[논문]Identification of non-covalent 3C-like protease inhibitors against severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 via virtual screening of a Korean compound library

Lee, Joo-Youn; Kuo, Chih-Jung; Shin, Jin Soo; Jung, Eunhye; Liang, Po-Huang; Jung, Young-Sik

doi:10.1016/j.bmcl.2021.128067

[해외논문] Identification of non-covalent 3C-like protease inhibitors against severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 via virtual screening of a Korean compound library 원문보기

Bioorganic & medicinal chemistry letters, v.42, 2021년, pp.128067 -

Lee, Joo-Youn (Infectious Diseases Therapeutic Research Center, Korea Research Institute of Chemical Technology) , Kuo, Chih-Jung (Department of Veterinary Medicine, National Chung Hsing University) , Shin, Jin Soo (Infectious Diseases Therapeutic Research Center, Korea Research Institute of Chemical Technology) , Jung, Eunhye (Infectious Diseases Therapeutic Research Center, Korea Research Institute of Chemical Technology) , Liang, Po-Huang (Institute of Biological Chemistry, Academia Sinica) , Jung, Young-Sik (Infectious Diseases Therapeutic Research Center, Korea Research Institute of Chemical Technology)

Abstract ▼ AI-Helper

Abstract The outbreak of coronavirus (CoV) disease 2019 (COVID-19) caused by the severe acute respiratory syndrome CoV-2 (SARS-CoV-2) has turned into a pandemic. The enzyme 3C-like protease (3CLpro) is essential for the maturation of viral polyproteins in SARS-CoV-2 and is therefore regarded as a key drug target for treating the disease. To identify 3CLpro inhibitors that can suppress SARS-CoV-2 replication, we performed a virtual screening of 500,282 compounds in a Korean compound bank. We then subjected the top computational hits to inhibitory assays against 3CLpro in vitro, leading to the identification of a class of non-covalent inhibitors. Among these inhibitors, compound 7 showed an EC50 of 39.89 μM against SARS-CoV-2 and CC50 of 453.5 μM. This study provides candidates for the optimization of potent 3CLpro inhibitors showing antiviral effects against SARS-CoV-2. Graphical abstract [DISPLAY OMISSION]

Keyword

참고문헌 (27)

1 Zhu N. Zhang D. Wang W. Li X. Yang B. Song J. Zhao X. Huang B. Shi W. Lu R. Niu P. Zhan F. Ma X. Wang D. N Eng J Med 382 2019 727 733
2 Huang C. Wang Y. Li X. Ren L. Zhao J. Hu Y. Zhang L. Fan G. Xu J. Gu X. Cheng Z. Yu T. Xia J. Wei Y. Wu W. Xie X. Yin W. Li H. Liu M. Xiao Y. Gao H. Guo L. Xie J. Wang G. Jiang R. Lancet 395 2020 497 506 31986264
3 Ksiazek T.G. Erdman D. Goldsmith C.S. Zaki S.R. Peret T. Emery S. Tong S. Urbani C. Comer J.A. Lim W. Rollin P.E. Dowell S.F. Ling A.E. Humphrey C.D. Shieh W.J. Guarner J. Paddock C.D. Rota P. Fields B. DeRisi J. Yang J.Y. Cox N. N Eng J Med 348 2003 1953 1966
4 Peiris J.S. Lai S.T. Poon L.L. Guan Y. Yam L.Y. Lim W. Nicholls J. Yee W.K. Yan W.W. Cheung M.T. Cheng V.C. Chan K.H. Lancet 361 2020 1319 1325
5 Zaki A.M. van Boheemen S. Bestebroer T.M. Osterhaus A.D. Fouchier R.A. N Engl J Med 367 2012 1814 1820 23075143

상세보기
6 Butler D. Nature 492 2012 166 167 23235854

상세보기
7 Grein J. Ohmagari N. Shin D. Diaz G. Asperges E. Castagna A. Feldt T. Green G. Green M.L. Lescure F.X. Nicastri E. Oda R. Yo K. Quiros-Roldan E. Studemeister A. Redinski J. Ahmed S. Bernett J. Chelliah D. Chen D. Chihara S. Cohen S.H. Cunningham J. D'Arminio Monforte A. Ismail S. Kato H. Lapadula G. L'Her E. Maeno T. Majumder S. Massari M. Mora-Rillo M. Mutoh Y. Nguyen D. Verweij E. Zoufaly A. Osinusi A.O. DeZure A. Zhao Y. Zhong L. Chokkalingam A. Elboudwarej E. Telep L. Timbs L. Henne I. Sellers S. Cao H. Tan S.K. Winterbourne L. Desai P. Mera R. Gaggar A. N Engl J Med 382 2020 2327 2336 32275812

상세보기
8 Sheahan T.P. Sims A.C. Graham R.L. Menachery V.D. Gralinski L.E. Case J.B. Leist S.R. Pyrc K. Feng J.Y. Trantcheva I. Bannister R. Park Y. Babusis D. Clarke M.O. Mackman R.L. Spahn J.E. Palmiotti C.A. Siegel D. Ray A.S. Sci Transl Med 9 2017 eaal3653 28659436

상세보기
9 Wang M. Cao R. Zhang L. Cell Res 30 2020 269 271 32020029
10 Gordon C.J. Tchesnokov E.P. Woolner E. J Biol Chem 295 2020 6785 6797 32284326

상세보기
11 Hsu M.F. Kuo C.J. Chang K.T. Chang H.C. Chou C.C. Ko T.P. J Biol Chem 280 2005 31257 31266 15788388

상세보기
12 Pillaiyar T. Manickam M. Namasivayam V. Hayashi Y. Jung S.H. J Med Chem 59 2016 6595 6628 26878082

상세보기
13 He J. Hu L. Huang X. Int J Antimicrob Agents 56 2020 106055
14 Báez-Santos Y.M. St John S.E. Mesecar A.D. Antivir Res 115 2015 21 38 25554382

상세보기
15 Chuck C.P. Chong L.T. Chen C. Chow H.F. Wan D.C. Wong K.B. PLoS ONE 5 2010 e13197
16 Zhang L. Lin D. Sun X. Curth U. Drosten C. Science 368 2020 409 412 32198291

상세보기
17 Dai W. Zhang B. Jiang X.M. Su H. Li J. Zhao Y. Xie X. Jin Z. Peng J. Liu F. Li C. Li Y. Bai F. Wang H. Cheng X. Cen X. Hu S. Yang X. Wang J. Liu X. Xiao G. Jiang H. Rao Z. Science 368 2020 1331 1335 32321856

상세보기
18 Jin Z. Du X. Xu Y. Deng Y. Liu M. Zhao Y. Zhang B. Li X. Zhang L. Peng C. Duan Y. Yu J. Wang L. Yang K. Liu F. Jiang R. Yang X. You T. Liu X. Yang X. Bai F. Liu H. Liu X. Guddat L.W. Xu W. Xiao G. Qin C. Nature 582 2020 289 293 32272481
19 Jin Z. Zhao Y. Sun Y. Zhang B. Wang H. Wu Y. Zhu Y. Zhu C. Hu T. Du X. Duan Y. Yu J. Yang X. Yang X. Yang K. Liu X. Guddat L.W. Nat Struct Mol Biol 27 2020 529 532 32382072

상세보기
20 Ma C. Sacco M.D. Hurst B. Townsend J.A. Hu Y. Szeto T. Zhang X. Cell Res 30 2020 678 692 32541865
21 Riva L. Yuan S. Yin X. Martin-Sancho L. Matsunaga N. Pache L. Burgstaller-Muehlbacher S. De Jesus P.D. Teriete P. Hull M.V. Chang M.W. Chan J.F. Cao J. Poon V.K. Herbert K.M. Cheng K. Nguyen T.H. Rubanov A. Pu Y. Nguyen C. Choi A. Rathnasinghe R. Schotsaert M. Miorin L. Dejosez M. Zwaka T.P. Sit K.Y. Martinez-Sobrido L. Liu W.C. White K.M. Chapman M.E. Lendy E.K. Glynne R.J. Albrecht R. Ruppin E. Mesecar A.D. Johnson J.R. Benner C. Sun R. Schultz P.G. Su A.I. Nature 586 2020 113 119 32707573
22 Jan J.T. Cheng T.R. Juang Y.P. Ma H.H. Wu Y.T. Yang W.B. Cheng C.W. Chen X. Chou T.H. Shie J.J. Cheng W.C. Chein R.J. Mao S.S. Proc Natl Proc Sci USA 118 2021
23 Kuo C.J. Chao T.L. Kao H.C. Tsai Y.M. Liu Y.K. Antimicrob Agents Chemother 65 2021 e02577 20 33526482
24 Zhu W. Xu M. Chen C.Z. ACS Pharmacol Transl Sci 3 2020 1008 1016 33062953

상세보기
25 Pathak N. Chen Y.T. Hsu Y.C. ACS Nano 15 2021 857 872 33373194

상세보기
26 Kim J.M. Chung Y.S. Jo H.J. Osong Public Health Res Perspect 11 2020 3 7 32149036

상세보기
27 Shin J.S. Jung E. Kim M. Baric R.S. Go Y.Y. Viruses 10 2018 283 29795047

상세보기

LOADING...

활용도 분석정보

상세보기

다운로드

내보내기

활용도 Top5 논문

해당 논문의 주제분야에서 활용도가 높은 상위 5개 콘텐츠를 보여줍니다.
더보기 버튼을 클릭하시면 더 많은 관련자료를 살펴볼 수 있습니다.

원문 보기

AccessON 원문보기

원문 URL 링크

DOI : 10.1016/j.bmcl.2021.128067
Elsevier : 저널 > 논문
AccessON : 저널

*원문 PDF 파일 및 링크정보가 존재하지 않을 경우 KISTI DDS 시스템에서 제공하는 원문복사서비스를 사용할 수 있습니다.

오픈액세스(OA) 유형

GOLD(Hybrid)

저자가 APC(Article Processing Charge)를 지불한 논문에 한하여 자유로운 이용이 가능한, hybrid 저널에 출판된 논문

저작권 관리 안내

내보내기 메뉴

내보내기 구분

파일저장
인쇄
메일전송

구성항목

기본정보
상세정보

관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관

저장형식

Text(ASCII format)
Excel format
RefWorks Direct Export
RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley

메일정보

받는사람 (필수): @
보내는사람 (선택): @
제목
내용: KISTI 검색결과 이메일 서비스

안내

총 건의 자료가 검색되었습니다.

다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000)

검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다.

데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요)

다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다.
파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오.

Text(ASCII format)
Excel format

표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

AI-Helper ※ AI-Helper는 을 사용합니다.

AI-Helper

안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

연합인증