2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양으로부터 식물기생선충의 토양 내 감염현황을 조사하였다. 그 결과 뿌리썩이선충(Pratylenchus)과 뿌리혹선충(Meloidogyne)이 11%와 3%로 검출되어 딸기 육묘장의 문제선충으로 나타났다. 육묘 형태별로는 토경육묘에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 발생빈도가 다른 육묘방법에 비해 높았고, 상토를 이용한 비가림 포트육묘에서는 식물기생선충이 검출되지 않았다. 뿌리썩이선충은 딸기뿌리썩이선충(P. penetrans)과 사과뿌리썩이선충(P. vulnus) 2종이 확인 되었으며, 뿌리혹선충은 당근뿌리혹선충(M. hapla) 1종이 확인되었다. 사과뿌리썩이선충은 딸기 자묘를 통해 식물기생선충이 감염되지 않은 건전한 토양으로의 확산이 확인되었다(33%).
2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양으로부터 식물기생선충의 토양 내 감염현황을 조사하였다. 그 결과 뿌리썩이선충(Pratylenchus)과 뿌리혹선충(Meloidogyne)이 11%와 3%로 검출되어 딸기 육묘장의 문제선충으로 나타났다. 육묘 형태별로는 토경육묘에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 발생빈도가 다른 육묘방법에 비해 높았고, 상토를 이용한 비가림 포트육묘에서는 식물기생선충이 검출되지 않았다. 뿌리썩이선충은 딸기뿌리썩이선충(P. penetrans)과 사과뿌리썩이선충(P. vulnus) 2종이 확인 되었으며, 뿌리혹선충은 당근뿌리혹선충(M. hapla) 1종이 확인되었다. 사과뿌리썩이선충은 딸기 자묘를 통해 식물기생선충이 감염되지 않은 건전한 토양으로의 확산이 확인되었다(33%).
To survey the incidence of plant-parasitic nematode in strawberry nursery, 117 soil samples were collected from main producing area of strawberry nursery plants in 2016. The incidences of two major problematic nematodes such as root-lesion nematodes (Pratylenchus spp.) and root-knot nematodes (Meloi...
To survey the incidence of plant-parasitic nematode in strawberry nursery, 117 soil samples were collected from main producing area of strawberry nursery plants in 2016. The incidences of two major problematic nematodes such as root-lesion nematodes (Pratylenchus spp.) and root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) were 11% and 3%, respectively. Strawberry nurseries using upland soil either in fields or in plastic-houses showed were higher infection rates of Pratylenchus spp. or Meloidogyne spp. than others. On the other hand, a strawberry nursery using pots filled with bed soil in plastic-house was the lowest infection rate with 0%. Phylogenetic relationships and distance analysis were performed for identification of Pratylenchus spp. and Meloidogyne spp. detected from strawberry nurseries. As the results, they were identified as Pratylenchus penetrans, Pratylenchus vulnus and Meloidogyne hapla. Meanwhile, when nursery plants of strawberry infested with P. vulnus transplanted to pots filled with sterilized soil, P. vulnus was detected from soil in pots as 33% frequency. Thus, P. vulnus can be spread through nursery plants of strawberry infested with that. These studies suggested that Pratylenchus spp. and Meloidogyne spp. were ploblematic nematodes in major areas of strawberry nursery plants and P. vulnus could be spread through nursery plants of strawberry.
To survey the incidence of plant-parasitic nematode in strawberry nursery, 117 soil samples were collected from main producing area of strawberry nursery plants in 2016. The incidences of two major problematic nematodes such as root-lesion nematodes (Pratylenchus spp.) and root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) were 11% and 3%, respectively. Strawberry nurseries using upland soil either in fields or in plastic-houses showed were higher infection rates of Pratylenchus spp. or Meloidogyne spp. than others. On the other hand, a strawberry nursery using pots filled with bed soil in plastic-house was the lowest infection rate with 0%. Phylogenetic relationships and distance analysis were performed for identification of Pratylenchus spp. and Meloidogyne spp. detected from strawberry nurseries. As the results, they were identified as Pratylenchus penetrans, Pratylenchus vulnus and Meloidogyne hapla. Meanwhile, when nursery plants of strawberry infested with P. vulnus transplanted to pots filled with sterilized soil, P. vulnus was detected from soil in pots as 33% frequency. Thus, P. vulnus can be spread through nursery plants of strawberry infested with that. These studies suggested that Pratylenchus spp. and Meloidogyne spp. were ploblematic nematodes in major areas of strawberry nursery plants and P. vulnus could be spread through nursery plants of strawberry.
* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.
문제 정의
딸기의 경우 런너를 통해 생성되는 자묘를 모종으로 이용하기 때문에 딸기 주요 기생선충이 자묘 뿌리에묻은 토양을 통해서 확산될 가능성이 있을 것으로 생각된다. 그러나 본 연구에서는 뿌리썩이선충이 감염된 토양을 제거한 자묘를 통해서도 이들 선충이 다른 포장으로 확산될수있는지 여부를 확인하고자 하였다. 그결과, 토양이 묻지 않은 자묘를 통해서도 뿌리썩이선충이 확산될 수 있음을 확인하였다.
이에 따라, 본 연구에서는 딸기 육묘장의 지역, 육묘형태 및 육묘에 이용되는 토양종류별 식물기생선충의 감염현황을 조사하고, 문제 선충의 종을 동정하며, 이들이 자묘를 통해 인근지역이나 타지역의 딸기 본포장으로 확산될 수 있는지 여부를 조사하고자 하였다.
제안 방법
그 결과 뿌리썩이선충의 모든 시료로부터 약 750bp의 증폭산물을 얻었으며, 뿌리혹선충의 모든 시료로부터 약 500 bp의 증폭산물을 얻었다(data not shown). DNA 염기서열을 기반으로 분자생물학적 계통분석을 위해 각 선충 표준집단의 PCR 증폭산물에 대한 DNA 염기서열 분석을 수행하였으며, 이를 통해 작성한 분자생물학적 계통수는 Fig. 1, 2와 같다. 부여 1개, 담양 1개와 순천 3개 포장에서 각각 검출된 뿌리썩이선충과 담양 1개, 순천 1개 포장에서 각각 검출된 뿌리혹선충의 분자생물학적 계통분석 결과, 딸기뿌리썩이선충(Pratylenchus penetrans)과 사과뿌리썩이선충(P.
PCR 결과는 전기영동장치(Mupid eXu; ADVANCE, Tokyo, Japan)를 이용하여 1% 아가로오스겔, 1× TAE buffer (0.04 M Tris-acetate, 0.001 MEDTA)에서 100 V, 25 mA로 25분간 전기영동한 다음, UV장치(UVCI-1100; Major Science, New Taipei City, Taiwan)에서 확인하였다.
PCR을 위해 template DNA 4 μl, PCR premix (HelixAmpTM Ready-2X-Go Series; Nanohelix, Daejeon, Korea) 15 μl, forward와 reverse primer 각각 0.5 μl와 triple distilled water 30 μl를 0.2 ml centrifuge 튜브에 넣고 혼합하였다.
국내 딸기 육묘장의 주요 문제 선충 종 동정을 위해 부여 1개, 담양 1개와 순천 3개 포장으로부터 분리된 뿌리썩이선충과 담양 1개, 순천 1개 포장으로부터 분리된 뿌리혹선충을각각 3–10마리씩 표준집단으로 선발하여 Iwahori 등(2000)의 방법을 통해 genomic DNA를 추출하였다(Table 1).
딸기 육묘장의 문제 선충으로 나타난 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 종을 확인하기 위해 유전자 분석을 수행하였다(Fig. 1). 유전자 분석을 위해 뿌리썩이선충은 28S rRNA 유전자 부위 마커를, 뿌리혹선충은 COII 유전자 부위 마커를 선발하여 PCR을 수행하였다.
48시간 경과 후, 변형시킨 Baermann 깔때기의 고무튜브에 모인 선충을 15 ml 플라스틱 튜브를 이용하여 회수하였다. 분리된 선충은 실체현미경(MZ12; Leica, Wetzlar, Germany)을 이용하여 50배율로 관찰하면서 식물기생선충의 종류와 밀도를 조사하였다.
뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 PCR 증폭산물은 PCR Purification Kit (Macherey-Nagel, Düren, Germany)를 이용하여 정제하였으며, DNA 염기서열은 (주)제노텍 유전체분석센터에서 Sanger dideoxy sequencing 기반 장비(ABI PRISM 3730xlDNA sequencer; Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)를 이용하여 분석하였다.
뿌리썩이선충의 PCR은 28S rRNA D2–D3 expansion segments 부위 유전자에 대한 universal primer인 #D2A (forward primer, 5’-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3’)와 #D3B(reverse primer, 5’-TCGGAAGGAACCAGCTACTA-3’)를 이용하여 수행하였다(Nunn, 1992).
정식 33일후, 토양 내 뿌리썩이선충 밀도를 확인하기 위해 20 mesh와 400 mesh 체를 이용한 체법과 Baermann 깔때기법으로 선충을 분리하였다. 실체현미경(MZ12)을 이용하여 분리한 선충 시료에서 뿌리썩이선충의 존재 여부와 밀도를 확인하였다.
1). 유전자 분석을 위해 뿌리썩이선충은 28S rRNA 유전자 부위 마커를, 뿌리혹선충은 COII 유전자 부위 마커를 선발하여 PCR을 수행하였다. 그 결과 뿌리썩이선충의 모든 시료로부터 약 750bp의 증폭산물을 얻었으며, 뿌리혹선충의 모든 시료로부터 약 500 bp의 증폭산물을 얻었다(data not shown).
2016년6월 24일부터 9월 1일까지 충남의 2개 지역(논산, 부여), 전남의 3개 지역(담양, 곡성, 순천)과 경남의 2개 지역(진주, 밀양) 총 7개 지역의 딸기 육묘장으로부터 117점의 토양시료를 채취하였다. 토양시료는 육묘장의 지역, 육묘형태 및 육묘토양 종류를 기준으로 구분하여 채취하였다. 모든 시료는 분석에 사용하기 전까지 10°C 저온창고에 보관하였다.
혼합한 0.2 ml의 튜브를 PCR cycler (PTC-200; MJ Research, Alameda, CA, USA)를 이용하여 뿌리썩이선충은 94°C에서 1분간 denaturation, 55°C에서 40초간 annealing, 72°C에서 1분간 extension 과정을 35회 반복하였으며, 뿌리혹선충은 94°C에서 1분간 denaturation, 48°C에서 1분간 annealing, 68°C에서 3분간 extension 과정을 35회 반복하였다.
대상 데이터
2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양으로부터 식물기생선충의 토양 내 감염현황을 조사하였다. 그 결과 뿌리썩이선충(Pratylenchus)과 뿌리혹선충(Meloidogyne)이 11%와 3%로 검출되어 딸기 육묘장의 문제선충으로 나타났다.
2016년 8월 9일, 순천의 사과뿌리썩이선충(Pratylenchus vulnus)이 감염된 딸기 노지 토경육묘장으로부터 생산된 자묘를 3포기 채취하였다.
2016년6월 24일부터 9월 1일까지 충남의 2개 지역(논산, 부여), 전남의 3개 지역(담양, 곡성, 순천)과 경남의 2개 지역(진주, 밀양) 총 7개 지역의 딸기 육묘장으로부터 117점의 토양시료를 채취하였다. 토양시료는 육묘장의 지역, 육묘형태 및 육묘토양 종류를 기준으로 구분하여 채취하였다.
4%로 나타났다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 M. hapla (AY757902,KF993633), Meloidogyne chitwoodi (KF993641)와 M. enterolobii (KF993632)를 이용하였다. SCN07, DY14와 M.
데이터처리
뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 PCR 증폭산물은 PCR Purification Kit (Macherey-Nagel, Düren, Germany)를 이용하여 정제하였으며, DNA 염기서열은 (주)제노텍 유전체분석센터에서 Sanger dideoxy sequencing 기반 장비(ABI PRISM 3730xlDNA sequencer; Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)를 이용하여 분석하였다. 분석 결과로부터 Chromas Lite 2.0, EditSeq 5.05와 SeqMan 5.05 프로그램을 이용하여 DNA 염기서열을 결정하였으며, 미국국립생물정보센터(Nationa Center for Biotechnology Information, NCBI)에 기등록된 데이터들과 함께 Clustal X 1.83의 기본값으로 정렬하였다. 분자생물학적 계통수는 Mrbayes 3.
정확한 종 동정을 위해 MEGA 6.06 프로그램을 이용하여 distance 분석을 수행하였다. 딸기뿌리썩이선충 clade로 분류된 BY06 개체군(population)을 NCBI에 기등록된 P.
이론/모형
83의 기본값으로 정렬하였다. 분자생물학적 계통수는 Mrbayes 3.2.6의 General Time Reversible substitution model (GTR+G)을 이용하여 작성하였고(Vovlas 등, 2015), Dendroscope 3.5.7을 이용하여 편집하였다. 뿌리썩이선충의 외집단분류군(outgroup)은 Palomares-Rius 등(2010)의 연구결과를 참고하였으며, 뿌리혹선충의 외집단분류군은 Humphreys-Pereira 등(2014)의 연구결과를 참고하였다.
채취한 자묘 뿌리를 수돗물로 깨끗이 씻은 다음 1,000 cm3의 멸균토양이 들어있는 토분(직경 13 cm)에 2016년 8월 11일 정식하였다. 정식 33일후, 토양 내 뿌리썩이선충 밀도를 확인하기 위해 20 mesh와 400 mesh 체를 이용한 체법과 Baermann 깔때기법으로 선충을 분리하였다. 실체현미경(MZ12)을 이용하여 분리한 선충 시료에서 뿌리썩이선충의 존재 여부와 밀도를 확인하였다.
종내 · 종간 변이율 분석에는 MEGA 6.06의 distance 분석도구를 이용하였다.
성능/효과
2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양시료의 식물기생선충 감염현황을 조사한 결과, 딸기 육묘장의 토양에서는 뿌리혹선충(Meloidogyne spp.), 뿌리썩이선충(Pratylenchus spp.)과 참선충(Tylenchidae)이 검출되었다(Table 2). 주요 검출 선충 가운데 참선충은 딸기에 피해를 일으키지 않는 선충으로 알려져 있기 때문에(Choi, 1977) 딸기 육묘장에서 가장 문제되는 선충은 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충으로 생각된다.
enterolobii (KF993632)를 이용하였다. SCN07, DY14와 M. hapla(AY757902)와는 2.5%, M. hapla (KF993633)와는 1.0%, M. chitwoodi (KF993641)와는 32.9%, M. enterolobii (KF993632)와는 23.1%의 종간 변이율을 나타냈다. 이를 통해 담양 1개와 순천 1개 포장에서 검출된 뿌리혹선충은 당근뿌리혹선충(M.
2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양으로부터 식물기생선충의 토양 내 감염현황을 조사하였다. 그 결과 뿌리썩이선충(Pratylenchus)과 뿌리혹선충(Meloidogyne)이 11%와 3%로 검출되어 딸기 육묘장의 문제선충으로 나타났다. 육묘 형태별로는 토경육묘에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 발생빈도가 다른 육묘방법에 비해 높았고, 상토를 이용한 비가림 포트육묘에서는 식물기생선충이 검출되지 않았다.
유전자 분석을 위해 뿌리썩이선충은 28S rRNA 유전자 부위 마커를, 뿌리혹선충은 COII 유전자 부위 마커를 선발하여 PCR을 수행하였다. 그 결과 뿌리썩이선충의 모든 시료로부터 약 750bp의 증폭산물을 얻었으며, 뿌리혹선충의 모든 시료로부터 약 500 bp의 증폭산물을 얻었다(data not shown). DNA 염기서열을 기반으로 분자생물학적 계통분석을 위해 각 선충 표준집단의 PCR 증폭산물에 대한 DNA 염기서열 분석을 수행하였으며, 이를 통해 작성한 분자생물학적 계통수는 Fig.
그러나 본 연구에서는 뿌리썩이선충이 감염된 토양을 제거한 자묘를 통해서도 이들 선충이 다른 포장으로 확산될수있는지 여부를 확인하고자 하였다. 그결과, 토양이 묻지 않은 자묘를 통해서도 뿌리썩이선충이 확산될 수 있음을 확인하였다. 뿌리혹선충도 마찬가지로 딸기 뿌리에 혹과 난낭을 형성하므로 자묘를 통해서 다른 포장으로 확산될 수 있을 것으로생각된다.
9%의 종내 변이율을 나타냈다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 P. penetrans (EU130863)와 Pratylenchus dunensis (AM231943)를 이용하였으며, P. penetrans(EU130863)와는 1.9%, P. dunensis (AM231943)와는 12.6%의 종간 변이율을 나타냈다. 이러한 결과에 따라, 부여 1개 포장에서 검출된 뿌리썩이선충은 딸기뿌리썩이선충(P.
2%로 나타났다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 P.vulnus (EU130888), Pratylenchus crenatus (EU130853)와 Pratylenchus pratensis (AM231935)를 이용하였으며, P. vulnus(EU130888)와는 2.8%, P. crenatus (EU130853)와는 20.3%, P.pratensis (AM231935)와는 22.6%의 종간 변이율을 나타냈다. 이에 따라, 담양 1개와 순천 3개 포장에서 검출된 뿌리썩이선충은 사과뿌리썩이선충으로 동정되었다.
당근뿌리혹선충 clade로 분류된 SCN07과 DY14 국내 개체군들 간의 종내 변이율을 분석한 결과 1.4%로 나타났다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 M.
06 프로그램을 이용하여 distance 분석을 수행하였다. 딸기뿌리썩이선충 clade로 분류된 BY06 개체군(population)을 NCBI에 기등록된 P. penetrans (EU130863)와 종내 변이율을 분석한 결과, P. penetrans(EU130863)와는 1.9%의 종내 변이율을 나타냈다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 P.
1, 2와 같다. 부여 1개, 담양 1개와 순천 3개 포장에서 각각 검출된 뿌리썩이선충과 담양 1개, 순천 1개 포장에서 각각 검출된 뿌리혹선충의 분자생물학적 계통분석 결과, 딸기뿌리썩이선충(Pratylenchus penetrans)과 사과뿌리썩이선충(P. vulnus) 2종의 뿌리썩이선충과 당근뿌리혹선충(Meloidogyne hapla) 1종의 뿌리혹선충이 확인되었다.
노지(field) 또는 비닐하우스(plastic house)에서 밭토양(upland soil)을 이용하여 토경육묘를 했을 때, 딸기의 주요 기생선충으로 알려진 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충(Ko 등, 2016)의 검출빈도는 노지에서 17%와 2%, 비닐하우스에서 21%와 13%로 다른 육묘방법에 비해 상대적으로 높게 나타났다. 비닐하우스에서 화강토(granite soil)를 이용하여 포트육묘를 했을 때는 뿌리썩이선충이 5%의 낮은 빈도로 검출되었다. 이와 달리, 노지에서 화강토를 이용하거나 비닐하우스에서 상토(bed soil)를 이용하여 포트육묘를했을 때 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충 등 어떠한 식물기생선충도 검출되지 않았다.
육묘 형태별로는 토경육묘에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 발생빈도가 다른 육묘방법에 비해 높았고, 상토를 이용한 비가림 포트육묘에서는 식물기생선충이 검출되지 않았다. 뿌리썩이선충은 딸기뿌리썩이선충(P. penetrans)과 사과뿌리썩이선충(P. vulnus) 2종이 확인되었으며, 뿌리혹선충은 당근뿌리혹선충(M. hapla) 1종이 확인되었다. 사과뿌리썩이선충은 딸기 자묘를 통해 식물기생선충이 감염되지 않은 건전한 토양으로의 확산이 확인되었다(33%).
이러한 결과는 시설재배 주산단지 포장에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충이 주요 문제 선충으로 나타난 연구결과와 일치하였다(Ko 등, 2016). 뿌리썩이선충의 지역별 검출빈도는 순천과 논산이 33%와 20%로 가장 높았으며, 뿌리혹선충은 담양과 순천에서 10%와 13%의 비교적 낮은빈도로 검출되었다. 그러나 딸기 주요 기생선충이 자묘를 통해 본포장으로 확산될 수 있음을 고려하였을 때, 결코 낮지 않은 검출빈도로 생각된다.
사과뿌리썩이선충 clade로 분류된 DY20, SCN01, SCN05와 SCN07 국내 개체군들 간의 종내 변이율을 분석한 결과 0.2%로 나타났다. 근연종과의 종간 변이율 분석에는 P.
hapla) 1종이 확인되었다. 사과뿌리썩이선충은 딸기 자묘를 통해 식물기생선충이 감염되지 않은 건전한 토양으로의 확산이 확인되었다(33%).
순천에서 채취한 사과뿌리썩이선충이 감염된 딸기 자묘를 멸균토양에 정식했을 때 33% 빈도로 사과뿌리썩이선충의 감염이 확인되었다. Castillo 등(2007)에 의하면 뿌리썩이선충은 스스로 이동할 수 있는 거리가 제한되어 있기 때문에 뿌리썩이선충 스스로 다른 포장으로의 확산은 빠르게 일어날 수 없다고 하였다.
6%의 종간 변이율을 나타냈다. 이러한 결과에 따라, 부여 1개 포장에서 검출된 뿌리썩이선충은 딸기뿌리썩이선충(P. penetrans)으로 동정되었다.
1%의 종간 변이율을 나타냈다. 이를 통해 담양 1개와 순천 1개 포장에서 검출된 뿌리혹선충은 당근뿌리혹선충(M.hapla)으로 동정되었다.
후속연구
사과뿌리썩이선충과 딸기뿌리썩이선충은 국내 딸기재배지 일부 지역의 선충 조사 결과에서 검출이 확인된 바 있으며(Choi, 1977; Park 등, 2005), 사과뿌리썩이선충과 당근뿌리혹선충은 진주지역 딸기 시설재배 포장의 문제 선충으로도 잘 알려져있다(Ko 등, 2016). 본 연구결과에 따라, 딸기육묘장에서 자묘를 생산함에 있어 딸기뿌리썩이선충, 사과뿌리썩이선충과 당근뿌리혹선충의 피해가 문제될 것으로생각되며, 육묘전이들의 감염여부 확인 및 방제대책을 마련하는 것이 필요할 것으로 생각된다.
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
딸기에 피해를 주는 식물기생선충의 종류는?
딸기에 피해를 주는 식물기생선충으로는 뿌리혹선충(Meloidogyne), 뿌리썩이선충(Pratylenchus), 잎선충(Aphelenchoides), 창선충(Xiphinema), 바늘선충(Longidorus), 주름선충(Criconematoides) 등이 알려져있다(Brown 등, 1993; Esnard와 Zukerman, 1998). 또한, 국내 딸기 노지재배지와 시설재배지를 대상으로 토양 내 식물기생선충 감염현황을 조사한 결과에서도 뿌리혹선충과 뿌리썩이선충이 주요 문제 선충으로 나타난 바 있다(Choi, 1977; Ko 등, 2016).
식물기생선충 중 딸기 육묘장의 문제 선충으로 파악된 것은?
2016년 6월부터 9월까지 국내 딸기 육묘장 117개 포장의 토양으로부터 식물기생선충의 토양 내 감염현황을 조사하였다. 그 결과 뿌리썩이선충(Pratylenchus)과 뿌리혹선충(Meloidogyne)이 11%와 3%로 검출되어 딸기 육묘장의 문제선충으로 나타났다. 육묘 형태별로는 토경육묘에서 뿌리썩이선충과 뿌리혹선충의 발생빈도가 다른 육묘방법에 비해 높았고, 상토를 이용한 비가림 포트육묘에서는 식물기생선충이 검출되지 않았다.
식물기생선충의 종을 알아내는 방법에는 무엇이 있는가?
또한, 국내 딸기 노지재배지와 시설재배지를 대상으로 토양 내 식물기생선충 감염현황을 조사한 결과에서도 뿌리혹선충과 뿌리썩이선충이 주요 문제 선충으로 나타난 바 있다(Choi, 1977; Ko 등, 2016). 이러한 식물기생선충의 종 동정은 형태적 특징과 각 형태부위별 길이, 폭등의 평균 측정치가 주로 이용되어 왔으나(Powers, 2004), 최근에는 28S rRNA D2–D3 부위 유전자나 mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit II (COII) 부위 유전자와 같은 특정 유전자 부위를 대상으로 한 중합효소연쇄반응(PCR), 제한효소절편길이다형성(restriction fragment length polymorphism) 등과 같은 분자생물학적 기법이 널리 이용되고 있다.
참고문헌 (19)
Barker, K. R., Carter, C. C. and Sasser, J. N. 1985. An Advanced Treatise on Meloidogyne. Volume II. Methodology. North Carolina State University Graphics, Raleigh, NC, USA. 223 pp.
Brown, D. J. F., Dalmasso, A. and Trudgill, D. L. 1993. Nematode pests of soft fruits and vines. In: Plant Parasitic Nematodes in Temperate Agriculture, eds. by K. Evans, D. L. Trudgill and J. M. Webster, pp. 427-462. CAB International, Wallingford, UK.
Castillo, P., Vovlas, N. and Brill, E. J. 2007. Pratylenchus (Nematoda: Pratylenchidae): Diagnosis, Biology, Pathogenicity and Management. Brill, Leiden, Netherlands. 550 pp.
Choi, Y. E. 1977. Studies on plant-parasitic nematodes associated with strawberry. Res. Rev. Kyungpook Natl. Univ. 23: 309-316. (In Korean)
Esnard, J. and Zukerman, B. M. 1998. Small fruits. In: Plant and Nematode Interactions, eds. by K. R. Barker, G. A. Pederson and G. L. Windham, pp. 685-725. American Society of Agronomy, Madison, WI, USA.
Humphreys-Pereira, D. A., Flores-Chaves, L., Gomez, M., Salazar, L., Gomez-Alpizar, L. and Elling, A. A. 2014. Meloidogyne lopezi n. sp. (Nematoda: Meloidogynidae), a new root-knot nematode associated with coffee (Coffea arabica L.) in Costa Rica, its diagnosis and phylogenetic relationship with other coffeeparasitising Meloidogyne species. Nematology 16: 643-661.
Iwahori, H., Kanzaki, N. and Futai, K. 2000. A simple, polymerase chain reaction fragment length polymorphism-aided diagnosis method for pine wilt disease. Forest Pathol. 30: 157-164.
Kim, D. G., Kang, M. W. and Lee, J. H. 2008. Effect of nematicidedipping methods for the control of Aphelenchoides fragariae in strawberry. Korean J. Appl. Entomol. 47: 101-105. (In Korean)
Kim, S. H., Park, S. E., Ko, N. Y., Ryu, T. H., Shin, H. S., Kwon, H. R., Seo, M. J., Yu, Y. M. and Youn, Y. N. 2013. The major plant-parasitic nematodes in plastic vinyl house field. J. Agric. Sci. 40: 101-106. (In Korean)
Kim, S. J., Yu, Y. M. and Whang, K. S. 2014. Molecular identification of Meloidogyne spp. in soils from fruit and vegetable greenhouses in Korea. Korean J. Appl. Entomol. 53: 85-91. (In Korean)
Ko, H. R., Lee, M. A., Kim, E. H., Kim, S. J. and Lee, J. K. 2016. Incidence of major plant-parasitic nematodes in main producing areas of strawberry in Korea. Res. Plant Dis. 22: 249-256. (In Korean)
Kwon, O. G., Shin, J. H., Kabir, F. Md., Lee, J. K. and Lee, D. W. 2016. Dispersal of sugar beet cyst nematode (Heterodera schachtii) by water and soil in highland Chinese cabbage fields. Korean J. Hortic. Sci. Technol. 34: 195-205. (In Korean)
[MAFRA] Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs. 2015. Agriculture, Food and Rural Affairs Statistics Yearbook. MAFRA, Sejong, Korea. 387 pp. (In Korean)
Nunn, G. B. 1992. Nematode molecular evolution: an investigation of evolutionary patterns among nematodes based upon DNA sequences. Ph.D. thesis. University of Nottingham, Nottingham, UK. 187 pp.
Palomares-Rius, J. E., Castillo, P., Liebanas, G., Vovlas, N., Landa, B. B., Navas-Cortes, J. A. and Subbotin, S. A. 2010. Description of Pratylenchus hispaniensis n. sp. from Spain and considerations on the phylogenetic relationship among selected genera in the family Pratylenchidae. Nematology 12: 429-451.
Park, S. D., Khan, Z., Yeon, I. K. and Kim, Y. H. 2005. A survery for plant-parasitic nematodes associated with strawberry (Fragaria ananassa Duch.) crop in Korea. Plant Pathol. J. 21: 387-390.
Vovlas, N., Vovlas, A., Leonetti, P., Liebanas, G., Castillo, P., Subbotin, S. A. and Rius, J. E. P. 2015. Parasitism effects on white clover by root-knot and cyst nematodes and molecular separation of Heterodera daverti from H. trifolii. Eur. J. Plant Pathol. 143: 833-845.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.