초록 ▼

본 발명은 단백질의 리간드 결합부위를 예측하는 방법에 관한 것으로, 단백질 내 빈 공간들을 단백질의 잔기 원자들의 위치를 출발점으로 하여 단백질 표면과 같은 높이까지만 채우도록 모조원자들의 위치를 계산하고; 생성된 모조 원자들의 밀도를 바탕으로 하는 군집화를 통해 리간드 결합부위로 가능한 모조원자들의 클러스터를 도출하고; 모조원자 클러스터를 구성하는 모조 원자의 상호 작용하는 단백질 잔기들의 특성값과 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수의 통계값을 조합한 함수로 총점을 계산하고; 계산된 총점으로 순위를 매겨 단백질의 리간드 결합부위

본 발명은 단백질의 리간드 결합부위를 예측하는 방법에 관한 것으로, 단백질 내 빈 공간들을 단백질의 잔기 원자들의 위치를 출발점으로 하여 단백질 표면과 같은 높이까지만 채우도록 모조원자들의 위치를 계산하고; 생성된 모조 원자들의 밀도를 바탕으로 하는 군집화를 통해 리간드 결합부위로 가능한 모조원자들의 클러스터를 도출하고; 모조원자 클러스터를 구성하는 모조 원자의 상호 작용하는 단백질 잔기들의 특성값과 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수의 통계값을 조합한 함수로 총점을 계산하고; 계산된 총점으로 순위를 매겨 단백질의 리간드 결합부위를 예측하는 일련의 방법으로 구성되며, 기존의 단백질 리간드 결합 부위 예측 방법들에 비해 보다 정확하게 예측 할 수 있다.

대표청구항

(A) CPU에 의해 단백질 구조로부터 도출된 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수를 계산하여 단백질 표면의 같은 높이를 가지는 모조 원자들을 산출하는 단계;(B) CPU에 의해 상기 산출된 모조원자들을 군집화하여 모조원자 클러스터를 생성하는 단계;(C) CPU에 의해 모조원자 클러스터와 상호작용하는 잔기들의 특성값과 각각의 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자들의 수의 표준편차와 평균값의 조합으로 모조원자 클러스터의 총점을 계산하여 순위를 매기는 단계를 포함하는 단백질 리간드 결합부위 예측 방법

(A) CPU에 의해 단백질 구조로부터 도출된 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수를 계산하여 단백질 표면의 같은 높이를 가지는 모조 원자들을 산출하는 단계;(B) CPU에 의해 상기 산출된 모조원자들을 군집화하여 모조원자 클러스터를 생성하는 단계;(C) CPU에 의해 모조원자 클러스터와 상호작용하는 잔기들의 특성값과 각각의 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자들의 수의 표준편차와 평균값의 조합으로 모조원자 클러스터의 총점을 계산하여 순위를 매기는 단계를 포함하는 단백질 리간드 결합부위 예측 방법