선택한 단어 수는 입니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
선택한 단어 수는 30입니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
제안 방법
- 잘못된 파라미터 값으로 인해서 작업이 실패한 것과 현재 진행중인 작업들도 있기 때문에 그 중 작업이 성공적으로 끝난 파일만 추출했다. 그리고 로그파일을 읽어와서 정규식을 이용해 목표변수인 분자 에너지 값을 추출했다.
- 이는 한 번에 수십 개의 시뮬레이션을 돌릴 수 있게 해주는 자원으로 비교적 짧은 시간에 작업을 수행할 수 있었다. 그리고 전과 동일한 방법으로 작업 수행 결과를 받아와서 기존 데이터와 병합하였다. 그리고 다시 회귀분석을 진행하기에 앞서 설명변수 몇 개를 추가했다.
- 본 논문에서는 지금까지 uChem 솔버 사용자들의 시뮬레이션 결과 데이터를 추출, 분석하여 첫 번째로는 최종 분자 에너지 예측, 두 번째로는 작업 수행 시간 예측 모델을 적용해 보았다.
- 설명변수는 위와 동일하게 하여 전체 데이터를 8:2 비율로 train data와 test data로 나누었고, train data만으로 회귀분석을 진행하여 나온 선형 모델에 test data를 적용해 보았다. (그림 4)는 진행 결과 예측한 값이 실제 값과 얼마나 유사한지 알아보기 위해 plot을 찍어 가시화한 그림이다.
- 이 파일을 파이썬 프로그램에서 ase 라이브러리를 사용해 xyz 파일로 변환하였고, 간단한 코드를 작성해서 xyz 파일을 uChem 솔버에 맞는 입력 데이터 형태로 변환시켰다. 이 데이터를 시뮬레이션 돌리는데 앞서 말했듯이 하나하나 전부 작업을 수행하려면 상당히 오랜 시간이 걸리기 때문에 클러스터 컴퓨팅 자원을 이용했다. 이는 한 번에 수십 개의 시뮬레이션을 돌릴 수 있게 해주는 자원으로 비교적 짧은 시간에 작업을 수행할 수 있었다.
- POSCAR 파일이란 격자 정보와 이온들의 위치를 포함한 여러 화학정보를 담고잇는 파일로 많은 연구에 쓰이고 있다. 이 파일을 파이썬 프로그램에서 ase 라이브러리를 사용해 xyz 파일로 변환하였고, 간단한 코드를 작성해서 xyz 파일을 uChem 솔버에 맞는 입력 데이터 형태로 변환시켰다. 이 데이터를 시뮬레이션 돌리는데 앞서 말했듯이 하나하나 전부 작업을 수행하려면 상당히 오랜 시간이 걸리기 때문에 클러스터 컴퓨팅 자원을 이용했다.
데이터처리
- 그렇게 Y를 분자 에너지 값, X를 각 원소들의 개수와 총 원자 개수로 두어서 R 프로그램을 이용하여 간단한 회귀분석을 진행하였고 결과는 아래의 (그림 1)과 같이 어떠한 변수도 유의하지 않게 나왔다. 문제를 찾기 위해서 에너지 값의 분포를 Box Plot을 통해 살펴보았는데, 몇 개의 이상점이 존재한다는 것을 알 수 있었다.
- 5배 만큼보다 더 떨어진 값들을 이상점으로 판단하고 제거한 후의 Box Plot이다. 제거를 하고 나니 정상적인 box의 형태를 갖추었고 이를 바탕으로 다시 회귀분석을 진행 하였다.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.