[논문]한우 Leptin 비만 유전자와 도체 및 육질 형질과의 연관성 구명

신성철; 정화철; 김희선; 전상희; 권수연; 김보현; 정구용; 정의룡

한우 Leptin 비만 유전자와 도체 및 육질 형질과의 연관성 구명 원문보기

신성철 (상지대학교 동물생명자원학부) , 정화철 (상지대학교 동물생명자원학부) , 김희선 (상지대학교 동물생명자원학부) , 전상희 (상지대학교 동물생명자원학부) , 권수연 (상지대학교 동물생명자원학부) , 김보현 (상지대학교 동물생명자원학부) , 정구용 (상지대학교 동물생명자원학부) , 정의룡 (상지대학교 동물생명자원학부)

본 연구는 인간과 동물의 식욕조절, 에너지 대사, 체지방 축적 및 지방 대사에 핵심적인 역할을 담당하는 비만 유전자 leptin의 SNP를 검색하고, 이들 SNP 마커와 한우의 도체 및 육질형질들과의 연관성을 구명하여 고급육 생산 한우 조기 선발 및 육질 진단을 위한 분자 표지 마커로 활용하기 위하여 수행하였다. 한우 leptin 유전자의 exon 2 및 3번 영역을 포함한 염기서열 분석결과 총 3개의 SNP를 검출하였고, PCR-RFLP및 SSCP기법을 이용하여 SNP유전자형을 분석한 결과 exon 2 영역 내 C1180T SNP부위가 한우의 근내 지방도 및 등지방 두께와 유의적인 연관성(p<0.05)이 있는 것으로 나타났다. 따라서, 본 연구를 통해 개발된 한우 leptin 유전자의 특정한 SNP marker는 근내 지방도가 우수한 고급육을 생산하는 한우의 조기식별 및 마블링 등 육질진단에 매우 유용한 DNA 표지인자로 활용할 수 있을 기대된다.

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

문제 정의

Leptin 호르몬의 이러한 생리적 특성은 지방대사(lipid metabolism)와 관련된 가축의 주요경제형질(체중, 성장률, 근내지방도, 등지방 등에 관련된 후보유전자로서의 가능성을 제시하고 있다. 따라서 본연구는 한우 leptin 비 만유전자의 single nucleotide polymorphism(SNP)을 분석하고 SNP 마커와 한우의 도체 및 육질 형질과의 연관성을 구명하고자 실시하였다.

제안 방법

각 공시축으로부터 혈액을 채취하고, Genomic DNA의 분리 및 정제는 Salting out 방법을 일부 변경하여 수행하였다.
검출된 exon3 영역의 3100번째 C/T 염기치환에 따른 SNP에 대해 SSCP 분석을 실시한 결과 Fig. 3에 제시한 바와 같이 C/C, C/T 및 T/T 각각의 유전자형에 따른 SNP marker를 검출하였다.
검출된 한우 leptin 유전자의 SNP 중 제한 효소 인지 부위가 존재하지 않는 exon3 영역 내 SNP(C₃₁00T)의 SNP genotyping은 PCR-SSCP 기법을 이용하여 SNP marker# 분석하였다 (Table 1). PCR product# 95°C에서 5분간 변성 후 7M Urea가 함유된 변성 polyacrylamide gel을 이용하여 전기영동한 후 유전자형 SNP marker를 결정하였다.
염기 서열 분석을 통해 검출된 한우 leptin 유전자의 exon2 및 3번 영역 내 총 3개의 SNP 부위를 검출하고, 검출된 이들 SNP 부위를 인지하는 제한 효소가 존재하는 exon2 영역의 2개 SNPCA1127T, C₁₁80T)에 대한 PCR-RFLP 분석을 실시하였다. 각 SNP의 PCR-RFLP 분석을 위한 primer 설계, PCR fragment size 및 restriction enzyme은 Table 1에 제시하였다.
한우 leptin 유전자의 exon2 영역과 exon3 영역을 각각 포함하는 primer를 설계 및 합성하여 PCR로 증폭한 후, SNP 검출을 위해 ABI PRISM 3700 DNA analyzer(Applied Biosystems, Foster City CA)를 이용하여 Direct sequencing 법으로 한우 leptin 유전자의 염기 서 열을 분석하였다.

대상 데이터

결과 총 3개의 SNP를 검출하였다. Exon2 영역에서 A1127T, C₁₁80T 등 2개의 SNP를 검출하였고, exon3 영역에서 C₃₁00T등 1개의 SNP를 검출하였다(GenBank accession no. U50365).
본 연구 개발에 사용한 한우는 국가 능력검정사업에 등록하고 후대검정을 통하여 혈통기록과도체성적을 보유하고 있는 제 32차(162두) 및 33차(147두) 후대 검정우 집단 총 309두를 공시축으로 선정하였다.

데이터처리

도체 및 육질 형질에 영향을 미치는 leptin 유전자의 SNP marker 효과를 분석하기 위해 SAS 8.1 프로그램의 일반선형모형 (GLM)분석법으로 통계처리 하여 연관성을 분석하였다.

성능/효과

A/T 염기치환에 따른 1127번째 SNP 부위에 Clal 제한 효소를 처리하여 agarose gel에 전기영동한 결과, Fig. 1에 제시된 바와 같이 A대립유전자는 1개의 제한 효소 인지 부위가 존재하여 215 및 252bp 크기를 갖는 총 2개의 band가 검출되었고, A/T 이형 접합체는 215, 252 및 469bp 크기를 갖는 총 3개의 band가 검출되었다. 또한, C/T 염기 치환에 따른 1180번째 SNP 부위에 Kpn2\ 제한 효소를 처리하여 8% 비변성 polyacryamide gel에 전기영동한 결과, Fig.
Direct sequencing을 통해 한우 leptin 유전자의 exon2 영역과 exon3 영역의 염기 서열을 분석한 결과 총 3개의 SNP를 검출하였다. Exon2 영역에서 A1127T, C₁₁80T 등 2개의 SNP를 검출하였고, exon3 영역에서 C₃₁00T등 1개의 SNP를 검출하였다(GenBank accession no.
Leptin 유전자의 SNP marker와 한우 도체 및 육질관련 형질과의 연관성을 통계 분석한 결과, exon 2 영역 내 C₁₁80T SNP가 한우 근내 지방도 및 등지방 두께와 유의적인 연관성을 가지고 있는 것으로 나타났다(P<0.05). 즉, C/C유전자형을 가진 개체들이 C/T 및 T/T 유전자형을 가진 개체들에 비해 근내 지방도와 등지방 두께에서 높은 값을 나타냈다(Table 2).
1에 제시된 바와 같이 A대립유전자는 1개의 제한 효소 인지 부위가 존재하여 215 및 252bp 크기를 갖는 총 2개의 band가 검출되었고, A/T 이형 접합체는 215, 252 및 469bp 크기를 갖는 총 3개의 band가 검출되었다. 또한, C/T 염기 치환에 따른 1180번째 SNP 부위에 Kpn2\ 제한 효소를 처리하여 8% 비변성 polyacryamide gel에 전기영동한 결과, Fig. 2에 제시된 바와 같이 C 대립 유전자는 1개의 제한 효소 인지 부위가 존재하여 19 및 75bp 크기를 갖는 총 2개의 band가 검출되었고, T 대립유전자는 제한 효소 인지 부위가 존재하지 않아 94bp 크기의 단일 band가 검출되었다. C/T 이형접합체형의 경우 이들 세 종류 DNA band가 모두 검출되었다.
05). 즉, C/C유전자형을 가진 개체들이 C/T 및 T/T 유전자형을 가진 개체들에 비해 근내 지방도와 등지방 두께에서 높은 값을 나타냈다(Table 2).

내보내기 구분	파일저장 인쇄 메일전송
구성항목	기본정보 상세정보 관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관 관리번호, 논문명, 대등논문명, 저자 , 저널/프로시딩명, 발행기관, 발행년, 발행언어, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, ISBN, ISSN, 주제분야, 키워드, 초록(한글), 초록(영문), 저자(소속기관)
저장형식	Text(ASCII format) Excel format RefWorks Direct Export RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley
메일정보	받는사람 (필수) @ 보내는사람 (선택) @ 제목 내용 KISTI 검색결과 이메일 서비스
안내	총 건의 자료가 검색되었습니다. 다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000) 검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다. 데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요) 다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다. 파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오. ~ Text(ASCII format) Excel format

연합인증

한우 Leptin 비만 유전자와 도체 및 육질 형질과의 연관성 구명 원문보기

초록
AI-Helper

AI 본문요약
AI-Helper

문제 정의

제안 방법

대상 데이터

데이터처리

성능/효과

이 논문을 인용한 문헌

관련 콘텐츠

원문 보기

이 논문과 함께 이용한 콘텐츠

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

선택된 텍스트

연합인증

한우 Leptin 비만 유전자와 도체 및 육질 형질과의 연관성 구명 원문보기

초록 용어보기논문에서 용어와 풀이말을 자동 추출한 결과로, 시범 서비스 중입니다. AI-Helper

AI 본문요약 엑셀 다운로드 AI-Helper

문제 정의

제안 방법

대상 데이터

데이터처리

성능/효과

이 논문을 인용한 문헌

관련 콘텐츠

원문 보기

이 논문과 함께 이용한 콘텐츠

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

선택된 텍스트

초록
AI-Helper

AI 본문요약
AI-Helper