$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

[국내논문] 단백질 구조 비교를 위한 전처리 기법으로서의 주성분 분석
Principal Component Analysis as a Preprocessing Method for Protein Structure Comparison 원문보기

한국정보처리학회 2004년도 제22회 추계학술발표논문집(상), 2004 Nov. 01, 2004년, pp.805 - 808  

박성희 (한국전자통신연구원 바이오정보연구팀) ,  박찬용 (한국전자통신연구원 바이오정보연구팀) ,  김대희 (한국전자통신연구원 바이오정보연구팀) ,  박수준 (한국전자통신연구원 바이오정보연구팀) ,  박선희 (한국전자통신연구원 바이오정보연구팀)

초록
AI-Helper 아이콘AI-Helper

본 논문에서는 두 단백질의 구조적 유사성을 기반으로 한 단백질 비교를 위해서 전처리 기법으로서의 주성분분석기법을 소개한다. 기존의 백본 및 알파탄소 간의 거리행렬(distance matrix), 2차 구조 비교기법, 구역(segment)단위의 비교 기법과 같은 단백질 비교 기법들은 위치이동(translation)와 회전(rotation)에 불변한(invariant) 차이를 구하기 위하여 거리행렬을 이용하였다. 그리고, 난 다음 이들의 최적화 과정을 거쳤다. 그러나, 본 논문에서 제시하는 전처리 기법으로서의 주성분분석기법은 단백질 구조를 전체적인 구조 관점에서 위치를 정렬시킨 후에 단백질 간의 구조를 비교하는 방식이다. 단백질의 구조의 방향성(Orientation)을 맞춘 다음에는 다양한 단백질 표현으로 구를 비교할 수 있다. 본 논문에서는 두 단백질의 구조의 유사성을 측정하기 위한 간결한 단백질 표현(representation)으로 3 차원 에지 히스토그램을 사용하였다. 이 기법은 방향성을 정렬하기 위하여 기존의 방법에서 사용되었던 반복적인 거리계산을 통한 최적화하는 과정을 없앰으로써 단백질 구조 비교 시간을 단축할 수 있는 새로운 단백질 구조 비교 패러다임을 가능하게 한다. 따라서, 이 패러다임을 통하여 적절한 단백질 구조 방향성 정렬과 단백질 구조 표현을 이용한 단백질 구조 비교 검색 시스템은 많은 양의 단백질 구조 정보로부터 원하는 형태의 단백질 구조를 빠른 시간에 검색할 수 있는 장점을 가질 수 있다.

AI 본문요약
AI-Helper 아이콘 AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

문제 정의

  • 따라서, 두 단백 질의 구조간의 유사성을 측정하는 방법은 두 단백질 의 기능의 유사성을 유추할 수 있다. 즉, 구조결정학 자들은 새롭게 밝혀낸 단백질 구조와 기존에 기능이 알려진 단백질의 구조와 비교를 통하여 새로운 단백 질의 기능을 예측하려 하였다.
  • 본 논문에서는 또다른 단백질 비교 알고리즘의 접 근으로 단백질 구조의 이동 및 회전에 영향을 받은 단백질 구조 비교 알고리즘을 위하여 단백질 구조를 전체적으로 방향성(orientation)올 정렬한 후 간단한 단백질 표현에 의해 유사도를 측정하는 단백질 비교 방 식을 제안한다.
  • 논문에서는 단백질의 구조의 특징을 이용하여 먼저 단백질 구조를 정렬한 후 단백질의 유사도를 계산하는 방식을 제안한다. 그 방법의 효용성을 보이기 위하여, 본 논문에서는 단백질을 구성하는 원자들의 3 차 원 좌표를 3차원 자료로 보고 주성 분 분석을 하여 단 백질의 방향성을 정렬하는 방법올 제시한다.
  • 본 논문에서는 이러한 주성분 분석을 통한 단백질 구조의 방향성 정렬을 수행한다. 주성분 분석에 의한 단백질 구조의 방향성 정렬의 결과를 다음 장에서 살 펴본다.
본문요약 정보가 도움이 되었나요?
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로