초록 ▼

본 과제의 1 단계 연구 목표는 H. pylori에 의한 위십이지장 질환의 퇴치 수단을 마련하기 위하여 H. pylori 분리 균주간에 관찰되는 genomic diversity를 분석하고 이 다양성을 기초로 균주 판별 기준을 마련하는데 필요한 H. pylori의 유전체 염기서열 정보를 확보하는데 있다.
국내 최초의 게놈프로젝트 성공 사례로서 H. pylori 한국형 균주의 유전체 염기서열을 완전 해독하였다. 외국 2 균주 간에 보고된 유전적 차이보다 한국형 균주를 포함한 3 균주 간의 비 교에서 더 심한 유전적 차이가 확인되

본 과제의 1 단계 연구 목표는 H. pylori에 의한 위십이지장 질환의 퇴치 수단을 마련하기 위하여 H. pylori 분리 균주간에 관찰되는 genomic diversity를 분석하고 이 다양성을 기초로 균주 판별 기준을 마련하는데 필요한 H. pylori의 유전체 염기서열 정보를 확보하는데 있다.
국내 최초의 게놈프로젝트 성공 사례로서 H. pylori 한국형 균주의 유전체 염기서열을 완전 해독하였다. 외국 2 균주 간에 보고된 유전적 차이보다 한국형 균주를 포함한 3 균주 간의 비 교에서 더 심한 유전적 차이가 확인되었고 특히 유전체 재배열을 기준으로 볼 때 서구 균주와 한국 균주 간에 유전적 거리가 뚜렷하였다. H. pylori genomic diversity의 실체에 보다 접근하 기 위해 제2한국형 균주의 유전체 염기서열을 해독하였다.4 균주 간의 유전체 비교 분석이 진행 중이며 현재까지의 분석 결과로는 한국형 또는 아시아형 균주의 geographic segregation 이 명확하다.
이는 유전체 구조 해석 및 이용기술 개발을 토대로 H. pylori 감염을 극복할 연구 여건을 마련하기 위해서는 최소 10 균주 정도의 H. pylori 유전체 염기서열을 확보하고 상호 비교할 필요성이 있음을 국내외적으로 주지시키는 연구 결과이다. 이와 더불어 H. pylori functional genomics의 연구 기반을 마련하기 위해 이 세균의 프로테옴 분석 조건을 확립하고 프로테옴 카탈로그를 작성하였다.

Abstract ▼

Helicobacter pylori, one of the most common bacterial pathogens, is the main cause of gastritis, peptic ulcers and gastric cancers. The organism seems to be more genetically diverse than other bacterial pathogens, and the source of these differences awaits explanation. Microdiversity and macrodivers

Helicobacter pylori, one of the most common bacterial pathogens, is the main cause of gastritis, peptic ulcers and gastric cancers. The organism seems to be more genetically diverse than other bacterial pathogens, and the source of these differences awaits explanation. Microdiversity and macrodiversity of H. pylori genome cause difficulty in establishing the strain classification system that has been successfully applicable for other pathogenic bacterial species by serological, physiological, biochemical, and molecular biological parameters. We have suggested that the two complete H. pylori genomes already sequenced may be insufficient for a discriminatory tool for typing clinical isolates as well as for an insight into the genomic diversity, which could establish strategy for control of H. pylori infection.
Due to clinical and commercial importance as one of the most common human pathogen, H. pylori became the world's first organism, the complete genome sequence of which were determined for two strains: 26695 by the TIGR in 1997 and J99 by the Astra-Zeneca and Genome Therapeutic Corp. in 1999. The comparison of the two strains showed a difference in genomic organization in several discrete regions (macrodiversity) as well as considerable allelic diversity between the gene coding sequences microdiversity). Further, the comparison demonstrated that approximately 6-7% of the genes were specific to each strain, with almost half of these genes being clustered in a single hypervariable region (the plasticity zone). The genomic data from the two H. pylori strains gave rise to direct evidences on the genetic diversity, which has been previously expected with respect to the gene organization and nucleotide variability from strain to strain.

목차 Contents

• 표지...1
• 제출문...2
• 초록...3
• 요약문...4
• SUMMARY...13
• CONTENTS...20
• 목차...21
• 제1장 연구개발과제의 개요...22
• 제1절 연구개발의 목적 및 필요성...22
• 제2절 연구개발의 범위...28
• 제2장 국내외 기술개발 현황...29
• 제3장 연구개발수행 내용 및 결과...31
• 제1절 이론적. 실험적 접근방법...31
• 제2절 연구개발 수행 내용...32
• 제3절 연구개발 결과...48
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도...89
• 제1절 연도별 연구목표...89
• 제2절 평가착안점에 입각한 연구목표 달성도...89
• 제3절 관련분야의 기술발전에의 기여도...91
• 제5장 연구개발결과의 활용계획...92
• 제1절 추가연구의 필요성...92
• 제2절 타연구에의 응용...92
• 제3절 기업화 추진방안...93
• 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보...94
• 제7장 참고문헌...95
• 연구결과 활용계획서...99
• 기술 요약서...104