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문제 정의
- 또한, 각 적합도 함수간에 음 또는 양의 상관 관계가 있음을 제시하였다.
- 염기서열 디자인 문제에서 해 공간은 생성해 낼 수 있는 가능한 모든 염기서열의 집합인데, 이는 지나치게 방대한 공간이므로 적당한 범위로 제한하여 조사해 보았다. 또한, 각각의 조건들 중에는 상호 관계가 있는 조건이 있을 수 있는데 이에 대해서도 분석해 보았다.
- 본 논문에서는 염기서열 디자인 문제에서 주로 사용되는 조건들을 적합도 함수로 표현하고, 그 형태를 해 고간 상에서 조사해 보았다. 염기서열 디자인 문제에서 해 공간은 생성해 낼 수 있는 가능한 모든 염기서열의 집합인데, 이는 지나치게 방대한 공간이므로 적당한 범위로 제한하여 조사해 보았다.
- 본 논문에서는 염기서열 디자인 문제에서 주로 쓰이는 적합도 함수를 정리하고, 해 공간 내에서의 형태를 제시하였다. 또한, 각 적합도 함수간에 음 또는 양의 상관 관계가 있음을 제시하였다.
- 본 장에서는 염기서열 디자인 문제에 주로 사용되는 조건을 적합도 함수로 표현하고, 해 공간에서의 형태를 조사해 보았다. 여기서 해 공간몬 생성 가능한 모든 염기서열의 조합이지만, 이는 지나치게 방대하여 길이 5인 염기서열 2개의 집합으로 제한하였다.
- 상에서 조사해 보았다. 염기서열 디자인 문제에서 해 공간은 생성해 낼 수 있는 가능한 모든 염기서열의 집합인데, 이는 지나치게 방대한 공간이므로 적당한 범위로 제한하여 조사해 보았다. 또한, 각각의 조건들 중에는 상호 관계가 있는 조건이 있을 수 있는데 이에 대해서도 분석해 보았다.
- 우선 가장 중요한 적합도 함수에 해당하는 유사도와 H-Meas니伯를 생각해보자. 두 가지 적합도 함수 모두 최소화하는 염기서열 집합이 최적의 집합이다.
가설 설정
- 몬 논문에서는 비슷한 물리적 조건을 가지는 염기서열의 집합율 생성하는 문제로 가정하였다. 이 때 고려되는 조건으로는 절반 정도의 이중 가닥이 단일 가닥으로 뚠리되는 온도인 Tm과 염기서열 내에 G나 C가 차지하는 비家이 있다.
- 여기서 해 공간몬 생성 가능한 모든 염기서열의 조합이지만, 이는 지나치게 방대하여 길이 5인 염기서열 2개의 집합으로 제한하였다. 여기에서는 염기서열 디자인 문제를 서로 같은 길이의 서로 다른 염기서열 집합을 생성하는 것으로 가정하였다.
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