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자생식물 유전체 기능 연구를 위한 정보기지 구축 및 운용
Construction of Database and Utilization for Plant Functional Genomics 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 한국생명공학연구원
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology
연구책임자 최도일
참여연구자 이상협 , 이소영 , 성은수 , 백광현 , 조성환 , 구달회 , 수존사로바 , 윤준선 , 이정희 , 하영임 , 강희영 , 김영철 , 김수용 , 성은수 , 이상훈
보고서유형2단계보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2006-05
과제시작연도 2005
주관부처 과학기술부
사업 관리 기관 한국과학재단
Korea Science and Engineering Foundtion
등록번호 TRKO200600001950
과제고유번호 1350003176
사업명 21C프론티어연구개발사업
DB 구축일자 2015-01-08
키워드 식물유전정보.데이터베이스.생물정보.유전자발현 프로파일.plant bioinformatics.genome database.gene expression profile.

초록

자생식물 유전체 기능 연구를 위한 정보기지 구축 및 운용 과제를 수행하여 약용식물의 EST DB 구축, 식물유전정보 분석시스템, 고추유전자색인 데이터 베이스, 고추 유전자 발현 프로파일 데이터베이스, 가지과식물의 유전정보 데이터 베이스, 국제컨소시엄 토마토게놈프로젝트를위한 정보 분석 및 데이터베이스를 구축 하여 인터넷을 통하여 일반연구자에게 공개하고 있으며 2003년부터 2005년까지 세계 14개국에서 약 3백 25만회의 접속건수를 달성하여 생물정보 데이터 베이수로서의 위상을 확보하고 있음. 현재까지 약 130만건의 식물 EST,

Abstract

- construction of genome information database
- Design and construction of plant gene expression profiles
- Development of web interface for internet publication
- Construction of portal site DB for Solanaceae functional genomics
- Application services of plant bioinformatics for the pla

목차 Contents

  • 표지...1
  • 제출문...3
  • 보고서초록...4
  • 요약문...5
  • SUMMARY...7
  • CONTENTS...8
  • 목차...9
  • 제1장 약용식물 EST DB 구축...10
  • 1. MEDICINAL PLANTS EST ANALYSIS SYSTEM...11
  • 제2장 식물유전정보분석 시스템 구축...18
  • 1. Application Services - BLAST (plant, solanaceae)...19
  • 제3장 고추 유전자색인 데이터베이스 구축...24
  • 1. Overall Process...25
  • 2. Functional Annotation...28
  • 3. Functional Categorization...29
  • 4. Homologous Family Gene Analysis...34
  • 5. Tissue specific gene analysis...40
  • 6. Fruit development related gene analysis...45
  • 제4장 고추 유전자발현 프로파일 데이터베이스 구축...77
  • 1. Peper Microarray Database...78
  • 제5장 가지과식물 유전정보 DB구축...93
  • 1. Solanaceae family DB구축 및 웹 분석 프로그램 결과...94
  • 제6장 국제 가지과식물 게놈프로젝트 DB구축...114
  • 1. International SOL Project(Tomato Sequencing Project)...115
  • [첨부 1] 자생식물 유전체 정보기지이용현황...122
  • 1. Web Log Analysis (2003-2005)...123
  • 연구결과 활용계획서...128
  • [첨부2] 기술 요약서...133

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참고문헌 (25)

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