tRNA 유전자 86개를 확인하였다. 항균활성을 가지는 2차 대사산물 생합성 관련 유전자군과 식물생육촉진에 관여하는 IAA와 2,3-butadiol 생합성 관련 유전자를 T20E- 257 균주 유전체에서 확인하였다.

대상 데이터

7%이었다. 유전체에서 단백질 유전자 3,708개, rRNA 유전자 27개, tRNA 유전자 86개를 확인하였다. 항균활성을 가지는 2차 대사산물 생합성 관련 유전자군과 식물생육촉진에 관여하는 IAA와 2,3-butadiol 생합성 관련 유전자를 T20E- 257 균주 유전체에서 확인하였다.

질의응답

핵심어	질문	논문에서 추출한 답변
	Bacillus velezensis T20E-257 균주는 어디서 분리되었는가?	토마토 뿌리에서 분리한 Bacillus velezensis T20E-257 균주는 식물촉진효과가 있었고, 본 연구에서 T20E-257 균주의 유전체 서열을 해독하였다. 유전체 초안에서 포함된 2개 contig는 총 염기서열이 3,900,066 bp고, G + C content가 46.
	Bacillus velezensis T20E-257 균주는 어떠한 효과를 지니는가?	토마토 뿌리에서 분리한 Bacillus velezensis T20E-257 균주는 식물촉진효과가 있었고, 본 연구에서 T20E-257 균주의 유전체 서열을 해독하였다. 유전체 초안에서 포함된 2개 contig는 총 염기서열이 3,900,066 bp고, G + C content가 46.
	T20E-257 균주의 염기서열 길이 및 GC ratio는 어떠한가?	토마토 뿌리에서 분리한 Bacillus velezensis T20E-257 균주는 식물촉진효과가 있었고, 본 연구에서 T20E-257 균주의 유전체 서열을 해독하였다. 유전체 초안에서 포함된 2개 contig는 총 염기서열이 3,900,066 bp고, G + C content가 46.7%이었다. 유전체에서 단백질 유전자 3,708개, rRNA 유전자 27개, tRNA 유전자 86개를 확인하였다.

참고문헌 (8)

Aziz, R.K., Bartels, D., Best, A.A., De Jongh, M., Disz, T., Edwards, R.A., Formsma, K., Gerdes, S., Glass, E.M., Kubal, M., et al. 2008. The RAST server: Rapid annotations using subsystems technology. BMC Genomics 9, 75.

상세보기
Blin, K., Wolf, T., Chevrette, M.G., Lu, X., Schwalen, C.J., Kautsar, S.A., Suarez Duran, H.G., de Los Santos, E.L.C., Kim, H.U., Nave, M., et al. 2017. Antismash 4.0-improvements in chemistry prediction and gene cluster boundary identification. Nucleic Acids Res. 45, W36-W41.

상세보기
Chowdhury, S.P., Hartmann, A., Gao, X., and Borriss, R. 2015. Biocontrol mechanism by root-associated Bacillus amyloliquefaciens FZB42 - a review. Front. Microbiol. 6, 780.
Kim, S.Y., Lee, S.Y., Weon, H.Y., Sang, M.K., and Song, J. 2017. Complete genome sequence of Bacillus velezensis M75, a biocontrol agent against fungal plant pathogens, isolated from cotton waste. J. Biotechnol. 241, 112-115.

상세보기
Liu, G., Kong, Y., Fan, Y., Geng, C., Peng, D., and Sun, M. 2017. Whole-genome sequencing of Bacillus velezensis LS69, a strain with a broad inhibitory spectrum against pathogenic bacteria. J. Biotechnol. 249, 20-24.

상세보기
Meng, Q., Jiang, H., and Hao, J.J. 2016. Effects of Bacillus velezensis strain BAC03 in promoting plant growth. Biol. Control 98, 18-26.

상세보기
Spaepen, S. and Vanderleyden, J. 2011. Auxin and plant-microbe interactions. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 3, a001438.
Yi, H.S., Ahn, Y.R., Song, G.C., Ghim, S.Y., Lee, S., Lee, G., and Ryu, C.M. 2016. Impact of a bacterial volatile 2,3-butanediol on Bacillus subtilis rhizosphere robustness. Front. Microbiol. 7, 993.

상세보기

저자의 다른 논문 :

LOADING...

내보내기 구분	파일저장 인쇄 메일전송
구성항목	기본정보 상세정보 관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관 관리번호, 논문명, 대등논문명, 저자 , 저널/프로시딩명, 발행기관, 발행년, 발행언어, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, ISBN, ISSN, 주제분야, 키워드, 초록(한글), 초록(영문), 저자(소속기관)
저장형식	Text(ASCII format) Excel format RefWorks Direct Export RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley
메일정보	받는사람 (필수) @ 보내는사람 (선택) @ 제목 내용 KISTI 검색결과 이메일 서비스
안내	총 건의 자료가 검색되었습니다. 다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000) 검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다. 데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요) 다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다. 파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오. ~ Text(ASCII format) Excel format

연합인증