[논문]A simple method for the isolation of genomic DNA from mouse tail free of real-time PCR inhibitors

Burkhart, Catherine A; Norris, Murray D; Haber, Michelle

doi:10.1016/s0165-022x(02)00052-0

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[해외논문] A simple method for the isolation of genomic DNA from mouse tail free of real-time PCR inhibitors

Journal of biochemical and biophysical methods, v.52 no.2, 2002년, pp.145 - 149

Burkhart, Catherine A (Corresponding author. Tel.: +61-2-9382-1825) , Norris, Murray D (fax: +61-2-9382-1850) , Haber, Michelle (Children's Cancer Institute Australia for Medical Research, High St., P.O. Box 81, 2031 Randwick, Sydney, NSW, Australia)

Abstract ▼ AI-Helper

AbstractAlthough real-time PCR is a rapid, quantitative method for the analysis of gene and RNA levels, the presence of inhibitors in samples is an obstacle to its successful use. We have found that genomic DNA isolated from mouse tail tips using a standard proteinase K digestion method caused marked inhibition of real-time PCR. Inhibition was specific for mouse tail DNA since genomic DNA isolated from other tissue sources using the same methodology was readily amplified. We have therefore developed a nonproteinase K DNA isolation method involving the use of Chelex® 100 resin. This method produces mouse tail DNA that is free of real-time PCR inhibitors.

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참고문헌 (9)

Anal. Biochem. Winer 270 41 1999 10.1006/abio.1999.4085 Development and validation of real-time quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction for monitoring gene expression in cardiac myocytes in vitro

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Med. Pediatr. Oncol. Norris 35 585 2000 10.1002/1096-911X(20001201)35:6<585::AID-MPO20>3.0.CO;2-P Expression of N-myc and MRP genes and their relationship to N-myc gene dosage and tumor formation in a murine neuroblastoma model

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EMBO J. Weiss 16 2985 1997 10.1093/emboj/16.11.2985 Targeted expression of MYCN causes neuroblastoma in transgenic mice

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Mol. Cell. Probes Gilbert 7 227 1993 10.1006/mcpr.1993.1033 Determination of N-myc gene amplification in neuroblastoma by differential polymerase chain reaction

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Biochem. Mol. Med. Hofstetter 62 197 1997 10.1006/bmme.1997.2637 Genomic DNA from mice: a comparison of recovery methods and tissue sources

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Res. Microbiol. de Lamballerie 143 785 1992 10.1016/0923-2508(92)90107-Y A one-step microbial DNA extraction method using “Chelex 100” suitable for gene amplification

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BioTechniques Walsh 10 506 1991 Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material

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J. Clin. Microbiol. Al-Soud 38 4463 2000 10.1128/JCM.38.12.4463-4470.2000 Effects of amplification facilitators on diagnostic PCR in the presence of blood, feces, and meat

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J. Clin. Microbiol. Al-Soud 39 485 2001 10.1128/JCM.39.2.485-493.2001 Purification and characterization of PCR-inhibitory components in blood cells

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