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EzEditor: a versatile sequence alignment editor for both rRNA- and protein-coding genes 원문보기

International journal of systematic and evolutionary microbiology, v.64 no.2, 2014년, pp.689 - 691  

Jeon, Yoon-Seong (Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Lee, Kihyun (School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Park, Sang-Cheol (Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Kim, Bong-Soo (ChunLab, Inc., Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Cho, Yong-Joon (ChunLab, Inc., Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Ha, Sung-Min (School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Chun, Jongsik (Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea)

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

EzEditor is a Java-based molecular sequence editor allowing manipulation of both DNA and protein sequence alignments for phylogenetic analysis. It has multiple features optimized to connect initial computer-generated multiple alignment and subsequent phylogenetic analysis by providing manual editing...

참고문헌 (17)

  1. BMC Bioinformatics Bininda-Emonds 6 156 2005 10.1186/1471-2105-6-156 transAlign: using amino acids to facilitate the multiple alignment of protein-coding DNA sequences 

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  2. Appl Environ Microbiol Case 73 278 2007 10.1128/AEM.01177-06 Use of 16S rRNA and rpoB genes as molecular markers for microbial ecology studies 

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  3. Felsenstein 1993 phylip (phylogeny inference package) version 3.5.1 

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  5. Comput Appl Biosci Galtier 12 543 1996 seaview and phylo_win: two graphic tools for sequence alignment and molecular phylogeny 

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  15. Curr Protoc Bioinformatics Thompson 2002 Multiple sequence alignment using clustalw and clustalx 

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  17. Nucleic Acids Res Wernersson 31 3537 2003 10.1093/nar/gkg609 RevTrans: Multiple alignment of coding DNA from aligned amino acid sequences 

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