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TOPKAT®, Derek®, OECD toolbox를 활용한 화학물질 독성 예측 연구
Toxicity Prediction using Three Quantitative Structure-activity Relationship (QSAR) Programs (TOPKAT®, Derek®, OECD toolbox) 원문보기

韓國環境保健學會誌 = Journal of environmental health sciences, v.45 no.5, 2019년, pp.457 - 464  

이진욱 (국립환경과학원) ,  박선영 (국립환경과학원) ,  장석원 (국립환경과학원) ,  이상규 (국립환경과학원) ,  문상아 (국립환경과학원) ,  김현지 (국립환경과학원) ,  김필제 (국립환경과학원) ,  유승도 (국립환경과학원) ,  성창호 (국립환경과학원)

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Objectives: Quantitative structure-activity relationship (QSAR) is one of the effective alternatives to animal testing, but its credibility in terms of toxicity prediction has been questionable. Thus, this work aims to evaluate its predictive capacity and find ways of improving its credibility. Meth...

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AI 본문요약
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문제 정의

  • 본 연구는 QSAR의 예측 신뢰성 향상을 위해, 먼저 기존 상용/공용화된 QSAR 모델의 급성 경구독성, 피부 과민성, 피부 자극성/부식성, 눈 자극성/부식성에 대한 예측 신뢰성을 검증하고 이어서, 복수 적용 및 구조 별 차이 분석을 통해 QSAR 신뢰성 향상 방안을 모색하고자 한다. 이를 위해 독성예측에 널리 활용되어온 TOPKAT® , Derek® , OECD toolbox를 연구대상 QSAR 프로그램으로 선정하고, 과학원에서 유해화학물질관리법(유해법)에 따라 등록 완료된 화학물질을 대상으로 시험대상 물질을 선정하였다.
  • 본 연구는 기존 화학물질 독성 및 물리화학적 성질 예측에 활용되어온 QSAR 프로그램들의 예측 신뢰성 향상 방안 모색의 일환으로 QSAR 프로그램 복수 적용 연구를 수행하였다. 피부 과민성 시험자료가 있는 412종 화학물질에 대한 3종 QSAR 프로그램의 복수적용 결과 S는 87.
  • 본 연구는 화학물질 독성 예측에 범용적으로 활용 되어온 TOPKAT® , Derek® , OECD toolbox를 연구 대상 QSAR 프로그램으로 선정하고 QSAR의 예측 신뢰도 분석과 신뢰도 향상 방안을 연구하였다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
화학물질의 성질과 유해성에 관한 대체시험법 개발이 필요한 이유는 무엇인가? 5) 예로서, 화학물질등록평가법은 국내 유통되는 1 ton 이상 기존화학물질 및 100 kg 이상 신규화학물질을 제조·수입하는 자가 국가에 물리화학적 성질과 유해성에 관한 시험자료를 제출 하도록 의무화 하였다. 5)그러나, 현재 국내 유통되거나 유통된 적이 있는 화학물질의 수는 약 4만 여종에 이를 것으로 예상됨에도 불구하고, 국내 시험 자료 생산 연구기관의 수 및 국가기관 관리 인력은 법정업무를 수행하기에 부족한 상황이며, 시험자료 생산 비용도 산업체에 큰 부담이 될 것으로 예상된다. 6,7,8) 이에 따라, 국내 유통 화학물질에 대한 산업체와 관계 당국의 업무 효율을 증대시키기 위한 대체시험법 개발이 필요한 실정이다.
QSAR 모델은 무엇인가? Structure-activity relationship (SAR)/Quantitative structure-activity relationship (구조-활성관계: QSAR)모델은 화학물질의 물리화학적 성질 및 생물학적 활성을 구조에 기반하여 예측하는 수학적 모델의 일종 이다. QSAR는 화학물질의 특성 예측 시 기존 동물 실험 및 물리화학 실험에 비해 비용과 소요시간이 적게 들고, 동물희생을 줄일 수 있는 장점이 있어 효과적인 대체시험법으로 여겨지고 있다.
QSAR의 장점은 무엇인가? Structure-activity relationship (SAR)/Quantitative structure-activity relationship (구조-활성관계: QSAR)모델은 화학물질의 물리화학적 성질 및 생물학적 활성을 구조에 기반하여 예측하는 수학적 모델의 일종 이다. QSAR는 화학물질의 특성 예측 시 기존 동물 실험 및 물리화학 실험에 비해 비용과 소요시간이 적게 들고, 동물희생을 줄일 수 있는 장점이 있어 효과적인 대체시험법으로 여겨지고 있다. 9,10,11,12,13) 그러나, 여러 연구결과들이 QSAR 예측의 신뢰성이 높지 않다고 보고하고 있어 QSAR의 활용에 우려가 제기되고 있다.
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참고문헌 (18)

  1. Ganesan S, Vasudevan N. Impacts of perfluorinated compounds on human health. Bull. Env. Pharmacol. Life Sci. 2015; 4: 183-191. 

  2. Lee JW, Lee J-W, Kim K, Shin YJ, Kim J, Kim H, et al. n-Butyl acrylate-induced antioxidant system alteration through two generations in Oryzias latipes. 2018; doi: 10.1007/s10695-018-0584-z. 

  3. Lee JW, Shin YJ, Kim H, Kim H, Kim J, Min SA, et al. Metformin-induced endocrine disruption and oxidative stress of Oryzias latipes on two-generational condition. J Hazard Mater. 2019; 5:171-181. 

  4. Korean Society of Environmental Health (KSEH), Environmental Health, 1st ed, Seoul, Episteme Press, 2016, p. 19-33. 

  5. Ministry of Environment (MOE). Act on the Registration and Evaluation, etc. of Chemical Substance. Available: http://www.law.go.kr/??/[accessed 01 June 2019] 

  6. Kim K-Y, Shin SE, No KT. Assessment of quantitative structure-activity relationship of toxicity prediction models for Korean Chemical substance control legislation. Environ Heal Toxicol. 2015; 30: Article ID:s2015007, 10 page 

  7. Korea Development Institute (KDI). Analysis report: the effect of domestic industry according to EU-REACH legislation. Available: http://www.prism.go.kr/homepage/researchCommon/retrieveResearchDetailPopup.do;jsessionid53B47AF8E1BB6 B007845C668E9DAF279.node02?research_id1480000-200700151 [cited 2014 Dec 15]. 

  8. Kim J, Seo, J-K, Kim T, Kim, H-K, Park, S, Kim P-J. Prediction of human health and ecotoxicity of chemical substances using the OECD QSAR application toolbox. J Environ Health Sci. 2013; 39: 130-137. 

  9. Sung CH, Park SY, Lee JW, Yu SD, Kim PJ, Jang S-W, et al. A study for the improvement of a prediction using QSAR models to find out hazardous substances (I) (2018). Available: http://library.me.go.kr/search/DetailView.ax?sid1&cid5677755 [accessed 01 June 2019] 

  10. Jang T-S, Shin S-K, Kim H. Estimation of Physicochemical and Eco-toxicological properties of pharmaceuticals by QSAR approach. J Korean Society for Environmental Analysis. 2010; 13: 45-53 

  11. Mays C, Benfenati E, Pardoe S. Use and perceived benefits and barriers of QSAR models for REACH: findings from a questionnaire to stakeholders. Chem Cent J. 2012; 6(1): 159 

  12. Sung ND. Development of new agrochemicals by quantitative structure-activity relationship (QSAR) methodology, 3D QSAR methodologies and computer-assisted molecular design (CAMD). Korean J Pestic Sci. 2003; 03: 1-11. 

  13. Cariello NF, Wilson JD, Britt BH, Wedd DJ, Burlinson B, Gombar V. Comparison of the computer programs DEREK and TOPKAT to predict bacterial mutagenicity. Mutagenesis. 2002; 17(4):321-329. 

  14. Kim J, Choi K, Kim K, Kim D. QSAR approach for toxicity prediction of chemicals used in electronics industries. J Environ Health Sci. 2014; 40:105-113. 

  15. Kim HK, Kim JY, Cha HK, Park MY, Sung CH, Kim PL. A study on the best application of (Q)SARs to predict aquatic toxicity of organic chemicals (2010). Available: http://library.me.go.kr/search/DetailView.ax?sid1&cid5256608 [accessed 01 June 2019] 

  16. Klimisch HJ, Andreae M, Tillmann U. A systematic approach for evaluating the quality of experimental toxicological and ecotoxicological data. Regul Toxicol Pharmacol. 1997; 25: 1-5. 

  17. Sung CH, Park SY, Kim KT, Kim KH, Sung MH, Moon SA, et al. Study on the improvement of mutagenicity prediction using QSARs models (2016). Available: http://library.me.go.kr/search/DetailView.ax?sid1&cid5638480 [accessed 01 June 2019] 

  18. Sung CH, Park SY, Choi YS, Kim HK, Sung MH, Moon SA, et al. Study on the improvement of genotoxicity prediction using QSARs models (2017). Available: http://library.me.go.kr/search/DetailView.ax?sid1&cid5667023 [accessed 01 June 2019] 

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