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콜로니 픽킹 로봇 시스템의 개발 (I) - 콜로니 위치확인 영상처리 알고리즘 -
Development of Robot System for Colony Picking (I) - Image processing algorithm for detecting position of colony 원문보기

한국농업기계학회 2003년도 동계 학술대회 논문집, 2003 Feb. 01, 2003년, pp.215 - 220  

이현동 (충남대학교 농업생명과학대학 농업기계공학과) ,  김기대 (충남대학교 농업생명과학대학 농업기계공학) ,  김찬수 (㈜엔에스) ,  나건영 (충남대학교 농업생명과학대학 농업기계공학) ,  임용표 (충남대학교 농업생명과학대학 원예학과)

초록
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인간 게놈 프로젝트가 지속적으로 진행됨에 따라 계속적으로 대량의 유전체 정보가 밝혀지고 있으며, 이미 밝혀진 유전체의 염기서열을 바탕으로 다양한 생물의 전체 유전자의 기능을 효율적으로 해석하는 기술의 개발이 요구되고 있다. 식물 게놈 프로젝트 또한 식량확보라는 단순하면서도 전략적인 차원에서 가장 절실히 요구되는 기본 과학기술 연구분야이다. 게놈(genome)은 유전자(gene)와 염색체(chromosome)의 합성어로 한 생물체가 지닌 모든 유전 정보의 집합체이고, 동종의 재결합 DNA 분자를 포함하는 동일 세포의 개체를 클론(clone)이라 하며, 클론의 집합체를 콜로니(Colony)라 한다 생물체의 모든 유전정보를 가진 게놈은 핵산(nucleotide acid)이라 불리는 염기로 이루어져 있으며, 이들은 서로 상보적인 쌍을 이루어 두 가닥으로 형성되어 있다. 이를 한 쌍의 base pair라 한다. (중략)

AI 본문요약
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문제 정의

  • 이 흰색의 콜로니만을 추출해 내는 것이 바로 콜로니 픽킹(colony picking) 이라한다. 따라서, 본 연구는 현행 수작업으로 진행되는 콜로니 픽킹을 자동화하기 위해 콜로니 픽킹로봇 시스템을 개발하기 위한 전단계 연구로서 콜로니의 판별 및 위치검출을 위한 시스템 구축 및 영상처리 알고리즘을 개발하는데 목적이 있으며, 그 구체적인 내용은 다음과 같다.
  • 본 시험에서는 배양된 콜로니의 위치를 영상처리를 통하여 검출하기 위하여 배추 게노믹 DNA를 가지고 있는 BAC clone을 37℃ 암상태에서 18시간동안 배양한 콜로니를 대상으로 시험을 실시하였다. 우선 독립적인 콜로니 및 콜로니의 위치를 정확하게 인식하는가를 판단하는 시험을 실시하였고, 콜로니 추출 알고리즘을 통한 콜로니 집락을 독립된 콜로니로 나누어 인식하는지를 알아보았고, 수작업에 의한 콜로니의 인식과의 비교를 통한 알고리즘의 신뢰성을 검증하였다.
  • 본 연구는 입력받은 영상정보를 통해 배양된 콜로니의 위치를 검출하는 것이 목적이며, 그에 따라 영상정보로부터 거리를 추출해 내야 한다. 이미 정해져 있는 높이에 카메라를 장착시키고 배양용기가놓여질 위치에 가로세로 10mm의 정방형 격자가 그려진 도면을 위치시켜 영상 내에서 1화소당 실제 거리를 산출해 내었다.
  • 본 연구는 현행 수작업으로 진행되는 콜로니 픽킹을 자동화하기 위해 콜로니 픽킹 로봇 시스템을 개발하기 위한 전단계 연구로서 콜로니의 판별 및 위치검출을 위한 영상처리 알고리즘을 개발하는 연구로 그 구체적인 연구결과는 다음과 같다.
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