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Enteric coronavirus TGEV: partial sequence of the genomic RNA, its organization and expression
Virus de la gastro-enterite transmissible (TGEV): sequence partielle, organisation et expression de l'ARN genomique 원문보기

Biochimie, v.69 no.6/7, 1987년, pp.591 - 600  

Rasschaert, D. (Institut National de la Recherche Agronomique, Station de Recherches de Virologie et d'Immunologie, F-78850 ,, Thiverval-Grignon, France) ,  Gelfi, J. ,  Laude, H.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

The sequence of the 3'-most 8300 nucleotides of the genome RNA of the Purdue-115 strain of the transmissible gastroenteritis virus TGEV, a porcine coronavirus, was determined from cDNA clones. The available sequence corresponds to the part of the genome (total length > 20 kb) expressed through subge...

Abstract

La sequence des 8300 nucleotides en region 3' de l'ARN genomique du coronavirus porcin TGEV (souche Purdue-115) a ete etablie a partir de clones d'ADNc. Par rapport au genome entier (>20 kb), cela recouvre l'ensemble des sequences exprimees par l'intermediaire d'ARNs messagers de taille subgenomique. Les 5 especes d'ARN subgenomiques et l'ARN genomique detectes dans les cellules infectees forment des sequences emboitees co-terminales en 3', ce qui est caracteristique du mode de replication des Coronaviridae. Une sequence hexamerique, 5CTAAAC, presente juste en amont de chaque region codante, constituerait le site d'initiation de la transcription des ARN subgenomiques du TGEV. Outre les genes des 3 proteines structurales E2, El et N precedemment identifies, deux regions X1 et X2, correspondant a la region @?unique@? des ARNm 4 et 3, pourraient coder pour des polypeptides non-structuraux, actuellement non-identifies. L'un despolypeptides predits, X1 (9.2 kDa) est extremement hydrophobe.Deux produits completement distincts, X2a (7.7 kDa)) et X2b (18.8 kDa), pourraient etre traduits a partis du mRNA 3. Aucun ARN susceptible d'exprimer la phase condante situee a l'extremite (X3) n'a ete mis en evidence.

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