[논문]Citrobacter freundii 분리주를 감염시키는 용균 박테리오파지 CF1의 유전체 염기서열 초안

김영주; 고세영; 연영은; 임재원; 한범구; 김현일; 안정근; 김동혁

doi:10.7845/kjm.2018.7099

[국내논문] Citrobacter freundii 분리주를 감염시키는 용균 박테리오파지 CF1의 유전체 염기서열 초안
Draft genome sequence of lytic bacteriophage CF1 infecting Citrobacter freundii isolates 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.54 no.1, 2018년, pp.79 - 80

김영주 ((주)옵티팜) , 고세영 (경희대학교 생명공학원) , 연영은 ((주)옵티팜) , 임재원 (경희대학교 생명공학원) , 한범구 ((주)옵티팜) , 김현일 ((주)옵티팜) , 안정근 (충남대학교 미생물학과) , 김동혁 (경희대학교 생명공학원)

초록
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본 연구에서는 돼지 축사 근처 하수 오물에서 분리된 그람 음성균이자 항생제 내성을 쉽게 획득하여 병원성을 띄는 균주인 Citrobacter freundii를 host로 하는 박테리오파지의 유전체 분석을 수행하였다. 본 박테리오파지는 G + C 비율이 42.65%이며, 50,339 bp로 구성된 유전체 DNA를 지니고 있었다. 이러한 유전체 DNA에서 89개의 단백질 코딩 유전자가 확인 되었으며, 이 중 55개의 유전자는 BLASTP 분석으로부터 기능을 가지고 있다고 추정되었다. 또한 RNA는 확인되지 않았다.

Abstract ▼ AI-Helper

Citrobacter freundii is a facultative anaerobic and a Gram-negative bacterium of Enterobacteriaceae family, and is an opportunistic pathogen. Bacteriophages infecting C. freundii can be an effective treatment for C. freundii infections. Here, the complete genomic sequence is announced for a lytic ba...

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문제 정의

본 연구에서는 돼지 축사 근처 하수 오물에서 분리된 그람음성균이자 항생제 내성을 쉽게 획득하여 병원성을 띄는 균주인 Citrobacter freundii를 host로 하는 박테리오파지의 유전체분석을 수행하였다. 본 박테리오파지는 G + C 비율이 42.

대상 데이터

본 연구에서는 돼지 축사 근처 하수 오물에서 분리된 그람음성균이자 항생제 내성을 쉽게 획득하여 병원성을 띄는 균주인 Citrobacter freundii를 host로 하는 박테리오파지의 유전체분석을 수행하였다. 본 박테리오파지는 G + C 비율이 42.65%이며, 50,339 bp로 구성된 유전체 DNA를 지니고 있었다. 이러한 유전체 DNA에서 89개의 단백질 코딩 유전자가 확인 되었 으며, 이 중 55개의 유전자는 BLASTP 분석으로부터 기능을 가지고 있다고 추정되었다.

성능/효과

freundii CF1 in terms of the genome size and the number of genes. Moreover, the ortholog analysis showed that C. freundii CF1 and Citrobacter phage Stevie share 86 orthologous genes which cover 96.63% of genes in C. freundii CF1 genome, indicating that the genome of CF1 is quite close to that of Stevie.
65%이며, 50,339 bp로 구성된 유전체 DNA를 지니고 있었다. 이러한 유전체 DNA에서 89개의 단백질 코딩 유전자가 확인 되었 으며, 이 중 55개의 유전자는 BLASTP 분석으로부터 기능을 가지고 있다고 추정되었다. 또한 RNA는 확인되지 않았다.

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