선택한 단어 수는 입니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
선택한 단어 수는 30입니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
문제 정의
- 본 연구의 목적은 색인전문가가 통제어휘를 사용하여 색인하는 과정에서 색인전문가를 효율적으로 지원할 수 있는 반자동색인방법을 모색하고자 한다.
제안 방법
- KoreaMed는 PubMed와 동일하게 영어로 작성되는 데이터베이스로 최근 종별(species: humans, animals), 성별(gender), 연령별(age groups), 특정유형의 동물명 등 연구대상을 기술하는 MeSH의 체크태그(check tag) 를 부여하여 제한기능(limit option)으로 구현하였다. 그리고 임상근거를 체계적인 의학문헌의 고찰을 통해 획득하려는 EBM 환경하에서는 특히 임상연구(clinical trials)의 검색이나 체계적 문헌고찰(systematic reviews), 특정질병의 원인(etiology), 진단(diagnosis), 예후(prognosis) 그리고 치료(therapy)의 검색에 대한 KoreaMed 이용자들의 요구를 충족 시키고 검색의 재현율을 높이는 동시에 정확률을 높이는 검색어 집합을 제공하기 위해서 MeSH에 의한 색인 작성이 불가피한 상황이다.
- PubMed에서 연구대상 논문을 "korean j urol"[Journal] AND Limits: Publication Date from 2010으로 검색하여 PubMed 레코드의 상세화면에서 제시되는 PRC의 첫 번째 문헌을 MeSH가 포함되어있는 MEDLINE 형식으로 저장하여 파일을 생성하였다.
- 8로 설정하여 MeSH 용어를 추출하였다. 결과 MTI MeSH 추천어 집합을 생성하였다. <그림2>는 MTI에 문헌의 제목과 초록을 입력하여 추천받은 결과의 예이다.
- 구체적으로 MTI에서 추천한 MeSH 용어를 사용하여 기관, 질병, 질병의 원인, 치료와 결과 등의 임상논문의 주제와 치료유형, 치료기관, 시설, 의료인의 유형 등을 나타내는 보건관련 주제 등 문헌의 내용을 MeSH 주표목(main heading)으로 부여할 수 있는지와 주표목의 특정 관점을 표현하는 부표목(subheading, NLM의 공식용어는 qualifier임)과 PubMed 레코드의 유사주제문헌(Relation Citations, PRC)를 참조하여 MeSH 주표목에 적합한 부표목을 부여할 수 있는지, 논문의 제목과 초록에 나타난 체크태그 관련 용어들을 MTI에서 어느 정도 추천하고 일치하고 있는지를 분석하였다.
- 둘째, 논문의 주제를 나타내는 주표목과 연구대상을 기술하는 체크태그, 주표목의 특정 관점을 표현하는 부표목 등 MeSH 용어의 유형에 따라 MTI MeSH 추천어와 유사도가 가장 높은 PRC에 부여된 MeSH, 그리고 논문의 저자가 부여한 키워드(저자키워드)를 분류하였다.
- MetaMap은 비정형문에서 UMLS 메타시소러스 개념을 찾아주는 자연어 처리 기반의 툴이다. 문장을 명사구로 파싱(parsing)을 한 후, 명사구의 철자변이, 약어, 동의어, 어형변화 등의 변형집합을 생성하여 이 변형집합에 포함된 후보 용어들을 만들고 매핑의 강도를 점수화하여 후보용어들 중에서 문장의 구와 가장 잘 매핑된 용어를 결과로 제시한다. UMLS에서 용어가 주어지면 의미론적으로 가장 가까운 MeSH 용어를 한정하여 추천한다.
- 셋째, MeSH 용어의 유형에 따라 MTI MeSH 추천어와 저자키워드를 PRC MeSH 에 비교하여 일치여부를 조사하였다.
- MTI의 MetaMap과 PRC에 Path 가중치는 디폴트 값인 7:2로 설정하였다. 유사도가 높은 10개의 PRC 문헌을 대상으로 Major Topic과 MeSH 용어를 디폴트값인 1:0.8로 설정하여 MeSH 용어를 추출하였다. 결과 MTI MeSH 추천어 집합을 생성하였다.
- 이를 위하여 PubMed에 등재된 국내 의학학술지중에서 MEDLINE 학술지가 아니라서 국내의 색인전문가가 MeSH를 부여해야 하는 학술지를 대상으로 다음과 같은 비교분석을 하였다.
- 이후 PRC MeSH에 대한 MTI MeSH 추천어, 저자키워드의 일치여부를 비교분석하였다. 일치여부는 MeSH의 유형별로 PRC 주표목과의 완전일치, 부분일치(우선어, 단･복수표기, 약어, 도치어, 상위어, 하위어)여부, 부표목과 체크태그로 구분하였다.
- 이후 PRC MeSH에 대한 MTI MeSH 추천어, 저자키워드의 일치여부를 비교분석하였다. 일치여부는 MeSH의 유형별로 PRC 주표목과의 완전일치, 부분일치(우선어, 단･복수표기, 약어, 도치어, 상위어, 하위어)여부, 부표목과 체크태그로 구분하였다. <그림 4>는 연구의 진행과정을 도식화 한 것이다.
- 첫째, 각 문헌의 제목과 초록을 MTI에 입력하여 MeSH 용어를 추천받았다.
대상 데이터
- MTI에 문헌의 제목과 초록을 입력하여 MeSH 주표목, 체크태그, 부표목을 추천받았다. MTI의 MetaMap과 PRC에 Path 가중치는 디폴트 값인 7:2로 설정하였다.
- 본 연구에서는 PubMed 학술지중에서 MeSH가 부여되지 않은 학술지인 Korean Journal of Urology(KJU) 2010년 1월-7월호 95편을 대상으로 저자키워드가 부여되지 않은 논설(editorial) 2편을 제외한 93편(이하 연구대상문헌)을 선정하였다. KJU는 2010년부터 PMCl에 등재되는 과정을 통해 PubMed에 레코드가 생성되는 학술지로 PubMed 레코드에 PRC를 활용할 수 있으므로 MTI에서 추천한 MeSH 용어와의 비교가 가능하다.
이론/모형
- ② 문헌에서는 제목, 초록, MeSH에서 용어를 추출한다. 제목의 단어는 초록의 단어에 2배의 가중치를 부여하여 Local weight scheme에 활용한다. MeSH용어의 경우 부표목을 포함하는 용어는 부표목을 포함한 주표목과 부표목을 제외한 주표목으로 2배의 가중치를부여한다.
성능/효과
- 체크태그의 경우 저자키워드에는 논문의 주제를 3-5개로 부여하기 때문에 잘 반영되지 않았고 저자키워드의 부표목도 마찬가지였다. MTI 부표목은 MTI 체크태그보다 용어 수는 많은 반면 체크태그 일치율 18.1%에 비해 16.5%로 낮은 일치율을 보였다.
- 5%)이다. MTI에서 추천한 부표목이 체크태그에 비해 많았음에도 불구하고 PRC와의 일치는 부표목보다는 체크 태그가 높았다.
- PRC MeSH와 MTI MeSH 추천어를 비교하였을 때 에서와 같이 MTI 주표목 174개(21.1%)가 PRC MeSH와 일치한 주표목이었다.
- 4%가 주표목이었다. PRC와 MTI를 비교했을 때 MTI에서는 체크태그보다는 부표목을 PRC는 부표목보다 체크태그를 상대적으로 많이 부여하였다. 연구대상을 기술하는 체크태그의 경우 문헌의 “연구대상과 방법”이나 본문의 “표”에 기술된다.
- 연구대상을 기술하는 체크태그의 경우 문헌의 “연구대상과 방법”이나 본문의 “표”에 기술된다. 따라서 문헌의 제목과 초록을 MTI에 입력하였으므로 체크태그의 비율이 부표목에 비해 낮게 나타났다. PRC의 경우 NLM의 색인전문가에 의해 작성되는 MeSH이므로 체크태그가 충분히 부여되었다.
- 또한 PRC의 유사도가 높은 논문에 부여된 MeSH 용어가 MTI에서 추천하는 용어와 주표목에서는 21.1%, 체크태그에서는 18.1%, 부표목에서는 16.5%로 일치하였다. PRC에서는 평균 16.
- 연구대상문헌을 PRC MeSH와 MTI MeSH 추천어, 저자키워드에 의해 분석한 결과 연구대상논문에 대한 전체 MTI MeSH 추천어는 514개이고 이중에서 306개가 주표목, 122개가 부표목, 86개가 체크태그였다. <표 1>과 같이 PRC에서는 논문 1편당 평균 16.
- 주표목의 경우 MTI MeSH의 일치율 21.1%에 비해 저자키워드의 일치율이 23.4%로 높았다. 체크태그의 경우 저자키워드에는 논문의 주제를 3-5개로 부여하기 때문에 잘 반영되지 않았고 저자키워드의 부표목도 마찬가지였다.
후속연구
- 또한 체크태그의 경우 full text에서 연구대상을 나타내는 단락을 검토하여 부여하는 방안과 문헌에서의 주표목의 관점과 의미를 잘 반영할 수 있도록 부표목을 정확하고 신속하게 부여할 수 있는 방법을 제안하는 것이 향후 과제로 남아있다.
- 색인전문가가 통제어휘를 사용하여 색인하는 경우 PRC와 MTI의 MeSH 주표목과 저자키워드가 일치하는 용어를 주표목으로 부여하고, PRC와 MTI가 추천하는 체크태그와 부표목을 활용하는 등 국내 의학문헌의 MeSH 용어 부여 작업을 반자동화하면, 정확하고 신속한 MeSH 부여 작업이 가능할 것이다.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.