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계통분류학적 연구를 위한 우포늪에서 분리된 박테리아 Spirosoma rigui KCTC 12531T의 완전한 게놈 서열
Complete genome sequence of Spirosoma rigui KCTC 12531T, a bacterium isolated from fresh water from the Woopo wetland for taxonomic study 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.53 no.3, 2017년, pp.227 - 229  

김동욱 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과) ,  김주영 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과) ,  김수정 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과) ,  김민지 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과) ,  이주연 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과) ,  김명겸 (서울여자대학교 자연과학대학 생명환경공학과)

초록
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이 연구에서는 우포늪의 깨끗한 물에서 분리된 Spirosoma rigui KCTC $12531^T$의 완전한 게놈 서열을 분석하였다. 이 게놈은 G + C 함량이 54.4%인 5,828,404 bp으로 구성되어 있고 4,774개의 유전자와 4,647개의 단백질 코딩 유전자, 9개의 rRNA 유전자 그리고 43개의 tRNA 유전자 및 73개의 위유전자(pseudogene)를 포함하고 있다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Spirosoma rigui KCTC $12531^T$ was isolated from fresh water from the Woopo wetland, Korea. In this study, we report the complete genome sequence of a bacterium Spirosoma rigui KCTC $12531^T$, its complete genome sequence was obtained using the PacBio RS II platform. The genome...

주제어

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문제 정의

  • However, whole genomic information of isolates from this site is still lacking. Therefore, we sequenced and analyzed the genome of Spirosoma rigui KCTC 12531T for the increase of understanding of ecological niche of wetland.
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참고문헌 (7)

  1. Baik, K.S., Kim, M.S., Park, S.C., Lee, D.W., Lee, S.D., Ka, J.O., Choi, S.K., and Seong, C.N. 2007. Spirosoma rigui sp. nov., isolated from fresh water. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57, 2870-2873. 

  2. Baik, K.S., Park, S.C., Kim, E.M., Bae, K.S., Ahn, J.H., Ka, J.O., Chun, J., and Seong, C.N. 2008. Diversity of bacterial community in freshwater of Woopo wetland. J. Microbiol. 46, 647-655. 

  3. Grant, J.R. and Stothard, P. 2008. The CGView Server: A comparative genomics tool for circular genomes. Nucleic. Acids. Res. 36, W181-W184. 

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  7. Tatusova T., DiCuccio, M., Badretdin, A., Chetvernin, V., Ciufo, S., and Li, W. 2013. Prokaryotic Genome Annotation Pipeline The NCBI Handbook [Internet] 2nd ed. pp. 1-23. National Center for Biotechnology Information, Bethesda, MD, USA. 

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