초록 ▼

I. 연구개발의 목적 및 필요성
메틸화된 DNA는 화학적으로 안정된 구조를 가지고 있어 mRNA비하여 보존성이 좋고, 또 단백질이나 mRNA와는 달리 세포내에서 메틸화 상태가 세포 분열 후에도 유지된다. 또, 비교적 간단한 실험 기구와 저비용으로 분석이 가능하므로 생물지표로서 매우 유용하게 사용될 수 있다.
II. 연구개발의 내용 및 범위
본 연구에서 간암 유발 독성물질에 의한 유전자의 발현과 메틸화의 관계를 분석하였고 이를 이용한 생물지표의 개발을 하였다. 간암을 유발하는 화학물질에 노출된 마우스의 간조직과 사람

I. 연구개발의 목적 및 필요성
메틸화된 DNA는 화학적으로 안정된 구조를 가지고 있어 mRNA비하여 보존성이 좋고, 또 단백질이나 mRNA와는 달리 세포내에서 메틸화 상태가 세포 분열 후에도 유지된다. 또, 비교적 간단한 실험 기구와 저비용으로 분석이 가능하므로 생물지표로서 매우 유용하게 사용될 수 있다.
II. 연구개발의 내용 및 범위
본 연구에서 간암 유발 독성물질에 의한 유전자의 발현과 메틸화의 관계를 분석하였고 이를 이용한 생물지표의 개발을 하였다. 간암을 유발하는 화학물질에 노출된 마우스의 간조직과 사람 세포주에서 발현이 변화된 유전자의 메틸화 상태를 분석하였으며 생물지표의 발굴을 목적으로 하였다.
사람에서 간암을 유발하는 것으로 보고되어 있는 화합물을 투여한 마우스와 사람 세포주에서 확보한 cDNA microarray를 통하여 얻은 데이터를 분석하였다. 확보된 데이터를 이용하여 메틸화와 관련된 유전자를 선별하였으며 발현의 변화에 따른 DNA 메틸화를 확인하였고, 이러한 변화에 의한 단백질의 변화가 있는지를 확인하였다.
III. 연구개발결과
마우스의 간 종양에서 공통적으로 CYP2A4, CYP2B9 mRNA의 발현이 증가하였고, CYP1A2, CYP7B1 mRNA의 발현이 감소하였다. 이들 유전자들을 생물지표 후보군으로 발굴하여, 메틸화를 분석한 결과 Cyp2a4, Cyp2b9 promoter부분의 메틸화의 감소를 확인하였고, Cypla2 promoter부분의 메틸화의 증가를 확인하였다.

Abstract ▼

This study shows the analysis on the relationship between hepatocarcinogen-induced gene expressions and DNA methylation. Moreover this research shows the development of biomarkers from the results. We aimed at the development of biomarkers from the analysis of the methylated status of alterated gene

This study shows the analysis on the relationship between hepatocarcinogen-induced gene expressions and DNA methylation. Moreover this research shows the development of biomarkers from the results. We aimed at the development of biomarkers from the analysis of the methylated status of alterated gene expressions in mouse liver tissues and human cell lines exposed to hepatocarcinogen.
We have analyzed the data collected from the cDNA microarrays of mice and human cell lines which were treated with chemicals reported as hepatocarcinogens in human. Genes involved in the methylation were selected from the data and we identified the methylation according to the change of gene expressions and studied the alteration of protein expressions related to these methylations.

목차 Contents

• 제출문...1
• 보고서 초록...2
• 요약문...3
• SUMMARY...4
• Contents...5
• 목차...6
• 표목차...7
• 그림목차...8
• 제1장. 연구개발과제의 개요...11
• 제1절. 연구개발의 목적과 필요성...11
• 제2절. 연구개발의 목표 및 내용...12
• 제2장. 국내외 기술개발 현황...13
• 제3장. 연구개발 수행 내용 및 결과...15
• 제1절. 연구내용...15
• 1. 연차별 연구 내용 및 범위...15
• 2. 연구내용...15
• 3. 본 연구에서 사용한 간암유발 독성물질...16
• 4. 독성물질 처리기법...20
• 5. cDNA Microarray...20
• 6. DEG discovery(Gene Fishing)...22
• 7. Proteomics...23
• 8. Bisulfite sequencing...25
• 제2절. 연구결과...25
• 1. 실험동물에서의 간암유발물질의 투여...25
• 2. Diethylnitrosamine에 의한 유전자 변화 분석...27
• 3. 비소에 의한 유전자의 변화 분석...45
• 4. HBx 형질전화 마우스 cDNA microarray 분석...52
• 5. 비소를 처리한 사람유래 세포주의 cDNA microarray 분석...59
• 6. 5-Azacitidine에 의한 종양관련 유전자의 발현 분석...65
• 7. DNA 메틸화 분석...70
• 제4장. 연구개발 목표 달성도 및 대외기여도...77
• 제1절. 연구개발 목표 달성도...77
• 제2절. 연구개발에 따른 대외기여도...78
• 제3절. 자문회의 개최...78
• 제5장. 연구개발결과의 활용계획...81
• 제6장. 참고문헌...83