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국내 어류에서 분리된 Megalocytivirus의 유전형 분류 및 상관관계 분석
Genetic relatedness of Megalocytivirus from diseased fishes in Korea 원문보기

韓國魚病學會誌= Journal of fish pathology, v.32 no.2, 2019년, pp.49 - 57  

이은선 (국립수산과학원 병리연구과) ,  조미영 (국립수산과학원 병리연구과) ,  민은영 (국립수산과학원 병리연구과) ,  정승희 (국립수산과학원 병리연구과) ,  김광일 (국립수산과학원 병리연구과)

초록
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본 연구에서는 2012년부터 2018년 1월까지 국내 어류에서 참돔이리도바이러스병 (red sea bream iridoviral disease; RSIVD) 으로 확정 진단된 주요 분리주에 대하여 major capsid protein (MCP) 유전자의 염기서열을 바탕으로 Megalocytivirus의 유전적 관계를 명확히 했다. 또한, Megalocytivirus와 숙주 세포간 상호작용에 영향을 줄 수 있는 특이 유전자 2종, Vascular endothelial growth factor (VEGF) 및 Histidine triad motif인 HIT-like 단백질 (HIT)에 대한 염기서열 분석을 통해 유전적 상관관계를 고찰하였다. 국내 어류에서 분리된 39개의 megalocytiviruses는 2가지 유전형인 red sea bream iridovirus (RSIV)형과 turbot reddish body iridovirus (TRBIV)형으로 분류되었으며, RSIV형의 megalocytiviruses는 다시 유전아형인 RSIV-subgroup 1형과 2형으로 분류되었다. 그리고 VEGF 유전자 염기서열 분석 결과에서는 RSIV형의 바이러스에서 변이가 발생되었음을 확인할 수 있었으며, HIT-like 단백질 유전자는 RSIV형의 Megalocytivi rus에서만 발견되는 것을 알 수 있었다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

In this study, we collected 39 megalocytiviruses isolated from diseased fish in Korea from 2012 to 2018. Major capsid protein (MCP) gene, a part of vascular endothelial growth factor (VEGF) gene and histidine triad motif-like protein (HIT) genes of Megalocytivirus were targeted for PCR amplification...

주제어

표/그림 (7)

AI 본문요약
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문제 정의

  • MCP를 포함하여 바이러스 복제 및 감염 관련 유전자들로 알려진 ATPase나 PstI 유전자에 대한 계통 관계 연구가 알려진 바 있으나(Kwon et al., 2011), VEGF와 HIT-like protein 유전자 염기서열의 분석은 본 연구에서 처음 보고하고자 한다.
  • 본 연구에서는 2012년부터 2018년 1월까지 국내 어류에서 참돔이리도바이러스병 (red sea bream iridoviral disease; RSIVD) 으로 확정 진단된 주요 분리주에 대하여 major capsid protein (MCP) 유전자의 염기서열을 바탕으로 Megalocytivirus의 유전적 관계를 명확히 했다. 또한, Megalocytivirus와 숙주 세포간 상호작용에 영향을 줄 수 있는 특이 유전자 2종, Vascular endothelial growth factor (VEGF) 및 Histidine triad motif인 HIT-like 단백질 (HIT)에 대한 염기서열 분석을 통해 유전적 상관관계를 고찰하였다.
  • 본 연구에서는 국내 어류에서 분리된 Megalocy-vitirus의 MCP, VEGF 및 HIT-like protein 도메인의 유전자 염기서열을 분석하고, 국내 분리주의 유전형 및 유전적 상관관계에 대해 고찰하고자 하였다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
참돔이리도바이러스병의 원인은? 참돔이리도바이러스병 (red sea bream iridoviral diseases, RSIVD)의 원인 바이러스는 이리도바이러스과 (family Iridoviridae), 메갈로사이티바이러스속 (genus Megalocytivirus)에 속하며, 지름이 약 140-250 nm인 20면체 double strand DNA 바이러스이다 (Kurita and Nakajima, 2012; Chinchar et al., 2017).
메갈로사이티바이러스속의 유전형 분류는? , 2017). Megalocytivirus의 유전형 분류는 major cap-sid protein (MCP) 및 adenosine triphosphatase(ATPase) 유전자 염기서열의 상관관계를 기반으로 하고 있다. Megalocytivirus의 유전형은 red sea bream iridovirus (RSIV)형, infectious spleen and kid-ney necrosis virus (ISKNV)형, 그리고 turbot reddish body iridovirus (TRBIV)형으로 총 3가지 유전형(genotype)으로 분류되며, RSIV형과 ISKNV형은 각 유전아형(subgroup 1형과 2형)으로 세분화하여 분류할 수 있다(Kurita and Nakajima, 2012).
VEGF란 무엇인가? Vascular endothelial growth factor (VEGF)는 이리도바이러스과 (Iridoviridae)내에서 유일하게 Mega-locytivirus속 바이러스에만 존재하는 유전자로, Wang et al (2008)에 의하면 VEGF는 숙주 내에서 혈관 확산 유도와 침투성을 촉진하여 바이러스 감염 및 복제에 중요한 역할을 할 것이라 시사한 바 있다. Histidine triad motif로 되어 있는 HIT-like protein(HIT)은 거의 모든 생물체에서 발견되며 보존적인 단백질로, 기능적으로는 Hint (Histidine triad nu-cleotide-binding protein)와 Fhit (Fragile HIT protein)는 종양 형성을 억제하는 것으로 알려져 있으나 Megalocytivirus에서 HIT-like protein의 기능적인 역할은 아직 밝혀진 바 없다 (Brenner, 2002; Martin et al.
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참고문헌 (25)

  1. Brenner C. 2002. Hint, Fhit and GalT: Function, Structure, Evolution and Mechanism of Three Branched of the Histidine Triad Superfamily of Nucleotide Hydrolases and Transferases. Biochemistry 23: 9003-9014. 

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  16. Mishra A, Nam GH, Gim JA, Lee HE, Jo A, Yoon D, Oh S, Kim S, Kim A, Kim DH, Kim YC, Jeong HD, Cha HJ, Choi YH. 2017. Comparative evaluation of MCP gene in worldwide strains of Megalocytivirus (Iridoviridae family) for early diagnostic marker. Journal of Fish Diseases. DOI: 10.1111/jfd.12685. 

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  23. Tidona CA, Schnitzler P, Kehm R, Darai G. 1998. Is the Major Capsid Protein of Iridoviruses a Suitable Target for the Study of Viral Evolution? Virus Genes 16: 59-66. 

  24. Wang Z, Xu X, He B, Weng S, Xiao J, Wang L, Lin T, Liu X, Wang Q, Yu X, He J. 2008. Infectious Spleen and Kidney Necrosis Virus ORF48R Functions as a New Viral Vascular Endothelial Growth Factor. Journal of Virology 82: 4371-4383. DOI: 10.1128/JVI.02027-07. 

  25. Won KM, Cho MY, Park MA, Jee BY, Myeing JI, Kim JW. 2013. The First Report of a Megalocytivirus Infection in Farmed Starry Flounder, Platichthys stellatus, in Korea. Fisheries and aquatic sciences 16: 93-99. DOI: 10.5657/FAS.2013.0093. 

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