초록 ▼

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1. 분석자 서문
다양한 게놈프로젝트 결과를 통해 우리는 그 어느 때보다도 풍부한 양의 단백질 서열 정보를 가지게 되었다. 그러나 단백질의 아미노산 서열 그 자체가 단백질에 대해서 말해줄 수 있는 정보는 매우 적으며, 구체적인 정보를 얻을 수 있는 단백질 구조는 시간과 비용, 기술적 어려움으로 인해 얻어내기가 매우 어렵다. 이에 비해 컴퓨터를 이용한 시뮬레이션 기법이나 계산 기법은 실제 실험에 비해서 시간적으로 신속하고 비용 면에서도 매우 저렴하다. 따라서 보다 효과적

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1. 분석자 서문
다양한 게놈프로젝트 결과를 통해 우리는 그 어느 때보다도 풍부한 양의 단백질 서열 정보를 가지게 되었다. 그러나 단백질의 아미노산 서열 그 자체가 단백질에 대해서 말해줄 수 있는 정보는 매우 적으며, 구체적인 정보를 얻을 수 있는 단백질 구조는 시간과 비용, 기술적 어려움으로 인해 얻어내기가 매우 어렵다. 이에 비해 컴퓨터를 이용한 시뮬레이션 기법이나 계산 기법은 실제 실험에 비해서 시간적으로 신속하고 비용 면에서도 매우 저렴하다. 따라서 보다 효과적이고 효율적인 서열분석기법을 통해서 단백질의 구조와 기능을 추정할 수 있다면 큰 도움이 될 것이다. 본 자료는 이러한 관점에서 최근까지 개발된 다양한 컴퓨터 기반의 구조 및 기능 예측 프로그램에 대해서 다루고 있다. 특히 구조분석의 대상이 유전체나 단백질체까지 확대된 현 상황을 고려하여 구조와 기능 예측의 대규모 분석의 필요성을 논하고 이를 위한 선결조건으로 완전 자동화된 분석기법의 필요성을 역설하고 있다.

2. 목차
분석자 서문
1. 서론
2. 단백질 구조 예측
2.1 CASP (The Critical Assessment of techniques for protein Structure Prediction)
2.2. Comparative modeling
2.3. Fold recognition
2.4. 단백질의 무정형성
2.5. 컨센서스 방법
2.6. 주형선별
2.7. 프로파일-프로파일 비교정렬
2.8. 서열정렬에 있어서 구조정보의 활용
2.9. 조합기법
2.10. 모델 품질 평가
3. 단백질 기능의 추정
3.1. 기능과 구조와의 상관관계
3.2. Gene ontology를 이용한 기능 분류
3.3. 구조비교기법
3.4. 구조로부터 얻을 수 있는 기능기술자(functional descriptor)
3.5. 기능 추정 기법에 대한 비판적 평가
4. 결론
5. 분석자 결론
Reference


3. 원문정보
Tosatto, S. C., Toppo, S., Large-scale Prediction of Protein Structure and Function from Sequence., Current pharmaceutical design, 2006년 6월

※ 이 자료의 분석은 연세대학교의 정진원님께서 수고해 주셨습니다.