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연합인증

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DNA 지문분석을 통한 형개(Schizonepeta tenuifolia)의 유연관계 분석
Phylogenetic Analysis of Hyung-Gae (Schizonepeta tenuifolia) by DNA fingerprinting technique 원문보기

한국약용작물학회 2008년도 춘계학술발표회, 2008 May 08, 2008년, pp.302 - 303  

양덕춘 (Korean Ginseng Center for Most Valuable Products & Ginseng Genetic Resource Bank, Kyung Hee University) ,  베갈마 (Korean Ginseng Center for Most Valuable Products & Ginseng Genetic Resource Bank, Kyung Hee University) ,  김명겸 (Korean Ginseng Center for Most Valuable Products & Ginseng Genetic Resource Bank, Kyung Hee University) ,  노종훈 (Korean Ginseng Center for Most Valuable Products & Ginseng Genetic Resource Bank, Kyung Hee University)

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  • ▣ 형개의 염기서열을 얻은 후, NCBI에서 BLAST를 수행하여 근연관계에 있는 염기서열을 모두 수집하였다. CLUSTAL X 프로그램을 이용하여 MEGA 프로그램을 이용하여 phylogenetic tree를 작성하였다.
  • 작물과학원과 경희대학교 농장, 식약청 약초시험장에서 체취한 형개 식물체와 현재 시중에서 유통되고 있는 형개(한국산, 중국산) 한약재를 구입하여 액체질소로 얼린 후 유발에서 마쇄하고 Plant DNA isolation kit(GeneAll 社 )를 이용하여 DNA를 추출하였다. agarose gel과 UV spectrophotometer를 이용하여 정량하였다.
  • ITS 염기서열을 결정하기 위해, ITS 영역의 universal primer인 5F 와 4R 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 수행하였다. 프라이머의 염기서열은 5F (5'-GGA AGT AAAAGT CGT AAC AAG G-3‘)와 4R(5’ -TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3')이었으며, PCR condition은 pre-denaturation 96°C, 2 min; denaturation 96°C, 30 sec; annealing 60°C, 30 sec; extension 72°C, 120 sec; 35 cycles 이었다.
  • trnL-F 염기서열을 결정하기 위해, trnL-F 영역의 universal primer인 c와 f 프라이머
    를 이용하여 PCR 증폭을 수행하였다
    . 프라이머의 염기서열은 c (5'-CGA AAT CGG
  • 형개의 염기서열을 얻은 후, NCBI에서 BLAST를 수행하여 근연관계에 있는 염기서열을 모두 수집하였다. CLUSTAL X 프로그램을 이용하여 MEGA 프로그램을 이용하여 phylogenetic tree를 작성하였다.
  • 작물과학원과 경희대학교 농장, 식약청 약초시험장에서 체취한 형개 식물체와 현재 시중에서 유통되고 있는 형개(한국산, 중국산) 한약재를 구입하여 액체질소로 얼린 후 유발에서 마쇄하고 Plant DNA isolation kit(GeneAll 社 )를 이용하여 DNA를 추출하였다. agarose gel과 UV spectrophotometer를 이용하여 정량하였다.
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