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문제 정의
- 이외에도 차차세대 유전자 서열 시퀀싱 기법으로 SRMT 방식을 활용하여 단편서열을 생성하는 PacBio와 반도체를 활용하는 Ion Torrent 방식이 개발되었다. 본 논문에서는 분석 시뮬레이터에서 기반 시퀀서로 하는 NGS 기법 및 이전 시퀀싱 방식 중에서 신뢰도가 높은 Sanger 기법을 분석한다.
- 참조 유전자 서열로부터 리드를 생성하는 시뮬레이터가 개발됨에 따라 매핑 도구에서도 다양한 실험을 위해 시뮬레이터들을 활용하게 되었는데, 각각의 시뮬레이터가 각기 다른 목적으로 개발되어 다수의 사용자가 사용하는 시뮬레이터는 많지 않다. 본 논문에서는 현재 개발된 시뮬레이터를 분석하고 이에 대한 특징을 분석하였다.
- 시뮬레이터는 실제 시퀀서에서 포함하는 기계적인 오류 및 인위적인 발생 변수들을 고려하여 리드를 생성하며, 이를 통해 매핑도구의 정확성 및 효율성을 얻고자 한다. 본 논문에서는 현재 차세대 유전자 서열 시퀀싱 기법의 특징을 분석하고, 이를 바탕으로 기존에 개발된 시뮬레이터들의 리드 생성 방식 및 특성을 분석하고자 한다. 이러한 분석결과는 추후에 개발할 시퀀싱 시뮬레이터의 개발 목표 설정에 활용하고자 한다.
- 시퀀서의 한계를 극복하기 위해, 참조 유전자 서열에서 임의의 리드를 생성해 주는 시뮬레이터가 개발되었다. 시뮬레이터는 실제 시퀀서에서 포함하는 기계적인 오류 및 인위적인 발생 변수들을 고려하여 리드를 생성하며, 이를 통해 매핑도구의 정확성 및 효율성을 얻고자 한다. 본 논문에서는 현재 차세대 유전자 서열 시퀀싱 기법의 특징을 분석하고, 이를 바탕으로 기존에 개발된 시뮬레이터들의 리드 생성 방식 및 특성을 분석하고자 한다.
- 또한 같은 시뮬레이터에서 동일한 변수에 대해 다른 출력을 나타낸다. 이러한 특징으로 인해 각각의 특징 파악하는데 초점을 맞추어 연구를 진행하였다.
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