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ITS, trnLF 염기서열을 이용한 한약재 하고초 (Prunella Spike)의 기원 및 유연관계
Phylogenetic Analysis of Prunella Spike (Ha-go-cho) on the Basis of ITS and trnL-F Sequences 원문보기

한국약용작물학회 2008년도 추계학술발표회, 2008 Nov. 13, 2008년, pp.475 - 476  

양덕춘 (경희대학교) ,  배갈마 (경희대학교) ,  김명겸 (경희대학교) ,  노종훈 (경희대학교)

초록이 없습니다.

AI 본문요약
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제안 방법

  • 작물과학원에서 채취한 하고초 식물체와 현재 시중에서 유통되고 있는 하고초 (한국산, 중국산) 한약재를 구입하여 액체질소로 얼린 후 유발에서 마쇄하고 Invisorb Spin Plant Mini DNA isolation kit (Invitek 社)를 이용하여 DNA를 추출하였다. agarose gel과 UV spectrophotometer를 이용하여 분석 및 정량하였다.
  • trnL-F 염기서열을 분석하기 위해, trnL-F 영역의 universal primer인 c와 f 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 pre-denaturation 96°C, 2 min; denaturation 96°C, 30 sec; annealing 60°C, 30 sec; extension 72°C, 60 sec; 36 cycles 조건으로 수행하였고, ITS 염기서열을 분석하기 위해, ITS 영역의 universal primer인 p1과 4R 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 pre-denaturation 96°C, 2 min; denaturation 96°C, 30 sec; annealing 50°C, 30 sec; extension 72°C, 2 min; 36 cycles 조건으로 수행하였다.
  • 얻어진 하고초의 염기서열을 NCBI에서 Blast를 수행하였다. 계통수를 그리기 위하여 BioEdit 프로그램으로 식물체의 염기서열들을 편집하였고, ClustalX 프로그램으로 염기서 열을 정렬하였다. Phylogenetic tree는 MEGA4 프로그램을 사용하였다.
  • 얻어진 하고초의 염기서열을 NCBI에서 Blast를 수행하였다. 계통수를 그리기 위하여 BioEdit 프로그램으로 식물체의 염기서열들을 편집하였고, ClustalX 프로그램으로 염기서 열을 정렬하였다.
  • 작물과학원에서 채취한 하고초 식물체와 현재 시중에서 유통되고 있는 하고초 (한국산, 중국산) 한약재를 구입하여 액체질소로 얼린 후 유발에서 마쇄하고 Invisorb Spin Plant Mini DNA isolation kit (Invitek 社)를 이용하여 DNA를 추출하였다. agarose gel과 UV spectrophotometer를 이용하여 분석 및 정량하였다.
  • Lilacina Nakai 또는 하고초 Prunella vulgaris Linne (꿀풀과 Labiatae)의 꽃대가 하고초로 승인되어 유통되어지고 있다. 하고초의 엽록체 DNA인 trnL-F 염기서열과 핵 DNA인 Internal Transcribed Sequence (ITS) 염기서열 분석을 통하여 하고초로 유통되고 있는 한약재의 기원 및 유연관계를 확인하였다.

데이터처리

  • 계통수를 그리기 위하여 BioEdit 프로그램으로 식물체의 염기서열들을 편집하였고, ClustalX 프로그램으로 염기서 열을 정렬하였다. Phylogenetic tree는 MEGA4 프로그램을 사용하였다.
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