[논문]양식넙치와 뱀장어에서 분리된 Edwardsiella tarda의 특성 비교

김은희

doi:10.7847/jfp.2021.34.1.031

양식넙치와 뱀장어에서 분리된 Edwardsiella tarda의 특성 비교
Characteristics Comparisons of Edwardsiella tarda Isolated from Cultured Olive Flounder and Eel 원문보기

韓國魚病學會誌= Journal of fish pathology, v.34 no.1, 2021년, pp.31 - 38

초록
AI-Helper

본 연구는 1996년부터 2010년 사이에 우리나라 양식넙치와 뱀장어에서 분리하여 Edwardsiella tarda로 동정하였던 18 균주에 대하여 생화학적 특성과 RAPD profile을 비교해봄으로써 이전 양식생물의 질병에 관여되었던 Edwardsiella속 세균의 다양성을 알아보고자 하였다. 생화학적 특성으로 볼 때 이들은 citrate 분해, H₂S 그리고 indole 생산 결과에 차이를 보여 4가지 패턴으로 구분되었으나 모두 E. tarda로 동정되었고 숙주에 따른 분리균의 특성으로 구분되지는 않았다. E. tarda 특이 primer인 EDtT로 PCR을 실시한 결과 18 분리균에서는 모두 약 270 bp의 동일한 band가 검출되었으나 비교 균주로 사용된 E. tarda와 E. ictaluri의 type strain에서는 특이 밴드가 검출되지 않았다. 또한 Ready-To-Go-RAPD kit의 primer 5번과 6번으로 실시한 RAPD PCR 결과, 넙치 분리균, 뱀장어 분리균, 그리고 E. tarda와 E. ictaluri type strain에서 band profile이 뚜렷한 차이를 보여 origin에 따른 특징으로 정리될 수 있었으며 병원체 모니터링을 위한 tool의 하나로 개발될 가능성을 보였다.

Abstract ▼ AI-Helper

The objective of this study was to determine comparative biochemical characteristics and RAPD (random amplified polymorphic DNA) profiles of 18 strains of Edwardsiella tarda isolated from cultured olive flounder (Paralichthys olivaceus) and eel (Anguilla spp) that showed diseases between 1996 and 2010 in Korea. In terms of biochemical properties, they showed four patterns with differences in citrate degradation and production of H2S and indole. All strains were identified as E. tarda. Characteristics of isolates were not classified according to their host. As a result of PCR with E. tarda-specific primer, EDtT, the same band of about 270 bp was detected in all 18 isolates. However, no specific band was detected in type strains of E. tarda or Edwardsiella ictaluri. As a result of RAPD PCR performed with primer No. 5 and No. 6 of a Ready-To-Go-RAPD kit, the band profile showed clear differences among isolates of olive flounder, isolates of eel, and E. tarda and E. ictaluri type strains. It was possible to organize their characteristics according to the origin of host with possibility to develop tools for pathogen monitoring.

주제어

표/그림 (8)

표 Table 1. Origins of 18 isolates formerly classified as Edwardsiella tarda and their strain names in this study
표 Table 2. Biochemical characteristics of isolates formerly identified as Edwardsiella tarda showing four patterns in API 20E tests
그림 Fig. 1. Agarose gel showing a PCR amplicon of about 270 bp produced using typical Edwardsiella tarda-specific primer, EDtT (Sakai et al., 2009). Lanes: 1, F96-1; 2, F00-1; 4, E97-1; 5, E97-2; 7, E09-1; 8, E09-2; 10, E. tarda KCTC 12267; 11, E. ictaluri KCTC 12264; M, 100 bp DNA ladder.
표 Table 3. Comparison of biochemical characteristics between type strains of Edwardsiella tarda and E. ictaluri, and three isolates with different RAPD profiles
그림 Fig. 2. RAPD profiles obtained using primer No 5 of a Ready-To-Go-RAPD kit. For lanes, refer to Table 4 of this text.
그림 Fig. 3. RAPD profile obtained using primer No 6 of a Ready-To-Go-RAPD kit. For lanes, refer to Table 4 of this text.
표 Table 4. Strains used for comparing RAPD profiles and their identification based on results of API 20E test
그림 Fig. 4. A dendrogram generated based on the analysis of RAPD profiles produced with 18 isolates, E. tarda KCTC 12267, and E. ictaluri KCTC 12264 using primer No. 6 of a Ready-To-Go-RAPD kit (Cytiva, USA).

참고문헌 (17)

Abayneh, T., Colquhoun, D.J. and Sorum, H.: Multi-locus sequence analysis (MLSA) of Edwardsiella tarda isolates from fish. Vet. Microbiol., 158:367-375, 2012.

상세보기
Abayneh, T., Colquhoun, D.J. and Sorum, H.: Edwardsiella piscicida sp. nov., a novel species pathogenic to fish. J. Appl. Microbiol., 11:644-654, 2013.. (Corrigendum : J. Appl. Microbiol., 115: 634-635, 2013)
Bujan, N., Toranzo, A.E. and Magarinos, B.: Edwardsiella piscicida : a significant bacterial pathogen of cultured fish. Dis. Aquat. Org., 131:59-71, 2018.

상세보기
Davies, Y.M., de Oliveira, M.G.X., Cunha, M.P.V., Franco, L.S., Santos, S.L.P., Moreno, L.Z., Gomes, V.T. de Moura, Sato, M. I.Z., Nardi, M.S., Moreno, A.M., Saidenberg, A.B. and de Sa, L.R.M. and Knobi, T.: Edwardsiella tarda outbreak affecting fishes and aquatic birds in Brazil. Vet. Quart., 38:99-105. 2018.

상세보기
Farzadnia, A. and Naeemipour, M.: Molecular techniques for the detection of bacterial zoonotic pathogens in fish and humans. Aqua. Int., 28: 309-320, 2020.

상세보기
Griffin, M.J., Ware, C., Quiniou, S.M., Steadman, J.M., Gaunt, P.S., Khoo, L.H. and Soto, E.: Edwardsiella piscicida identified in the southeastern USA by gyrB sequence, species-specific and repetitive sequence-mediated PCR. Dis. Aqua. Org., 108:23-35, 2014.

상세보기
Jang, M.H., Kim, K.Y., Lee, Y.H., Oh, Y.K., Lee, J.H. and Song, J.Y.: Genetic identification and biochemical characteristics of Edwardsiella strains isolated from freshwater fishes cultured in Korea. J. Fish Pathol., 33:111-118, 2020.
Joh, S-J., Kim, M-J., Kwon, H-M., Ahn, E-H., Jang, H. and Kwon, J-H.: Characterization of Edwardsiella tarda isolated from farm-cultured eel, Anguilla japonica, in the Republic of Korea. J. Vet. Med. Sci., 73:7-11, 2011.

상세보기
Mohanty, B.R. and Sahoo, P.K. : Edwardsiellosis in fish: a brief review. J. Biosci., 32:1331-1344, 2007.

상세보기
Nadirah, M, Najiah, M. and Teng, S.Y.: Characterization of Edwardsiella tarda isolated from Asian seabass, Lates calcarifer. Int. Food Res. J., 19: 1247-1252. 2012.
Nucci, C., da Silveira, W.D., da Silva Correa, S., Nakazato, G., Bando, S.Y., Ribeiro, M.A. and Pestana de Castro, A.F.: Microbiological comparative study of isolates of Edwardsiella tarda isolated in different countries from fish and humans. Vet. Microbiol., 89:29-39, 2002.

상세보기
Park, B.P., Nho, S.W., Jang, H.B., Cha, I.S., Lee, J-H., Aoki, T. and Jung, T.S. : Phenotypic and genotypic analysis of Edwardsiella tarda isolated from olive flounder (Paralichthys olivaceus) and Japanese eel (Anguilla japonica). Aquaculture, 473:449-455, 2017.

상세보기
Reichley, S.R., Ware, C., Steadman, J., Gaunt, P.S., Garcia, J.C., Lafrentz, B.R., Thachil, A., Waldbieser, G. C., Stine, C.B., Arias, C.R., Loch, T., Welch, T.J., Cipriano, R.C., Greenway, T.E., Khoo, L/H., Wise, D.J., Lawrence, M.L. and Griffin, M.J.:Comparative phenotypic and genotypic analysis of Edwardsiella isolates from different hosts and geographic origins, with emphasis on isolates formerly classified as E. tarda, and evaluation of diagnostic methods. J. Clin. Microbiol., 55:3466-3491, 2017.

상세보기
Sakai, T., Yuasa, K., Sano, M. and Ida, T. : Identification of Edwardsiella ictaluri and E. tarda by species specific polymerase chain reaction targeted to the upstream region of the fimbrial gene. J. Aquat. Anim. Health, 21:124-132, 2009.

상세보기
Shao, S., Lai, Q., LIU, Q., Wu, H., Xiao, J., Shao, Z., Wang, Q. and Zhang, Y.: Phylogenomics characterization of a highly virulent Edwardsiella strain ET080813T encoding two distinct T3SS and three T6SS gene clusters: Propose a novel species as Edwardsiella anguillarum sp. nov. Sys. Appl. Microbiol., 38:36- 47, 2015.

상세보기
Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A. and Tingey, S.V.: DNA Polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids Res.,18 : 6531-6535. 1990.
Yu, J.H., Han, J.J., Park, K.S., Park, K.H. and Park, S.W.: Edwardsiella tarda infection in Korean catfish, Silurus asotus, in a Korean fish farm. Aquac. Res., 41:19-26, 2009.

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