[논문]식물 및 곤충의 곰팡이 병원균에 항균력을 가진 Pseudomonas fluorescens NBC275 균주의 유전체 염기서열

더타 스와나리; 유상미; 나젠드란 라자링감; 정상철; 이용훈

doi:10.7845/kjm.2019.9018

식물 및 곤충의 곰팡이 병원균에 항균력을 가진 Pseudomonas fluorescens NBC275 균주의 유전체 염기서열
Complete genome sequencing of Pseudomonas fluorescens NBC275, a biocontrol agent against fungal pathogens of plants and insects 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.55 no.2, 2019년, pp.157 - 159

더타 스와나리 (전북대학교 생명공학부) , 유상미 (국립낙동강생물자원관 담수생물연구본부) , 나젠드란 라자링감 (전북대학교 생명공학부) , 정상철 (국립낙동강생물자원관 담수생물연구본부) , 이용훈 (전북대학교 생명공학부)

초록
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낙동강 주변에서 채취한 토양으로부터 분리한 Pseudomonas fluorescens NBC275 (Pf275) 균주는 식물과 곤충에 병을 일으키는 곰팡이류에 우수한 항균력을 보였다. 본 연구에서는 Pf275 균주의 전체염기서열을 해독하고 분석하였는데, 총 염기서열은 6,610,362 bp였고, GC 함량은 60.9%였다. 염색체는 5,869개의 단백질을 암호화하였고, 16개의 rRNA와 65개의 tRNA로 구성되어 있었다. 유전체의 분석을 통해 항균력을 나타내는 2차 대사산물을 암호화하는 유전자를 확인할 수 있었는데, Pf275 균주는 pyoverdine, 2, 4-diacetylphloroglucinol 및 phenazine 등의 항균물질을 생산하였고, 이들 대사산물에 의해 항균력 및 생물방제효과를 나타내는 것으로 판단된다.

Abstract ▼ AI-Helper

Pseudomonas fluorescens NBC275 (Pf275) isolated from soil sample collected at riverside of Nakdonggang showed antagonistic activity against fungal pathogens of plants and insects. Here we present complete genome sequence of Pf275. The genome comprises of 6,610,362 bp with GC content of 60.9%, which includes 5,869 predicted protein-coding genes, 16 rRNAs, and 65 tRNAs. Genome analysis revealed gene clusters encoding antimicrobial secondary metabolites such as pyoverdine, 2, 4-diacetylphloroglucinol, and phenazine, which are known to play essential roles in biocontrol of diseases.

주제어

표/그림 (1)

표 Table 1. The features of Pseudomonas fluorescens Pf275 genome

AI 본문요약
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대상 데이터

fluorescens strain Pf275 isolated from soil sample collected at riverside of Nakdonggang, South Korea, exhibited broad antifungal activity against plant pathogens, Botrytis cinerea, Rhizoctonia solani, and Alternaria solani as well as insect pathogens, Metarhizium anisopliae and Beauveria bassiana. The strain was deposited in the Korean Collection for Type Cultures (KCTC) with accession number of KCTC 13360BP.
9%였다. 염색체는 5,869개의 단백질을 암호화하였고, 16개의 rRNA와 65개의 tRNA로 구성되어 있었다. 유전체의 분석을 통해 항균력을 나타내는 2차 대사산물을 암호화하는 유전자를 확인할 수 있었는데, Pf275 균주는 pyoverdine, 2, 4-diacetylphloroglucinol 및 phenazine 등의 항균물질을 생산하였고, 이들 대사산물에 의해 항균력 및 생물방제효과를 나타내는 것으로 판단된다.

성능/효과

In this study, the P. fluorescens strain Pf275 isolated from soil sample collected at riverside of Nakdonggang, South Korea, exhibited broad antifungal activity against plant pathogens, Botrytis cinerea, Rhizoctonia solani, and Alternaria solani as well as insect pathogens, Metarhizium anisopliae and Beauveria bassiana. The strain was deposited in the Korean Collection for Type Cultures (KCTC) with accession number of KCTC 13360BP.
낙동강 주변에서 채취한 토양으로부터 분리한 Pseudomonas fluorescens NBC275 (Pf275) 균주는 식물과 곤충에 병을 일으키는 곰팡이류에 우수한 항균력을 보였다. 본 연구에서는 Pf275 균주의 전체염기서열을 해독하고 분석하였는데, 총 염기서열은 6,610,362 bp였고, GC 함량은 60.
낙동강 주변에서 채취한 토양으로부터 분리한 Pseudomonas fluorescens NBC275 (Pf275) 균주는 식물과 곤충에 병을 일으키는 곰팡이류에 우수한 항균력을 보였다. 본 연구에서는 Pf275 균주의 전체염기서열을 해독하고 분석하였는데, 총 염기서열은 6,610,362 bp였고, GC 함량은 60.9%였다. 염색체는 5,869개의 단백질을 암호화하였고, 16개의 rRNA와 65개의 tRNA로 구성되어 있었다.
염색체는 5,869개의 단백질을 암호화하였고, 16개의 rRNA와 65개의 tRNA로 구성되어 있었다. 유전체의 분석을 통해 항균력을 나타내는 2차 대사산물을 암호화하는 유전자를 확인할 수 있었는데, Pf275 균주는 pyoverdine, 2, 4-diacetylphloroglucinol 및 phenazine 등의 항균물질을 생산하였고, 이들 대사산물에 의해 항균력 및 생물방제효과를 나타내는 것으로 판단된다.

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